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1:3144475/1‑148 TAGAAGTATGGACCAATGTCAAATATTTAGACACAAAATGAGCTATATTTTCTTAAAATAATTTTCTTCTTTCTAATTTGGAGTTAAACCATTGTTGGCGGAATGAGGATTATAATTGTTATAAAATTGTTCGATGTATTCAAAGCAA < 2:3412563/148‑1 AGAAGTATGGACCAATGTCAAATATTTAGACACAAAATGAGCTATATTTTCTTAAAATAATTTTCTTCTTTCTAATTTGGAGTTAAACCATTGTTGGCGGAATGAGGATTATAATTGTTATAAAATTGTTCGATGTATTCAAAGCAAG > 2:2012406/1‑148 AGTATGGACCAATGTCAAATATTTAGACACAAAATGAGCTATATTTTCTTAAAATAATTTTCTTCTTTCTAATTTGGAGTTAAACCATTGTTGGCGGAATGAGGATTATAATTGTTATAAAATTGTTCGATGTATTCAAAGCAAGAGA > 1:3762800/1‑148 TATGGACCAATGTCAAATATTTAGACACAAAATGAGCTATATTTTCTTAAAATAATTTTCTTCTTTCTAATTTGGAGTTAAACCATTGTTGGCGGAATGAGGATTATAATTGTTATAAAATTGTTCGATGTATTCAAAGCAAGAGAGT > 2:785333/1‑148 ATGGACCAATGTCAAATATTTAGACACAAAATGAGCTATATTTTCTTAAAATAATTTTCTTCTTTCTAATTTGGAGTTAAACCATTGTTGGCGGAATGAGGATTATAATTGTTATAAAATTGTTCGATGTATTCAAAGCAAGAGAGTT > 2:2586786/1‑148 ATGGACCAATGTCAAATATTTAGACACAAAATGAGCTATATTTTCTTAAAATAATTTTCTTCTTTCTAATTTGGAGTTAAACCATTGTTGGCGGAATGAGGATTATAATTGTTATAAAATTGTTCGATGTATTCAAAGCAAGAGAGTT < 1:4138497/148‑1 ATGGACCAATGTCAAATATTTAGACACAAAATGAGCTATATTTTCTTAAAATAATTTTCTTCTTTCTAATTTGGAGTTAAACCATTGTTGGCGGAATGAGGATTATAATTGTTATAAAATTGTTCGATGTATTCAAAGCAAGAGAGTT > 1:3552777/1‑148 ATGGACCAATGTCAAATATTTAGACACAAAATGAGCTATATTTTCTTAAAATAATTTTCTTCTTTCTAATTTGGAGTTAAACCATTGTTGGCGGAATGAGGATTATAATTGTTATAAAATTGTTCGATGTATTCAAAGCAAGAGAGTT > 2:1787052/1‑148 AAACCTTTGTCTGATGTTGAATTTGGCTTAGTGATGCAAGAAGTTCAAAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP043523/249117‑249263‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGACTAATGTCAAATATTTAGACACAAAATGAGCTATATTTTCTTAAAATAATTTTCTTCTTTCTAATTTGGAGTTAAACCATTGTTGGCGGAATGAGGATTATAATTGTTATAAAATTGTTCGATGTATTCAAAGCAAGAGAGTT < CP043523/1884018‑1883872 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |