| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP043523 | = 249263 | 512 (0.980) | 565 (1.080) | 222/298 | 0.2 | 68.8% | coding (300/2988 nt) | FTN78_chr0307 | Type I restriction‑modification system, restriction subunit R |
| ? | CP043523 | = 1884018 | 1 (0.000) | intergenic (+64/‑301) | FTN78_chr1929/FTN78_chr1930 | Transposase TnpA/Putative UV‑damage repair protein UvrX | |||||
Only 100 of 650 total aligned reads displayed.
TTCAACTCTCTTGCTTTGAATACATCGAACAATTTTATAACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTAGTCCACCTAGGATTAAATTAAAAAAAGGAACACCGATATTTTCAACTTTTTTAAAACCAAATCTGATAACTTTATTGAAATGAACCAAGCCAAAGCCTGTCCTGTAAAAGACATTTGATTCATTCTCTGATAGGCTCGCCTTAAGTATTTATCC > CP043523/1883869‑1884167 | tCAACTCTCTTGCTTTGAATACATCTAACAATTTTATAACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAAGGGTTTAACTCCAAATCAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATATCTAATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTAGTCCaa > 2:2984970/1‑149 (MQ=255) tCAACTCTCTTGCTTTGAATACATCGAACAATTTTATAACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAt > 1:3381273‑M2/1‑149 (MQ=255) tCAACTCTCTTGCTTTGAATACATCGAACAATTTTATAACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAt < 1:2877563‑M2/150‑2 (MQ=255) tCAACTCTCTTGCTTTGAATACATCGAACAATTTTATAACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAt < 2:3320709‑M2/150‑2 (MQ=255) cAACTCTCTTGCTTTGAATACATCGAACAATTTTATAACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAAGGGTTTAACTCCAAATCAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTAGTCCaaa < 2:1633074/150‑3 (MQ=255) cAACTCTCTTGCTTTGAATACATCGAACAATTTTATAACAATTATAATCCTCATTACGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCaga < 1:44046/150‑3 (MQ=255) aaCTCTCTTGCTTTGAATACATCGAACAATTTTATAACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtac < 1:3965931‑M2/150‑4 (MQ=255) aaCTCTCTTGCTTTGAATACATCGAACAATTTTATAACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAAGGGTTTAACTCCAAATCAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTAGTCCaaat > 1:1307141/1‑147 (MQ=255) aaCTCTCTTGCTTTGAATACATCGAACAATTTTATAACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAAGGGTTTAACTCCAAATCAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTAGTCCaaat < 2:3554688/150‑4 (MQ=255) aaCTCTCTTGCTTTGAATACATCGAACAATTTTATAACAATTATAATCCTCATTACGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCagaa > 2:4424510/1‑147 (MQ=255) nctctctTGCTTTGAATACATCGAACAATTTTATAACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAAGGGTTTAACTCCAAATCAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTAGTCCaaata > 1:720358/2‑146 (MQ=255) ctctctTGCTTTGAATACATCGAACAATTTTATAACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAAGGGTTTAACTCCAAATCAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTAGTCCaaatat < 2:384353/150‑6 (MQ=255) tctctTGCTTTGAATACATCGAACAATTTTATAACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttc > 2:745939‑M2/1‑144 (MQ=255) ctctTGCTTTGAATACATCGAACAATTTTATAACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttct > 2:1570176‑M2/1‑143 (MQ=255) ttGCTTTGAATACATCGAACAATTTTATAACTATTATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaag < 2:3953367‑M2/150‑11 (MQ=255) ttGCTTTGAATACATCGAACAATTTTATAACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaag > 2:2237451‑M2/1‑140 (MQ=255) ttGAATACATCGAACAATTTTATAACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttaga > 2:3043081‑M2/1‑135 (MQ=255) ttGAATACATCGAACAATTTTATAACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttaga > 2:282248‑M2/1‑135 (MQ=255) ttGAATACATCGAACAATTTTATAACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttaga > 2:2348395‑M2/1‑135 (MQ=255) ttGAATACATCGAACAATTTTATAACAATTAGAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGATAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttaga > 2:4342660‑M2/1‑135 (MQ=255) aTACATCGAACAATTTTATAACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccg > 2:4296539‑M2/1‑131 (MQ=255) aTACATCGAACAATTTTATAACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccg > 2:1689202‑M2/1‑131 (MQ=255) aCATCGAACAATTTTATAACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtc < 2:1497383‑M2/150‑22 (MQ=255) cATCGAACAATTTTATAACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtca > 1:2318727‑M2/1‑128 (MQ=255) aTCGAACAATTTTATAACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcat < 1:1444078‑M2/150‑24 (MQ=255) aTCGAACAATTTTATAACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcat < 2:511402‑M2/150‑24 (MQ=255) tCGAACAATTT‑ATAACAATCATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtccttctaagttagagccgtcatct > 2:560329‑M2/1‑125 (MQ=255) cGAACAATTTTATAACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatct < 2:1962233‑M2/150‑26 (MQ=255) cAATTTTATAACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtg > 2:2685417‑M2/1‑121 (MQ=255) aaTTTTATAACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgt < 1:183972‑M2/150‑31 (MQ=255) ttttATAACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACCATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgtta > 1:630127‑M2/1‑118 (MQ=255) tttATAACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttat < 1:1182090‑M2/150‑34 (MQ=255) tttATAACAATTATAAGCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttat > 1:2259760‑M2/1‑117 (MQ=255) ttATAACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttata < 2:2859891‑M2/150‑35 (MQ=255) taACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttatagga > 2:3740908‑M2/1‑113 (MQ=255) aCAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaat < 2:10989‑M2/150‑40 (MQ=255) aCAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaat > 1:4471792‑M2/1‑111 (MQ=255) aaTTATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatag < 2:2035077‑M2/150‑42 (MQ=255) aaTTATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatag < 1:3801202‑M2/150‑42 (MQ=255) aTTATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaataga > 2:2154060‑M2/1‑108 (MQ=255) tataATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagc < 1:432543‑M2/150‑45 (MQ=255) ataATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagcc > 1:1342288‑M2/1‑105 (MQ=255) taATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccg < 1:1153905‑M2/150‑47 (MQ=255) aTCCTCAGTCCGGCAACAATGGTTTAACTCCATAGTAGAAAGAGGAAAATTATTTTAAGAAGATAGAGCTCAATTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgac > 2:4117688‑M2/1‑102 (MQ=255) tCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgaca < 2:4502285‑M2/150‑50 (MQ=255) tCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgaca > 1:1930646‑M2/1‑101 (MQ=255) tCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGACCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagcagaca < 1:3471890‑M2/150‑50 (MQ=255) cTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacacc < 1:867947‑M2/150‑52 (MQ=255) tCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccc > 1:4518378‑M2/1‑98 (MQ=255) cATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacacccc > 2:1239497‑M2/1‑97 (MQ=255) cATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacacccc < 1:3507225‑M2/150‑54 (MQ=255) ttCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccct > 2:3244469‑M2/1‑95 (MQ=255) tcaagtaacaatggtttAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctg < 2:1747648‑M2/144‑57 (MQ=255) gCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgccc < 1:1492337‑M2/150‑60 (MQ=255) caacaaTGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccct < 2:617191‑M2/150‑62 (MQ=255) caacaaTGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccct < 1:1781697‑M2/150‑62 (MQ=255) caaTGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctacc < 2:3461863‑M2/150‑65 (MQ=255) caaTGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctacc > 2:480004‑M2/1‑86 (MQ=255) tttAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaa > 2:3141780‑M2/1‑80 (MQ=255) ttAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaa < 2:3357218‑M2/150‑72 (MQ=255) tAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaag < 2:1368693‑M2/150‑73 (MQ=255) cTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttg < 1:2435085‑M2/150‑76 (MQ=255) ccAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgag > 1:3311153‑M2/1‑73 (MQ=255) cAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagc < 1:3911715‑M2/150‑79 (MQ=255) aaaTTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagca > 1:4201706‑M2/1‑71 (MQ=255) aaTTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcat < 1:3241328‑M2/150‑81 (MQ=255) aTTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatc > 2:1050513‑M2/1‑69 (MQ=255) ttAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatca < 1:2077475‑M2/150‑83 (MQ=255) aagaaAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatcataaggcgt < 2:4255880‑M2/150‑91 (MQ=255) gaaAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatcataaggcgttt < 1:4043030‑M2/150‑93 (MQ=255) attattTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatcataaggcgttttaat < 1:4084919‑M2/150‑97 (MQ=255) tattTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatcataaggcgttttaatcc < 1:3568538‑M2/150‑99 (MQ=255) tAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatcataaggcgttttaatcctctga < 1:1562296‑M2/150‑104 (MQ=255) aGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatcataaggcgttttaatcctctgaac < 1:2632016‑M2/150‑106 (MQ=255) aaaaTATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatcataaggcgttttaatcctctgaactt < 2:2441562‑M2/150‑108 (MQ=255) aaaaTATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatcataaggcgttttaatcctctgaactt > 2:2008593‑M2/1‑43 (MQ=255) ataGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatcataaggcgttttaatcctctgaacttcttga > 2:1848975‑M2/1‑38 (MQ=255) taGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatcataaggcgttttaatcctctgaacttcttgaa < 1:3653987‑M2/150‑114 (MQ=255) gCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatcataaggcgttttaatcctctgaacttcttgaatc < 1:3111348‑M2/150‑116 (MQ=255) cTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatcataaggcgttttaatcctctgaacttcttgaatca > 2:40588‑M2/1‑34 (MQ=255) cTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatcataaggcgttttaatcctctgaacttcttgaatca > 1:3099832‑M2/1‑34 (MQ=255) cATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatcataaggcgttttaatcctctgaacttcttgaatcact < 1:2136702‑M2/150‑119 (MQ=255) cATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatcataaggcgttttaatcctctgaacttcttgaatcact < 1:1032884‑M2/150‑119 (MQ=255) aTTTTGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatcataaggcgttttaatcctctgaacttcttgaatcacta < 1:511687‑M2/150‑120 (MQ=255) ttttGTGTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatcataaggcgttttaatcctctgaacttcttgaatcactaa > 2:2758813‑M2/1‑30 (MQ=255) tgtgTCTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatcataaggcgttttaatcctctgaacttcttgaatcactaagcc < 2:2083924‑M2/150‑124 (MQ=255) ntcTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagacgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccataccaataaaagttgagcatcataaggcgttttaatcctctgaacttcttgaatcactaagccaaa < 2:4011258‑M2/149‑127 (MQ=255) cTAAATATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatcataaggcgttttaatcctctgaacttcttgaatcactaagccaaatt > 1:204614‑M2/1‑22 (MQ=255) aaaTATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatcataaggcgttttaatcctctgaacttcttgaatcactaagccaaattca > 1:2679393‑M2/1‑20 (MQ=255) aaaTATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatcataaggcgttttaatcctctgaacttcttgaatcactaagccaaattca < 1:3011255‑M2/150‑131 (MQ=255) aaTATTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatcataaggcgttttaatcctctgaacttcttgaatcactaagccaaattcaa < 1:3755695‑M2/150‑132 (MQ=255) atatTTGACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatcataaggcgttttaatcctctgaacttcttgaatcactaagccaaattcaac > 1:2157881‑M2/1‑18 (MQ=255) gACATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatcataaggcgttttaatcctctgaacttcttgaatcactaagccaaattcaacatcaga > 1:10989‑M2/1‑12 (MQ=255) aCATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatcataaggcgttttaatcctctgaacttcttgaatcactaagccaaattcaacatcagac > 2:2937393‑M2/1‑11 (MQ=255) cATTGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatcataaggcgttttaatcctctgaacttcttgaatcactaagccaaattcaacatcagaca < 2:1895431‑M2/150‑141 (MQ=255) ttGGTCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatcataaggcgttttaatcctctgaacttcttgaatcactaagccaaattcaacatcagacaaa < 2:950538‑M2/150‑143 (MQ=255) tCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatcataaggcgttttaatcctctgaacttcttgaatcactaagccaaattcaacatcagacaaaggtt < 1:934880‑M2/150‑147 (MQ=255) tCCAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatcataaggcgttttaatcctctgaacttcttgaatcactaagccaaattcaacatcagacaaaggtt < 1:2501000‑M2/150‑147 (MQ=255) ccAtacttctaagttagagccgtcatctcgtgttataggaatagagccgacaccccctgcccctaccaataaaagttgagcatcataaggcgttttaatcctctgaacttcttgaatcactaagccaaattcaacatcagacaaaggttt > 2:2578104‑M2/1‑3 (MQ=255) aaCCTAAGATTAAATT‑AAAAAAGGAACACCAATATTTTCAATTTTTTTAAAACCAAATCTGATAACCTTATTGAAAGGAACCAAGCCAACGCCTGTCCTCCAAAAGACATTTGATTCATTCTTTGATAGGCTCGCCTTAAGTATTTATcc < 2:859429/149‑1 (MQ=255) | TTCAACTCTCTTGCTTTGAATACATCGAACAATTTTATAACAATTATAATCCTCATTCCGCCAACAATGGTTTAACTCCAAATTAGAAAGAAGAAAATTATTTTAAGAAAATATAGCTCATTTTGTGTCTAAATATTTGACATTAGTCCACCTAGGATTAAATTAAAAAAAGGAACACCGATATTTTCAACTTTTTTAAAACCAAATCTGATAACTTTATTGAAATGAACCAAGCCAAAGCCTGTCCTGTAAAAGACATTTGATTCATTCTCTGATAGGCTCGCCTTAAGTATTTATCC > CP043523/1883869‑1884167 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |