| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP043523 | = 1895788 | NA (NA) | 604 (1.160) | 235/296 | 0.0 | 53.6% | intergenic (+17/+38) | FTN78_chr1944/FTN78_chr1945 | Mobile element protein/hypothetical protein |
| ? | CP043523 | = 2060261 | 526 (1.000) | coding (700/1308 nt) | FTN78_chr2133 | D‑alanyl‑D‑alanine carboxypeptidase | |||||
Only 100 of 1177 total aligned reads displayed.
TTCTAAAACAACCGTAATGATTCTAAAACCGTTTTGATTTGTTGTTCCAGCAAAACAGTCAATTTGAAAACTTGTTGAACCTGTTTTCAAGCCATCTACACCAGTTCTTGAAGTAGAAAAACCACTAAGCATTTGATTGGTATTAGTTAAGGTCATCTTTGCTTCATTGCCGGTATCAAAAGGAATTTCTGTTTTTTTAGTGATTTGAAGAATTTCTGGGAAATCTTGAATAAGATGATAACTGAGTGTTGCTACGGCCTTTGCGCTCATTGTGTTTGTTGCTGAAGCACCAGACCCTG > CP043523/2060112‑2060410 | cTAAAACAACCGTAATGATTCTAAAGCCGTTTTGATTTGTTGTTCCAGCAAAACAGTCAATTTGAAAACTTGTTGAACCTGTTTTCAAGCCATCCACACCAGTTCTTGAAGTAGAAAACCCACTAAGCATTTGATTGGTATTAGTTAAcc < 2:3951848‑M2/150‑3 (MQ=255) tAAAACAACCGTACTGATTCTAAAGCCGTTTTGATTTGTTCTTCCAGCAAAACAGTCAATTTGAAAACTTGTTGAACCTGTTTTCAAGCCATCCACACCAGTTCTTGAAGTAGAAAAACCACTAAGCATTTGATTGGTATTAGTTAAccc > 1:4348792‑M2/1‑147 (MQ=255) tAAAACAACCGTAATGATTCTAAAACCGTTTTGATTTGTTGTTCCAGCAAAACAGTCAATTTGAAAACTTGTTGAACCTGTTTTCAAGCCATCTACACCAGTTCTTGAAGTAGAAAAACCACTAAGCATTTGATTGGTATTAGTTAAGGt > 2:3217049/1‑150 (MQ=255) aacaacCGTAATGATTCTAAAACCGTTTTGATTTGTTGTTCCAGCAAAACAGTCAATTTGAAAACTTGTTGAACCTGTTTTCAAGCCATCTACACCAGTTCTTGAAGTAGAAAAACCACTAAGCATTTGATTGGTATTAGTTAAGGTCAt < 1:1767021/150‑1 (MQ=255) acaacCGTAATGATTCTAAAGCCGTTTTGATTTGTTGTTCCAGCAAAACAGTCAATTTGAAAACTTGTTGAACCTGTTTTCAAGCCATCCACACCAGTTCTTGAAGTAGAAAAACCACTAAGCATTTGATTGGTATTAGTTAAcccgaat > 1:2269420‑M2/1‑143 (MQ=255) acaacCGTAATGATTCTAAAACCGTTTTGATTTGTTGTTCCAGCAAAACAGTCAATTTGAAAACTTGTTGAACCTGTTTTCAAGCCATCTACACCAGTTCTTGAAGTAGAAAAACCACTAAGCATTTGATTGGTATTAGTTAAGGTCATc < 1:2743249/150‑1 (MQ=255) aacCGTAATGATTCTAAAGCCGTTTTGATTTGTTGTTCCAGCAAAACAGTCAATTTGAAAACTTGTTGAACCTGTTTTCAAGCCATCCACACCAGTTCTTGAAGTAGAAAAACCACTAAGCATTTGATTGGTATTAGTTAAcctgaattg < 1:3625671‑M2/150‑10 (MQ=255) ccttAATTATTCTAAAACCGTTTTTATTTTTTGTTCCATCAAAACATTCAATTTTAAAACTTGTTGAACCTGTTTTCAAGCCATCTACACCAGTTCTTAAATTATAAAAACCACTAAGCATTTGATTGGTATTATTTAAGGTCATCTTTg < 2:3685832/147‑1 (MQ=255) cGTAATGATTCTAAAACCGTTTTGATTTGTTGTTCCAGCAAAACAGTCAATTTGAAAACTTGTTGAACCTGTTTTCAAGCCATCTACACCAGTTCTTGAAGTAGAAAAACCACTAAGCATTTGATTGGTATTAGTTAAGGTCATCTTTGc > 2:248798/1‑150 (MQ=255) gTAATGATTCTAAAGCCGTTTTGATTTGTTGTTCCAGCAAAACAGTCAATTTGAAAACTTGTTGAACCTGTTTTCAAGCCATCCACACCAGTTCTTGAAGTAGAAAAACCACTAAGCATTTGATTGGTATTAGTTAAcccgaattgctag < 2:1180507‑M2/150‑14 (MQ=255) gTAATGATTCTAAAGCCGTTTTGATTTGTTGTTCCAGCAAAACAGTCAATTTGAAAACTTGTTGAACCTGTTTTCAAGCCATCCACACCAGTTCTTGAAGTAGAAAAACCACTAAGCATTTGATTGGTATTAGTTAAcccgaattgctag > 2:4553971‑M2/1‑137 (MQ=255) aTGATTCTAAAACCGTTTTGATTTGTTGTTCCAGCAAAACAGTCAATTTGAAAACTTGTTGAACCTGTTTTCAAGCCATCTACACCAGTTCTTGAAGTAGAAAAACCACTAAGCATTTGATTGGTATTAGTTAAGGTCATCTTTGCTTCa < 1:2064334/150‑1 (MQ=255) tGATTCTAAAACCGTTTTGATTTGTTGTTCCAGCAAAACAGTCAATTTGAAAACTTGTTGAACCTGTTTTCAAGCCATCTACACCAGTTCTTGAAGTAGAAAAACCACTAAGCATTTGATTGGTATTAGTTAAGGTCATCTTTGCTTCAt > 1:975266/1‑150 (MQ=255) 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tttGATTTGTTGTTCCAGCAAAACAGTCAATTTGAAAACTTGTTGAACCTGTTTTCAAGCCATCCACACCAGTTCTTGAAGTAGAAAAACCACTAAGCATTTGATTGGTATTAGTTAAcccgaattgctagttgattatttagccatgac > 1:4011823‑M2/1‑118 (MQ=255) tttGATTTGTTGTTCCAGCAAAACAGTCAATTTGAAAACTTGTTGAACCTGTTTTCAAGCCATCCACACCAGTTCTTGAAGTAGAAAAACCACTAAGCATTTGATTGGTATTAGTTAAcccgaattgctagttgattatttagccatgac < 2:1075990‑M2/150‑33 (MQ=255) ttGATTTGTTGTTCCAGCAAAACAGTCAATTTGAAAACTTGTTGAACCTGTTTTCAAGCCATCTACACCAGTTCTTGAAGTAGAAAAACCACTAAGCATTTGATTGGTATTAGTTAAGGTCATCTTTGCTTCATTGCCGGTATCAAAAgg < 1:743123/150‑1 (MQ=255) ttGATTTGTTGTTCCAGCAAAACAGTCAATTTGAAAACTTGTTGAACCTGTTTTCAAGCCATCCACACCAGTTCTTGAAGTAGAAAAACCACTAAGCATTTGATTGGTATTAGTTAAcccgaattgctagttgattatttagccatgact > 2:4461381‑M2/1‑117 (MQ=255) gATTTGTTGTTCCAGCAAAACAGTCAATTTGAAAACTTGTTGAACCTGTTTTCAAGCCATCTACACCAGTTCTTGAAGTAGAAAAACCACTAAGCATTTGATTGGTATTAGTTAAGGTCATCTTTGCTTCATTGCCGGTATCAAAAGGaa > 1:1001294/1‑150 (MQ=255) gATTTGTTGTTACAGCAAAACAGTCAATTTGAAAACTTGTTGAACCTGTTTTCAAGCCATCCACACCAGTTATTGAAGTAGAAAAACCACTAAGCATTTGATTGGTATTAGTTAAcccgaattgctagttgattatttagccatgacttg > 2:331137‑M2/1‑115 (MQ=255) aTTTGTTGTTCCAGCAAAACAGTCAATTTGAAAACTTGTTGAACCTGTTTTCAAGCCATCTACACCAGTTCTTGAAGTAGAAAAACCACTAAGCATTTGATTGGTATTAGTTAAGGTCATCTTTGCTTCATTGCCGGTATCAAAAGGAAt < 1:3713753/150‑1 (MQ=255) tgttgtTCCAGCAAAACAGTCAATTTGAAAACTTGTTGAACCTGTTTTCAAGCCATCTACACCAGTTCTTGAAGTAGAAAAACCACTAAGCATTTGATTGGTATTAGTTAAGGTCATCTTTGCTTCATTGCCGGTATCAAAAGGAATTTc < 2:1023769/150‑1 (MQ=255) gttgttCCAGCAAAACAGTCAATTTGAAAACTTGTTGAACCTGTTTTCAAGCCATCCACACCAGTTCTTGAAGTAGAAAAACCACTAAGCATTTGATTGGTATTAGTTAAcccgaattgctagttgattatttagccatgacttgacacc > 2:1828603‑M2/1‑110 (MQ=255) ttgttCCAGCAAAACAGTCAATTTGAAAACTTGTTGAACCTGTTTTCAAGCCATCCACACCAGTTCTTGAAGTAGAAAAACCACTAAGCATTTGATTGGTATTAGTTAAcccgaattgctagttgattatttagccatgacttgacaccc > 1:899462‑M2/1‑109 (MQ=255) ttgttCCAGCAAAACAGTCAATTTGAAAACTTGTTGAACCTGTTTTCAAGCCATCCACACCAGTTCTTGAAGTAGAAAAACCACTAAGCATTTGATTGGTATTAGTTAAcccgaattgctagttgattatttagccatgacttgacaccc > 1:2502178‑M2/1‑109 (MQ=255) ttCCAGCAAAACAGTCAATTTTAAAACTTGTTGAACCTGTTTTCAAGCCATCCACACCAGTTCTTGAAGTAGAAAAACCACTAAGCATTTGATTGGTATTAGTTAAcccgaattgctagttgattatttagccatgacttgacacccgat > 1:3845536‑M2/1‑106 (MQ=255) tCCAGCAAAACAGTCAATTTGAAAACTTGTTGAACCTGTTTTCAAGCCATCCACACCAGTTCTTGGAGTAGAAAAACCACTAAGCATTTGATTGGTATTAGTTAAcccgaattgctagttgattatttagccatgacttgacacccgatc < 2:3164982‑M2/150‑46 (MQ=255) ccAGCAAAACAGTCAATTTGAAAACTTGTTGAACCTGTTTTCAAGCCATCCACACCAGTTCTTGAAGTAGAAAAACCACTAAGCATTTGATTGGTATTAGTTAAcccgaattgctagttgattatttagccatgacttgacacccgatag > 1:2596955‑M2/1‑104 (MQ=255) cAGCAAAACAGTCAATTTGAAAACTTGTTGAACCTGTTTTCAAGCCATCCACACCAGTTCTTGAAGTAGAAAAACCACTAAGCATTTGATTGGTATTAGTTAAcccgaattgctagttgattatttagccatgacttgacacccgataga > 2:2758821‑M2/1‑103 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |