New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP043523 | = 1823877 | 1 (0.000) | 467 (1.080) | 195/246 | 0.0 | 99.9% | intergenic (+12/+1047) | FTN78_chr1865/FTN78_chr1866 | tRNA‑Thr/hypothetical protein |
? | CP043523 | 1897161 = | 0 (0.000) | intergenic (‑295/+481) | FTN78_chr1945/FTN78_chr1946 | hypothetical protein/Collagen adhesion protein |
Only 100 of 538 total aligned reads displayed.
ACTCTTAACTTGAAATGCCCCCAATTTGCCCCATTTTATTTTTCACTTTAAGAGCTTTTCTATAGTGAACACTTTGAGAGCTTTATAGAGCCTGTATTTAACTTTGAAAACTATCTAAACAATCCTGCACTCGGCATAGATAAAAAACCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCTTTTAATTATATTTTTATTAGCATTGATGTATCTTTATGCCCATTAACTTTGCCACTACTTTATTATCGATACCTTAACTTAGTAGTACACTATCACAAGTTTAT > CP043523/1897013‑1897310 | gttcttgaaaataggtttaaaaagttgtatcataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCt > 1:4233568‑M2/149‑150 (MQ=255) tcttgaaaataggtttaaaaagttgtatcataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTg > 2:1443430‑M2/147‑150 (MQ=255) gaaaataggtttaaaaagttgtatcataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATc < 1:1976651‑M2/8‑1 (MQ=255) 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gtttaaaaagttgtatcataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGatat > 1:538922‑M2/135‑150 (MQ=255) gtttaaaaagttgtatcataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGatat < 1:3056168‑M2/16‑1 (MQ=255) ttaaaaagttgtatcataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATAc < 1:805271‑M2/18‑1 (MQ=255) aaaagttgtatcataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAg > 1:1587748‑M2/130‑150 (MQ=255) aaagttgtatcataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAgg < 2:3767440‑M2/22‑1 (MQ=255) aaagttgtatcataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactaggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAagn < 2:4504413‑M2/22‑2 (MQ=255) aagttgtatcataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGt < 1:2219910‑M2/23‑1 (MQ=255) agttgtatcataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGtt < 1:4582049‑M2/24‑1 (MQ=255) gttgtatcataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGttt < 2:1177964‑M2/25‑1 (MQ=255) gtatcataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGtttttt < 2:1998684‑M2/28‑1 (MQ=255) tatcataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTtta > 2:3893339‑M2/122‑150 (MQ=255) cataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTttatta < 2:1009706‑M2/32‑1 (MQ=255) cataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTttatta > 1:4444208‑M2/119‑150 (MQ=255) cataataaaagtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaagggggcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTttatta > 1:4416291‑M2/119‑150 (MQ=255) aataaaagtgggtaaccacttacattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcagtcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggaatagacagaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTAttt > 2:4448174‑M2/116‑150 (MQ=255) 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agtgggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCat < 2:2312544‑M2/41‑1 (MQ=255) ggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTc > 2:713906‑M2/106‑150 (MQ=255) ggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTc < 2:313875‑M2/45‑1 (MQ=255) ggtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTc > 2:890370‑M2/106‑150 (MQ=255) gtaaccactttcattttgtgccgagttagctcagtcggtagagcacttcactcgtaacgaaggggtcacaggttcgattcctgcactcggcatagataaaaaacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCt < 2:2542528‑M2/46‑1 (MQ=255) 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aacCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCTTTTAATTATATTTTTATTAGCATTGATGTATCTTTATGCCCATTAACTTTGCCACTACTTTATTATCGATACCTTAACTTAGTAGTACACTATCACAAGtt > 2:3503363‑M2/4‑150 (MQ=255) acCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCTTTTAATTATATTTTTATTAGCATTGATGTATCTTTATGCCCATTAACTTTGCCACTACTTTATTATCGATACCTTAACTTAGTAGTACACTATCACAAGttt > 1:48925‑M2/3‑150 (MQ=255) | ACTCTTAACTTGAAATGCCCCCAATTTGCCCCATTTTATTTTTCACTTTAAGAGCTTTTCTATAGTGAACACTTTGAGAGCTTTATAGAGCCTGTATTTAACTTTGAAAACTATCTAAACAATCCTGCACTCGGCATAGATAAAAAACCTTGTATCGTTGATATACAAGGTTTTTTATTATTTTATCATATTCTTTTAATTATATTTTTATTAGCATTGATGTATCTTTATGCCCATTAACTTTGCCACTACTTTATTATCGATACCTTAACTTAGTAGTACACTATCACAAGTTTAT > CP043523/1897013‑1897310 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |