| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 500 total aligned reads displayed.
TGACAGCTTCCCCATTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAATGCTACAAAGGGACAGTACTTCTATGGATGTAAATGTCATGCTTTAGTCAGTGAATCAGGCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP043523/248407‑248261‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGGTTCTGTTGCAAAGTTTTCCAAAAAATCTATTTTAGTGTAAAATTGAGAAAAAAGACAGAGACGACAGAGTAATGAATCATTTTAAAGGCAAACAATTCAAAAAAGACGTCATTATTGTCGCTGTTGGTTACTACCTGCGTTAC < CP043523/1861974‑1861828 | TGACAGCTTCCCCATTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAATGCTACAAAGGGACAGTACTTCTATGGATGTAAATGTCATGCTTTAGTCAGTGAATCAGGCTAC > 1:4185785/1‑148 ACAGCTTCCCCATTCCTTTGTGTCAGCCTATTCGTAATTTCAGAAGCAAAGTTCTTGGAGATTATGCAAATGTTGGCTACAATGCTACAAAGGGACAGTACTTCTATGGATGTAAATGTCATGCTTTAGTCAGTGAATCAGGCTACGT > 1:52279/1‑148 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |