| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | CP043523 | 1281853 = | NA (NA) | 622 (1.190) | 236/298 | 0.0 | 55.3% | coding (254/840 nt) | FTN78_chr1303 | Mobile element protein |
| ? | CP043523 | 1317022 = | 503 (0.960) | coding (113/684 nt) | FTN78_chr1339 | O‑methyltransferase family protein | |||||
Only 100 of 1136 total aligned reads displayed.
GAGCCATTATGAGAGCCGAAAAACCAATTGCTGTTCCGATTTCGAGAATTCTTTTTGGCTGCAACAAACTCAACAACATTTGAAAATAAATAACTGTCTCATGTGGGATAACTGGAATATTATTTTCTTTAGCAAATTTCAGTACTTCTGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCTTTTTCAACTAATTTTTCTA > CP043523/1316873‑1317171 | aaaactcaattaaggagacaatacctgtcactcaaaatttctcaactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaag > 2:2193352‑M2/150‑150 (MQ=255)aaaactcaattaaggagacaatacctgtcactcaaaatttctcaactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaacctaatgaag > 1:3699898‑M2/150‑150 (MQ=255) aattaaggagacaatacctgtcactcaaaatttctcaactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCAAGTtc > 1:3611353‑M2/143‑150 (MQ=255) aattaaggagacaatacctgtcactcaaaatttctcaactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCAAGTtc > 2:2910802‑M2/143‑150 (MQ=255) ttaaggagacaatacctgtcactcaaaatttctcaactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCAAGTtctc > 2:1504103‑M2/141‑150 (MQ=255) ttaaggagacaatacctgtcactcaaaatttctcaactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCAAGTtctc > 2:2579630‑M2/141‑150 (MQ=255) taaggagacaatacctgtcactcaaaatttctcaactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCAAGTTCTcc > 1:1861748‑M2/140‑150 (MQ=255) gCCGAAAAACCAATTGCTGTTCCGATTTCGAGAATTCTTTTTGGCTGCAACAAACTCAACAACATTTGAAAATAAATAACTGTCTCATGTGGGATAACTGGAATATTATTTTCTTTAGCAAATTTCAGTACTTCTGCAAGTTCTCCGGtt < 1:2824920/150‑1 (MQ=255) acaatacctgtcactcaaaatttctcaactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCAAGTTCTCCGGTTAtt > 1:1001375‑M2/133‑150 (MQ=255) aatacctgtcactcaaaatttctcaactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCAAGTTCTCCGGTTATTtg > 2:3553493‑M2/131‑150 (MQ=255) aCCAATTGCTGTTCCGATTTCGAGAATTCTTTTTGGCTGCAACAAACTCAACAACATTTGAAAATAAATAACTGTCTCATGTGGGATAACTGGAATATTATTTTCTTTAGCAAATTTCAGTACTTCTGCAAGTTCTCCGGTTATTTgtgt > 2:322758/1‑150 (MQ=255) ctgtcactcaaaatttctcaactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGttt > 1:4217681‑M2/126‑150 (MQ=255) ctgtcactcaaaatttctcaactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGttt < 1:1085589‑M2/25‑1 (MQ=255) cAATTGCTGTTCCGATTTCGAGAATTCTTTTTGGCTGCAACAAACTCAACAACATTTGAAAATAAATAACTGTCTCATGTGGGATAACTGGAATATTATTTTCTTTAGCAAATTTCAGTACTTCTGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGttt > 1:1461457/1‑150 (MQ=255) cAATTGCTGTTCCGATTTCGAGAATTCTTTTTGGCTGCAACAAACTCAACAACATTTGAAAATAAATAACTGTCTCATGTGGGATAACTGGAATATTATTTTCTTTAGCAAATTTCAGTACTTCTGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGttt < 1:2778749/150‑1 (MQ=255) aaTTGCTGTTCCGATTTCGAGAATTCTTTTTGGCTGCAACAAACTCAACAACATTTGAAAATAAATAACTGTCTCATGTGGGATAACTGGAATATTATTTTCTTTAGCAAATTTCAGTACTTCTGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTg > 1:4066234/1‑150 (MQ=255) tcactcaaaatttctcaactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGAc < 1:2427621‑M2/28‑1 (MQ=255) tGCTGTTCCGATTTCGAGAATTCTTTTTGGCTGCAACAAACTCAACAACATTTGAAAATAAATAACTGTCTCATGTGGGATAACTGGAATATTATTTTCTTTAGCAAATTTCAGTACTTCTGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACt < 1:2982679/150‑1 (MQ=255) 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ctggtacagaagctaatgaaGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTcc < 1:3553493‑M2/130‑1 (MQ=255) ggtacagaagctaatgaaGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCtt < 2:1199062‑M2/132‑1 (MQ=255) cAAATTTCAGTACTTCTGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCttt > 1:1761440/1‑150 (MQ=255) cAAATTTCAGTACTTCTGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCttt < 2:824630/150‑1 (MQ=255) tacagaagctaatgaaGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCtttt < 1:115636‑M2/134‑1 (MQ=255) aaaTTTCAGTAATTCTGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTTTACTAACTTTGCTTTGACAACTGGTTGATTCATCTTGGGGTTATTTGTTCGTTTATATGTTTTAATCATTTTTACAGTTGGACACTtttt > 2:1592124/1‑150 (MQ=255) gaagctaatgaaGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCTTTTTCaa < 1:765817‑M2/138‑1 (MQ=255) tCAGTACTTCTGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCTTTTTCAAc < 2:733068/150‑1 (MQ=255) aagctaatgaaGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCTTTTTCAAc > 1:1697142‑M2/12‑150 (MQ=255) agctaatgaaGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCTTTTTCAACt < 2:327931‑M2/140‑1 (MQ=255) ctaatgaaGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCTTTTTCAACTaa > 1:511165‑M2/9‑150 (MQ=255) taatgaaGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCTTTTTCAACTAAt > 1:3725379‑M2/8‑150 (MQ=255) cTTCTGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCTTTTTCAACTAAttt < 2:2812534/150‑1 (MQ=255) tgaaGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCTTTTTCAACTAAtttt < 2:1128230‑M2/146‑1 (MQ=255) cTGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCTTTTTCAACTAATTTTTc < 2:2071037/150‑1 (MQ=255) gCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCTTTTTCAACTAATTTTTCTa > 1:4568752/1‑150 (MQ=255) gCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCTTTTTCAACTAATTTTTCTa < 2:2983072/150‑1 (MQ=255) | GAGCCATTATGAGAGCCGAAAAACCAATTGCTGTTCCGATTTCGAGAATTCTTTTTGGCTGCAACAAACTCAACAACATTTGAAAATAAATAACTGTCTCATGTGGGATAACTGGAATATTATTTTCTTTAGCAAATTTCAGTACTTCTGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCTTTTTCAACTAATTTTTCTA > CP043523/1316873‑1317171 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |