| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP043523 | 1439166 = | 434 (0.830) | 476 (0.930) | 195/292 | 1.0 | 69.1% | intergenic (‑159/+44) | FTN78_chr1453/FTN78_chr1454 | tyrosine phosphatase/Oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide‑binding protein OppA |
| ? | CP043523 | 1860767 = | 0 (0.000) | intergenic (‑214/‑80) | FTN78_chr1907/FTN78_chr1908 | hypothetical protein/neutral endopeptidase | |||||
Only 100 of 479 total aligned reads displayed.
AGCCCTTTTCTAGCCGAAGAATAAACTGATATTTTCTTGATTAAATAAATTATATCATAATATTGATTTGATGTCAAATAAAAAACATGTATACTTAAAATTAGTATTGCTAATACTAATTAGTGTTTAACCATAAAATATCCTCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTG > CP043523/1860623‑1860916 | gccggttaacaaacgtgtagttggaatgacgcttgattatggtgcaatggatacttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACttt < 1:4597756‑M2/6‑1 (MQ=255) ccggttaacaaacgtgtagttggaatgacgcttgattatggtgcaatggatacttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTa < 1:4248275‑M2/7‑1 (MQ=255) ccggttaacaaacgtgtagttggaatgacgcttgattatggtgcaatggatacttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTa < 1:1703120‑M2/7‑1 (MQ=255) cggttaacaaacgtgtagttggaatgacgcttgattatggtgcaatggatacttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAg < 2:1391283‑M2/8‑1 (MQ=255) ggttaacaaacgtgtagttggaatgacgcttgattatggtgcaatggatacttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGt > 1:4007035‑M2/142‑150 (MQ=255) ggttaacaaacgtgtagttggaatgacgcttgattatggtgcaatggatacttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGt < 2:200363‑M2/9‑1 (MQ=255) gttaacaaacgtgtagttggaatgacgcttgattatggtgcaatggatacttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGtt < 1:1850504‑M2/10‑1 (MQ=255) taacaaacgtgtagttggaatgacgcttgattatggtgcaatggatacttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGtttt < 2:2783001‑M2/12‑1 (MQ=255) 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cgtgtagttggaatgacgcttgattctggtgcaatggatacttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaactgttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAAtt < 2:3188300‑M2/19‑1 (MQ=255) gttggaatgacgcttgattatggtgcaatggatacttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAg < 1:1021113‑M2/25‑1 (MQ=255) tggaatgacgcttgattatggtgcaatggatacttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTc < 1:3387731‑M2/27‑1 (MQ=255) gaatgacgcttgattatggtgcaatggatacttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTcac < 1:3653599‑M2/29‑1 (MQ=255) aatgacgcttgattatggtgcaatggatacttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTcaca > 2:4297582‑M2/121‑150 (MQ=255) atgacgcttgattatggtgcaatggatacttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAg > 1:1940854‑M2/120‑150 (MQ=255) tgacgcttgattatggtgcaatggatacttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGa > 2:2912151‑M2/119‑150 (MQ=255) acgcttgattatggtgcaatggatacttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAg < 2:1714090‑M2/34‑1 (MQ=255) gcttgattatggtgcaatggatacttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGtt < 2:3319663‑M2/36‑1 (MQ=255) ttatggtgcaatggatacttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAAtt < 2:1204511‑M2/42‑1 (MQ=255) atggtgcaatggatacttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttttatttttaccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTa > 2:3272263‑M2/107‑150 (MQ=255) gtgcaatggatacttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGa > 1:829832‑M2/104‑150 (MQ=255) tgcaatggatacttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGAt < 1:3318918‑M2/48‑1 (MQ=255) ngcaatggatacttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGAt > 2:1078138‑M2/103‑150 (MQ=255) gcaatggatactttgtcagaaattggtgtttcttctgctaagttgtccaccaaatatttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGAtt < 2:2605955‑M2/49‑1 (MQ=255) caatggatacttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGAttt < 2:3431271‑M2/50‑1 (MQ=255) aatggatacttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTg < 2:764096‑M2/51‑1 (MQ=255) atggatacttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGa < 1:704825‑M2/52‑1 (MQ=255) ggatacttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGc < 2:3908201‑M2/54‑1 (MQ=255) gatacttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAACTTCAAATTTATGGTTTGAGct > 1:3859213‑M2/96‑150 (MQ=255) tacttggtcagaaattggtgtttcttctgctgagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGcttc > 2:3977930‑M2/94‑150 (MQ=255) tacttggacagaaattggtgtttcttctgctaaggtggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCATATTTATGATTTGAGcatc < 2:2478890‑M2/57‑1 (MQ=255) acttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGcttct < 2:1906689‑M2/58‑1 (MQ=255) acttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGcttct > 2:1778550‑M2/93‑150 (MQ=255) acttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGcttct > 2:3362938‑M2/93‑150 (MQ=255) cttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGcttctt < 1:623484‑M2/59‑1 (MQ=255) cttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGcttctt < 1:3075075‑M2/59‑1 (MQ=255) ttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCttt < 2:3246013‑M2/60‑1 (MQ=255) ttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCttt > 1:2312673‑M2/91‑150 (MQ=255) ttggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCttt < 2:2733155‑M2/60‑1 (MQ=255) ggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAGATTTATGATTTGAGCTTCTTtta < 1:4027047‑M2/62‑1 (MQ=255) ggtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTtta > 2:147503‑M2/89‑150 (MQ=255) gtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTttat < 2:2027445‑M2/63‑1 (MQ=255) gtcagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTttat < 1:3554509‑M2/63‑1 (MQ=255) cagaaattggtgtttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTttatta > 2:3687588‑M2/86‑150 (MQ=255) 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ttcttctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTg < 1:326532‑M2/78‑1 (MQ=255) tctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGatat > 1:313633‑M2/69‑150 (MQ=255) ctgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATg > 2:3765286‑M2/68‑150 (MQ=255) tgctaagttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGa > 1:4273987‑M2/67‑150 (MQ=255) gttggccaccaaatagttttacttaacttttgtttacaagtttttttgtaaaaataccctCACTTTAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTACTATTAATAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGa < 2:3616621‑M2/90‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |