| New junction evidence | |||||||||||
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| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 5153 total aligned reads displayed.
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ggTCACAATTGCTTTCGGCTCACCAAACTGTTTATGGAGTCG‑TTTTAAGAAAGCATAGGCTGCTTGCGTCTCCCGTTTCTTTCGTAACCAGATATCTAAGGTTAAGCCGTCCGCATCAATTGCATGATAAAGATAATGCCAACGTCCCtt > 2:754565/1‑150 (MQ=255) gTCACAATTGCTTTCGGCTCACCAAACTGTTTATGGAGTCG‑TTTTAAGAAAGCATAGGCTGCTTGCGTCTCCCGTTTCTTTCGTAACCAGATATCTAAGGTTAAGCCGTCCGCATCAATTGCACGATAAAGATAATGCCAACGTCCCTTa > 1:2575921/1‑150 (MQ=255) | TGATAAAATTTATTCCGTCGTTTAATAGGTCGATGGTCTTGTTCTATTAAATTGTTAAGATACTTCACAGTTCGGTGCTCTGTCTTAGTATATAAACCCACACTCTGTAACTTTCTAAAGGCGGAGCCAAGAGAAGGTGCTTTATCGGTCACAATTGCTTTCGGCTCACCAAACTGTTTATGGAGTCG‑TTTTAAGAAAGCATAGGCTGCTTGCGTATCCCGTTTCTTTCGTAACCAGATATCTAAGGTTAAGCCGTCCGCATCAATTGCACGATAAAGATAATGCCAACGTCCCTTAATTTT > CP043523/1861358‑1861659 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |