| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP043523 | 1317022 = | 503 (0.960) | coding (113/684 nt) | FTN78_chr1339 | O‑methyltransferase family protein | |||||
Only 100 of 622 total aligned reads displayed.
AAAACTCAATTAAGGAGACAATACCTGTCACTCAAAATTTCTCAACTCTTCAATGCTAACCGAGGAATCTATGGTGCTCCTAAAATTCATCATCTTCTACTTAAACAAGGGGAAAAAGTCGGGTTAAAACTGGTACAGAAGCTAATGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP043523/1282001‑1281853‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCTTTTTCAACTAATTTTTCT > CP043523/1317022‑1317170 AAAACTCAATTAAGGAGACAATACCTGTCACTCAAAATTTCTCAACTCTTCAATGCTAACCGAGGAATCTATGGTGCTCCTAAAATTCATCATCTTCTACTTAAACAAGGGGAAAAAGTCGGGTTAAAACTGGTACAGAAGCTAATGAAG < 2:3788894/150‑1AAAACTCAATTAAGGAGACAATACCTGTCACTCAAAATTTCTCAACTCTTCAATGCTAACCGAGGAATCTATGGTGCTCCTAAAATTCATCATCTTCTACTTAAACAAGGGGAAAAAGTCGGGTTAAAACTGGTACAGAAGCTAATGAAG < 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1:1767423/150‑1 GAAGCTAATGAAGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCTTTTTCAA < 1:1152312/150‑1 AAGCTAATGAAGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGGCTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCTTTTTCAAC < 2:1900413/150‑1 AAGCTAATGAAGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCTTTTTCAAC > 1:1697142/1‑150 AGCTAATGAAGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCTTTTTCAACT < 1:2456823/150‑1 GCTAATGAAGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCTTTTTCAACTA > 1:1595702/1‑150 CTAATGAAGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCTTTTTCAACTAA > 2:2425367/1‑150 AATGAAGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGTACTCCTTTTTCAACTAATT > 2:782457/1‑150 ATGAAGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCTTTTTCAACTAATTT > 1:675435/1‑150 ATGAAGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCTTTTTCAACTAATTT < 2:4217681/150‑1 TGAAGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCTTTTTCAACTAATTTT < 2:233953/150‑1 AAAACTCAATTAAGGAGACAATACCTGTCACTCAAAATTTCTCAACTCTTCAATGCTAACCGAGGAATCTATGGTGCTCCTAAAATTCATCATCTTCTACTTAAACAAGGGGAAAAAGTCGGGTTAAAACTGGTACAGAAGCTAATGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP043523/1282001‑1281853‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCTTTTTCAACTAATTTTTCT > CP043523/1317022‑1317170 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |