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GGCAAACCTTTGTCTGATGTTGAATTTGGCTTAGTGATGCAAGAAGTTCAAAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCAAGTGATTTTTGATGAGCTCCCTCATGGACTAGCGAGCAAAAGAATTATTGATTTAGCCTTGCTTATTAACGGAATCCCAGTAGCGCATAT > CP043523/249114‑249412 | ggCAAACCTTTGTCTGATGTTGAATTTGGCTTAGTGATTCAAGAAGTTCAGAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGGGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTa > 1:2762821/1‑150 (MQ=255)ggCAAACCTTTGTCTGATGTTGAATTTGGCTTAGTGATTCAAGAAGTTCAGAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGGGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTa < 1:2034727/150‑1 (MQ=255)ggCAAACCTTTGTCTGATGTTGAATTTGGCTTAGTGATGCAAGAAGTTCAAAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTa > 2:581680/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |