| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP043523 | 1704695 = | 573 (1.090) | intergenic (+47/+62) | FTN78_chr1737/FTN78_chr1738 | hypothetical protein/Ribonucleotide reductase of class III (anaerobic), activating protein | |||||
Only 100 of 1168 total aligned reads displayed.
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tttGTCAGTGCTTATTTTTtcagaagatagccgttggcactttagcgcttacggatatactcaaatgtccatcagtaacttttaaattaatttttctttatgaatttgttcaaaagttttttcaccatcattgagtttttcccaaatgac < 1:3459012‑M1/150‑132 (MQ=255) tGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGTTTTTTCACCATCATTGAGt > 2:1435526/1‑150 (MQ=255) gTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGTTTTTTCACCATCATTGAGtt < 1:1113018/150‑1 (MQ=255) aGTGCTTATTTTTtcagaagatagccgttggcactttagcgcttacggatatactcaaatgtccatcagtaacttttaaattaatttttctttatgaatttgttcaaaagttttttcaccatcattgagtttttcccaaatgacaacttg < 2:3046545‑M1/150‑138 (MQ=255) aGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGTTTTTTCACCATCATTGAGttttt > 1:3950428/1‑150 (MQ=255) 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ttttatcagaagatagccgttggcactttagcgcttacggatatactcaaatgtccatcagtaacttttagattaatttttctttatgaatttgttcaaaagttttttcaccatcattgagttttgcccaaatgacaactcgtccttgtt < 2:3831923‑M1/150‑146 (MQ=255) ttttcagaagatagccgttggcactttagcgcttacggatatactcaaatgtccatcagtaacttttaaattaatttttctttatgaatttgttcaaaagttttttcaccatcattgagtttttcccaaatgacaacttgtccttgtttt < 1:3363224‑M1/150‑148 (MQ=255) | AGCAAAGAAAGTCAAAATTATTTAAAAGGAAAAAAGAAACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGTTTTTTCACCATCATTGAGTTTTTCCCAAATGACAA > CP043523/1704529‑1704827 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |