| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP043523 | = 1704678 | 554 (1.060) | 602 (1.150) | 239/298 | 0.0 | 51.6% | intergenic (+30/+79) | FTN78_chr1737/FTN78_chr1738 | hypothetical protein/Ribonucleotide reductase of class III (anaerobic), activating protein |
| ? | CP043523 | 1704695 = | 573 (1.090) | intergenic (+47/+62) | FTN78_chr1737/FTN78_chr1738 | hypothetical protein/Ribonucleotide reductase of class III (anaerobic), activating protein | |||||
Only 100 of 1183 total aligned reads displayed.
TTATTTAAAAGGAAAAAAGAAACATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGTTTTTTCACCATCATTGAGTTTTTCCCAAATGACAACTTGTCCTTGTTTTCGA > CP043523/1704546‑1704844 | caaagaaagtcaaaattatttaaaaggaaaaaagagacatctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTc > 1:3486986‑M2/149‑150 (MQ=255) agaaagtcaaaattatttaaaaggaaaaaagagacatctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCaga > 1:4430621‑M2/146‑150 (MQ=255) aagtcaaaattatttaaaaggaaaaaagagacatctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCagaaga > 1:238029‑M2/143‑150 (MQ=255) agtcaaaattatttaaaaggaaaaaagagacatctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGAt < 1:983214‑M2/9‑1 (MQ=255) gtcaaaattatttaaaaggaaaaaagagacatctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATa < 2:2680994‑M2/10‑1 (MQ=255) aaaattatttaaaaggaaaaaagagacatctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGcc < 2:1811299‑M2/13‑1 (MQ=255) aaaattatttaaaaggaaaaaagagacatctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGcc > 2:2951193‑M2/138‑150 (MQ=255) aaattatttaaaaggaaaaaagagacatctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCg < 1:1000565‑M2/14‑1 (MQ=255) aaattatttaaaaggaaaaaagagacatctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCg > 1:3136112‑M2/137‑150 (MQ=255) aattatttaaaaggaaaaaagagacatcgccctctaaaatcggggctaaaagatttcgaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGt > 2:3870838‑M2/136‑150 (MQ=255) tatttaaaaggaaaaaagagacatctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTgg > 2:1668671‑M2/133‑150 (MQ=255) atttaaaaggaaaaaagaggcatctccctctaaaatcggcactaaaagatgtcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGc > 2:563990‑M2/132‑150 (MQ=255) ttaaaaggaaaaaagagacatctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCAc < 2:3003882‑M2/21‑1 (MQ=255) cATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACtt < 2:3055069/150‑1 (MQ=255) cATCTCCCTCTAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACtt > 2:4057583/1‑150 (MQ=255) aaaaggaaaaaagagacatctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACtt > 1:4125431‑M2/128‑150 (MQ=255) aggaaaaaagagacatctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAg > 2:1391153‑M2/125‑150 (MQ=255) aggaaaaaagagacatctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAg > 2:684627‑M2/125‑150 (MQ=255) aggaaaaaagagacatctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAg > 1:3547843‑M2/125‑150 (MQ=255) ggaaaaaagagacatctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAgc < 1:1636951‑M2/27‑1 (MQ=255) tctAAAATCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCtt > 2:2100882/1‑150 (MQ=255) agagacatctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACg < 1:731737‑M2/34‑1 (MQ=255) gagacatctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACgg < 2:909356‑M2/35‑1 (MQ=255) aaTCGGCGCTAAAAGATTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGa > 2:3626421/1‑150 (MQ=255) atctccctctaaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGAtata < 1:3768890‑M2/40‑1 (MQ=255) taaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGt < 2:3915758‑M2/49‑1 (MQ=255) aaaatcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTc > 2:12365‑M2/101‑150 (MQ=255) aTTTCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTcc > 1:4509265/1‑150 (MQ=255) tcggcgctaaaagatttcaaaattactgacgacgaaccaaattttacaaaattatttaaaaaataagcactgacgcatatgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTCCGGCTATACTCAAATGTCCATc > 2:4216336‑M2/97‑150 (MQ=255) tCAAAATTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATc > 1:1691531/1‑150 (MQ=255) aaaaTTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAg < 2:1144552/150‑1 (MQ=255) aaaTTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGt < 1:2610464/150‑1 (MQ=255) aTTACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTaa < 2:2362414/150‑1 (MQ=255) ttACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAAc < 2:2233216/150‑1 (MQ=255) tACTGACGACGAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACt < 1:1226043/150‑1 (MQ=255) aaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACtt > 1:188751‑M2/89‑150 (MQ=255) aaaagatttcaaaattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACtt < 2:2814995‑M2/62‑1 (MQ=255) agatttcaaaactactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgcttacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTa < 1:3100894‑M2/65‑1 (MQ=255) acgacgAACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTaa > 1:58172/1‑150 (MQ=255) gacgaACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAaat < 1:1099426/150‑1 (MQ=255) ttcaaaattactgacgacgaaccagattttactaaattatttacaaaataagcgctgacgcatttatcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAaatt < 2:4126352‑M2/69‑1 (MQ=255) acgaACCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAaatt < 1:4229487/150‑1 (MQ=255) aaCCAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAaattaat > 1:827116/1‑150 (MQ=255) aattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTaaattaattn < 2:498064‑M2/74‑2 (MQ=255) aattactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAAttt > 1:3584137‑M2/77‑150 (MQ=255) cAGATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAAtttt < 2:3163623/150‑1 (MQ=255) ttactgacgacgaaccagattttacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAAttttt > 2:190566‑M2/75‑150 (MQ=255) gATTTTACAAAATTATTTAAAAAATAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTc > 2:3431314/1‑150 (MQ=255) 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tacaaaattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGt < 1:3344364‑M2/98‑1 (MQ=255) aaTAAGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGtt > 1:2193324/1‑150 (MQ=255) aaGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGttttt < 2:2872968/150‑1 (MQ=255) aattatttaaaaaataagcgctgacgcatttgtcagtgcttatttttTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGtttttt < 2:831124‑M2/103‑1 (MQ=255) aGCGCTGACGCATTTGTCAGTGCTTATTTTTAGTGACAGAATTTCTGTCAGAAGATAGCCGTTGGCACTTTAGCGCTTACGGATATACTCAAATGTCCATCAGTAACTTTTAAATTAATTTTTCTTTATGAATTTGTTCAAAAGtttttt < 2:4296717/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |