| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP043523 | 1439166 = | 434 (0.830) | 476 (0.930) | 195/292 | 1.0 | 69.1% | intergenic (‑159/+44) | FTN78_chr1453/FTN78_chr1454 | tyrosine phosphatase/Oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide‑binding protein OppA |
| ? | CP043523 | 1860767 = | 0 (0.000) | intergenic (‑214/‑80) | FTN78_chr1907/FTN78_chr1908 | hypothetical protein/neutral endopeptidase | |||||
Only 100 of 496 total aligned reads displayed.
AACTACACCCCAGTTAACAAACGTGTGGTAGGGATGACGCTTGACTATGGTGCAATGAATACTTGGTCAGAAATTGGTGTTTCATCTGATAAGATGGCAACCAAATAGTTTTATTTAACTTTTGTTTACAAGTTTTTTTGTAAAAATACCCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP043523/1439317‑1439166‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCC > CP043523/1860767‑1860914 AACTACACCCCAGTTAACAAACGTGTGGTAGGGATGACGCTTGACTATGGTGCAATGAATACTTGGTCAGAAATTGGTGTTTCATCTGATAAGATGGCAACCAAATAGTTTTATTTAACTTTTGTTTACAAGTTTTTTTGTAAAAATACC > 1:2311437/1‑150AACTACACCCCAGTTAACAAACGTGTGGTAGGGATGACGCTTGACTATGGTGCAATGAATACTTGGTCAGAAATTGGTGTTTCATCTGATAAGATGGCAACCAAATAGTTTTATTTAACTTTTGTTTACAAGTTTTTTTGTAAAAATACC > 1:2000345/1‑150 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TACAAGTTTTTTTGTAAAAATACCCTCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGCTTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGA > 1:4029629/1‑150 TACAAGTTTTTTTGTAAAAATACCCTCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGA < 2:4190933/150‑1 ACACGTTTTTTTGTAAAAATACCCTCGCGTTAGTTTTCGCAATTCTATAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAATAAGGAGGTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAA < 2:1067727/150‑1 CAAGTTTTTTTGTAAAAATACCCTCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAAT > 1:1874352/1‑150 CAAGTTTTTTTGTAAAAATACCCTCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAAT > 1:3006865/1‑150 AAGTTTTTTTGTAAAAATACCCTCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATG > 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TTTGTAAAAATACCCTCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAA < 1:4434049/150‑1 TGTAAAAATACCCTCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAA > 1:2979686/1‑150 TGTAAAAATACCCTCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAA > 2:1457540/1‑150 TAAAAATACCCTCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATG < 1:1684183/150‑1 AAAAATACCCTCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGC < 1:487370/150‑1 AAAATACCCTCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCA > 1:2083383/1‑150 AAATACCCTCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAG < 2:1696585/150‑1 AAATACCCTCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAG < 1:3711230/150‑1 CCCTCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATT < 1:4533117/150‑1 CCCTCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATT > 2:919759/1‑150 AACTACACCCCAGTTAACAAACGTGTGGTAGGGATGACGCTTGACTATGGTGCAATGAATACTTGGTCAGAAATTGGTGTTTCATCTGATAAGATGGCAACCAAATAGTTTTATTTAACTTTTGTTTACAAGTTTTTTTGTAAAAATACCCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP043523/1439317‑1439166‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCC > CP043523/1860767‑1860914 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |