| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP043523 | 1897161 = | 0 (0.000) | intergenic (‑295/+481) | FTN78_chr1945/FTN78_chr1946 | hypothetical protein/Collagen adhesion protein | |||||
Only 100 of 629 total aligned reads displayed.
CAATCAACCCAATGCCAAAGACTTCTAGTTCTTGAAAATAGGTTTAAAAAGTTGTATCATAATAAAAGTGGGTAACCACTTTCATTTTGTGCCGAGTTAGCTCAGTCGGTAGAGCACTTCACTCGTAACGAAGGGGTCACAGGTTCGATTCCTGCACTCGGCATAGATAAAAAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP043523/1823703‑1823877‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCTTTTAATTATATTTTTATTAGCATTGATGTATCTTTATGCCCATTAACTTTGCCACTACTTTATTATCGATACCTTAACTTAGTAGTACACTATCACAAGTTTA > CP043523/1897161‑1897309 CAATCAACCCAATGCCAAAGACTTCTAGTTCTTGAAAATAGGTTTAAAAAGTTGTATCATAATAAAAGTGGGTAACCACTTTCATTTTGTGCCGAGTTAGCTCAGTCGGTAGAGCACTTCACTCGTAACGAAGGGGTCACAGGTTCGATT > 2:3272807/1‑150 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1:4038108/150‑1 CCTGCACTCGGCATAGATAAAAAACCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCTTTTAATTATATTTTTATTAGCATTGATGTATCTTTATGCCCATTAACTTTGCCACTACTTTATTATCGATACCTTAACT < 2:2661410/150‑1 CTGCACTCGGCATAGATAAAAAACCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCTTTTAATTATATTTTTATTAGCATTGATGTATCTTTATGCCCATTAACTTTGCCACTACTTTATTATCGATACCTTAACTT < 1:856028/150‑1 GCACTCGGCATAGATAAAAAACCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCTTTTAATTATATTTTTATTAGCATTGATGTATCTTTATGCCCATTAACTTTGCCACTACTTTATTATCGATACCTTAACTTAG < 1:2281160/150‑1 GGCATAGATAAAAAACCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCTTTTAATTATATTTTTATTAGCATTGATGTATCTTTATGCCCATTAACTTTGCCACTACTTTATTATCGATACCTTAACTTAGTCGTAC > 1:3493676/1‑150 ATAGATAAAAAACCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCTTTTAATTATATTTTTATTAGCATTGATGTATCTTTATGCCCATTAACTTTGCCACTACTTTATTATCGATACCTTAACTTAGTAGTACACT < 2:4283472/150‑1 CAATCAACCCAATGCCAAAGACTTCTAGTTCTTGAAAATAGGTTTAAAAAGTTGTATCATAATAAAAGTGGGTAACCACTTTCATTTTGTGCCGAGTTAGCTCAGTCGGTAGAGCACTTCACTCGTAACGAAGGGGTCACAGGTTCGATTCCTGCACTCGGCATAGATAAAAAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP043523/1823703‑1823877‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCTTTTAATTATATTTTTATTAGCATTGATGTATCTTTATGCCCATTAACTTTGCCACTACTTTATTATCGATACCTTAACTTAGTAGTACACTATCACAAGTTTA > CP043523/1897161‑1897309 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |