| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP043523 | = 249263 | 563 (1.060) | 566 (1.060) | 226/294 | 0.2 | 66.8% | coding (300/2988 nt) | FTN78_chr0307 | Type I restriction‑modification system, restriction subunit R |
| ? | CP043523 | = 1884018 | 0 (0.000) | intergenic (+64/‑301) | FTN78_chr1929/FTN78_chr1930 | Transposase TnpA/Putative UV‑damage repair protein UvrX | |||||
Only 100 of 1138 total aligned reads displayed.
CAAACCTTTGTCTGATGTTGAATTTGGCTTAGTGATGCAAGAAGTTCAAAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCAAGTGATTTTTGATGAGCTCCCTCATGGACTAGCGAGCAAAAGAATTATTGATTTAGCCTTGCTTATTAACGGAATCCCAGTAGCGCAT > CP043523/249116‑249410 | aaaCCTTTGTCTGATGTTGAATTTGGCTTAGTGATTCAAGAAGTTCAGAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATCGGTAGGGGCAGGGGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAt < 2:1321960‑M1/148‑2 (MQ=255) aCCTTTGTCTGATGTTGAATTTGGCTTAGTGATGCAAGAAGTTCAAAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTagag < 1:4254116/148‑1 (MQ=255) ttGTCTGATGTTGAATTTGGCTTAGTGATTCAAGAAGTTCAGAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGGGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggacca > 1:1700850‑M1/1‑141 (MQ=255) tGTCTGATGTTGAATTTGGCTTAGTGATGCAAGAAGTTCAAAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGAtttt < 1:1195303/148‑1 (MQ=255) tGTCTGATGTTGAATTTGGCTTAGTGATGCAAGAAGTTCAAAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGAtttt > 2:3426338/1‑148 (MQ=255) gTCTGATGTTGAATTTGGCTTAGTGATTCAAGAAGTTCAGAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGGGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaat > 2:1981668‑M1/1‑139 (MQ=255) cTGATGTTGAATTTGGCTTAGTGATGCAAGAAGTTCAAAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTa < 2:535552/148‑1 (MQ=255) aTGTTGAATTTGGCTTAGTGATGCAAGAAGTTCAAAGGATTACAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACCCGAGATGACGGCTCTAACTCAGTAGTAGCGATTTTTTATgc > 2:2332748/1‑147 (MQ=255) tGTTGAATTTGGCTTAGTGATGCAAGAAGTTCAAAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGaa < 1:3936813/148‑1 (MQ=255) gTTGAATTTGGCTTAGTGATTCAAGAAGTTCAGAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGGGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaat < 1:703825‑M1/148‑17 (MQ=255) gTTGAATTTGGCTTAGTGATGCAAGAAGTTCAAAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAg < 1:620199/148‑1 (MQ=255) ttGAATTTGGCTTAGTGATTCAAGAAGTTCAGAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGGGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaata > 2:1126013‑M1/1‑131 (MQ=255) tGAATTTGGCTTAGTGATGCAAGAAGTTCAAAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAgat > 2:3523128/1‑148 (MQ=255) gAATTTGGCTTAGTGATGCAAGAAGTTCAAAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAgatg < 1:340938/148‑1 (MQ=255) tGGCTTAGTGATGCAAGAAGTTCAAAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGAtgtg > 2:3872546/1‑148 (MQ=255) ggCTTAGTGATTCAAGAAGTTCAGAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGGGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagaca > 2:4388100‑M1/1‑123 (MQ=255) cTTAGTGATTCAAGAAGTTCAGAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGGGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacaca > 1:2811783‑M1/1‑121 (MQ=255) ttAGTGATTCAAGAAGTTCAGAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGGGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaa < 2:1428794‑M1/148‑29 (MQ=255) aGTGATTCAAGAAGTTCAGAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGGGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaa < 1:900253‑M1/148‑31 (MQ=255) gTGATTCAAGAAGTTCAGAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGGGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaat < 2:881517‑M1/148‑32 (MQ=255) gTGATTCAAGAAGTTCAGAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGGGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaat > 1:20101‑M1/1‑117 (MQ=255) gTGATGCAAGAAGTTCAAAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCtggtg < 1:3101726/148‑1 (MQ=255) tGATTCAAGAAGTTCAGAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGGGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatg < 1:2586220‑M1/148‑33 (MQ=255) ttcaaGAAGTTCAGAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGGGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagc < 2:1006436‑M1/146‑36 (MQ=255) cAAGAAGTTCAGAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGGGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagcta < 1:4154347‑M1/148‑38 (MQ=255) cAAGAAGTTCAGAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGGGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagcta < 1:3160359‑M1/148‑38 (MQ=255) cAAGAAGTTCAAAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTggtcggt > 1:350081/1‑148 (MQ=255) aagaagTTCAAAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTggtcggtc < 2:3968952/148‑1 (MQ=255) aagTTCAGAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGGGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatatt > 1:776553‑M1/1‑107 (MQ=255) aagTTCAAAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACg > 2:280727/1‑148 (MQ=255) aagTTCAAAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACg > 2:2057527/1‑148 (MQ=255) agTTCAAAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGc > 1:1938266/1‑148 (MQ=255) gTTCAAAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCt < 2:148409/148‑1 (MQ=255) cagaggaTTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGGGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttctt > 2:4178128‑M1/4‑102 (MQ=255) ggATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGGGGTGTCGGCTCTATTCCTATAAGACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaa < 2:2255687‑M1/148‑51 (MQ=255) aaaCGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGGGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattt > 1:3211403‑M1/1‑92 (MQ=255) aaCGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGc < 2:4094061/148‑1 (MQ=255) cGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCa < 1:2139993/148‑1 (MQ=255) cGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCa > 1:1876110/1‑148 (MQ=255) gCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGGGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttctt < 1:2300394‑M1/148‑61 (MQ=255) gCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCaa > 2:694283/1‑148 (MQ=255) cTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCAAGt < 1:2685396/148‑1 (MQ=255) ttATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGGGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctt < 1:3286832‑M1/148‑64 (MQ=255) atgatgCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGGGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttc < 1:3620172‑M1/148‑66 (MQ=255) gatgCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCAAGTGAttt < 2:2524502/148‑1 (MQ=255) cAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGGGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctaatttgg > 2:58111‑M1/1‑75 (MQ=255) aCTTTTATTGGTAGGGGCAGGGGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctaatttggag < 1:1545626‑M1/148‑76 (MQ=255) aCTTTTATTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCAAGTGATTTTTGATGAg < 1:1327091/148‑1 (MQ=255) cTTTTATTGGTAGGGGCAGGGGGTGTCGGATCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTATAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctaatttggagt < 1:2896618‑M1/148‑77 (MQ=255) tttATTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCAAGTGATTTTTGATGAGCTc > 2:3115868/1‑148 (MQ=255) ttATTGGTAGGGGCAGGGGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctaatttggagttaa < 2:2954914‑M1/148‑80 (MQ=255) aTTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCAAGTGATTTTTGATGAGCTCCCt < 2:1769167/148‑1 (MQ=255) ttGGTAGGGGCAGGGGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctaatttggagttaaacc < 2:4672628‑M1/148‑83 (MQ=255) ttGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCAAGTGATTTTTGATGAGCTCCCTc < 2:3384600/148‑1 (MQ=255) tGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCAAGTGATTTTTGATGAGCTCCCTCa > 2:2137874/1‑148 (MQ=255) ggTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCAAGTGATTTTTGATGAGCTCCCTCAt > 1:1397385/1‑148 (MQ=255) ggTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCAAGTGATTTTTGATGAGCTCCCTCAt > 1:4131515/1‑148 (MQ=255) ggggCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCAAGTGATTTTTGATGAGCTCCCTCATGGAc > 1:3797597/1‑148 (MQ=255) ggCAGGGGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctaatttggagttaaaccattgttgg < 1:1003477‑M1/148‑91 (MQ=255) ggCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCAAGTGATTTTTGATGAGCTCCCTCATGGACTa > 1:4523610/1‑148 (MQ=255) ggggtgTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctaatttggagttaaaccattgttggcgtaa > 2:4566294‑M1/3‑53 (MQ=255) ggggtgTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctaatttggagttaaaccattgttggcggaa < 1:3842156‑M1/146‑96 (MQ=255) ggTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctaatttggagttaaaccattgttggcggaatg < 2:2734171‑M1/148‑98 (MQ=255) ggTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCAAGTGATTTTTGATGAGCTCCCTCATGGACTAGCGAGCa > 2:3654974/1‑148 (MQ=255) gtgtCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctaatttggagttaaaccattgttggcggaatga < 2:2652439‑M1/148‑99 (MQ=255) cGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCAAGTGATTTTTGATGAGCTCCCTCATGGACTAGCGAGCAAAAGa < 1:1640241/148‑1 (MQ=255) ggCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctaatttggagttaaaccattgttggcggaatgaggatt < 2:3814051‑M1/148‑104 (MQ=255) gCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctaatttggagttaaaccattgttggcggaatgaggatta < 2:1233511‑M1/148‑105 (MQ=255) ctctATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctaatttggagttaaaccattgttggcggaatgaggattat < 1:4296913‑M1/148‑106 (MQ=255) ctctATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctaatttggagttaaaccattgttggcggaatgaggattat > 2:4464476‑M1/1‑43 (MQ=255) tctATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctgatttggagttaaacccttgttggcggaatgaggattata > 1:3030671‑M1/1‑42 (MQ=255) ctATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctaatttggagttaaaccattgttggcggaatgaggattataa > 1:2758200‑M1/1‑41 (MQ=255) ctATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCAAGTGATTTTTGATGAGCTCCCTCATGGACTAGCGAGCAAAAGAattat < 1:343323/148‑1 (MQ=255) tATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctaatttggagttaaaccattgttggcggaatgaggattataat > 2:2862703‑M1/1‑40 (MQ=255) aTTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctaatttggagttaaaccattgttggcggaatgaggattataatt > 1:4711472‑M1/1‑39 (MQ=255) ttCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCAAGTGATTTTTGATGAGCTCCCTCATGGACTAGCGAGCAAAAGAATTATTGa > 1:4619719/1‑148 (MQ=255) tCCGATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctaatttggagttaaaccattgttggcggaatgaggattataattgt < 2:3264968‑M1/148‑112 (MQ=255) tataACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCAAGTGATTTTTGATGAGCTCCCTCATGGACTAGCGAGCAAAAGAATTATTGATTTa > 1:1074364/1‑148 (MQ=255) ataACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctaatttggagttaaaccattgttggcggaatgaggattataattgttata > 1:146203‑M1/1‑33 (MQ=255) aaCACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCAAGTGATTTTTGATGAGCTCCCTCATGGACTAGCGAGCAAAAGAATTATTGATTTAGcc > 2:3742234/1‑148 (MQ=255) acacGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCAAGTGATTTTTGATGAGCTCCCTCATGGACTAGCGAGCAAAAGAATTATTGATTTAGCCt < 1:23974/148‑1 (MQ=255) cGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctaatttggagttaaaccattgttggcggaatgaggattataattgttataaaattg < 2:3580795‑M1/148‑122 (MQ=255) gagaTTACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctaatttggagttaaaccattgttggcggaatgaggattataattgttataaaattgt < 2:3331866‑M1/148‑123 (MQ=255) gaTGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctaatttggagttaaaccattgttggcggaatgaggattataattgttataaaattgttc > 1:2972564‑M1/1‑24 (MQ=255) gaTGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgacaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctaatttggagttaaaccattgttggcggaatgaggattataattgttataaaattgttc > 1:529880‑M1/1‑24 (MQ=255) aTGACGGCTCTAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctaatttggagttaaaccattgttggcggaatgaggattataattgttataaaattgttcg < 1:3732249‑M1/148‑126 (MQ=255) tGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCAAGTGATTTTTGATGAGCTCCCTCATGGACTAGCGAGCAAAAGAATTATTGATTTAGCCTTGCttatt > 1:1780579/1‑148 (MQ=255) tGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCAAGTGATTTTTGATGAGCTCCCTCATGGACTAGCGAGCAAAAGAATTATTGATTTAGCCTTGCttatt < 2:1853165/148‑1 (MQ=255) tctAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctaatttggagttaaaccattgttggcggaatgaggattataattgttataaaattgttcgatgtattc < 1:438179‑M1/148‑134 (MQ=255) tAACTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctaatttggagttaaaccattgttggcggaatgaggattataattgttataaaattgttcgatgtattcaa < 2:1595856‑M1/148‑136 (MQ=255) tAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCAAGTGATTTTTGATGAGCTCCCTCATGGACTAGCGAGCAAAAGAATTATTGATTTAGCCTTGCTTATTAACGGAATc < 1:126990/148‑1 (MQ=255) aCTTAGAAGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctaatttggagttaaaccattgttggcggaatgaggattataattgttataaaattgttcgatgtattcaaag < 1:4052995‑M1/148‑138 (MQ=255) aCTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCAAGTGATTTTTGATGAGCTCCCTCATGGACTAGCGAGCAAAAGAATTATTGATTTAGCCTTGCTTATTAACGGAATccc < 2:1683315/148‑1 (MQ=255) aCTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCAAGTGATTTTTGATGAGCTCCCTCATGGACTAGCGAGCAAAAGAATTATTGATTTAGCCTTGCTTATTAACGGAATccc > 1:2473099/1‑148 (MQ=255) aGTAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctaatttggagttaaaccattgttggcgtaatgaggattataatagttataaaattgttcgatgtattcaaagcaagaga < 2:2405681‑M1/148‑145 (MQ=255) gTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCAAGTGATTTTTGATGAGCTCCCTCATGGACTAGCGAGCAAAAGAATTATTGATTTAGCCTTGCTTATTAACGGAATCCCAGTAgcgc > 1:4460286/1‑148 (MQ=255) tAtggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctaatttggagttaaaccattgttggcggaatgaggattataattgttataaaattgttcgatgtattcaaagcaagagagt > 2:785333‑M1/1‑2 (MQ=255) tAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCAAGTGATTTTTGATGAGCTCCCTCATGGACTAGCGAGCAAAAGAATTATTGATTTAGCCTTGCTTATTAACGGAATCCCAGTAGCGCa < 2:4137209/148‑1 (MQ=255) atggaccaatgtcaaatatttagacacaaaatgagctatattttcttaaaataattttcttctttctaatttggagttaaaccattgttggcggaatgaggattataattgttataaaattgttcgatgtattcaaagcaagagagtt > 1:3551803‑M1/1‑1 (MQ=255) agagATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCAAGTGATTTTTGATGAGCTCCCTCATGGACTAGCGAGCAAAAGAATTATTGATTTAGCCTTGCTTATTAACGGAATCCCAGTAGCGCat < 1:2057527/148‑1 (MQ=255) | CAAACCTTTGTCTGATGTTGAATTTGGCTTAGTGATGCAAGAAGTTCAAAGGATTAAAACGCCTTATGATGCTCAACTTTTATTGGTAGGGGCAGGAGGTGTCGGCTCTATTCCTATAACACGAGATGACGGCTCTAACTTAGAAGTAGAGATTTTTTATGAAGATGATGTGGCTGGTGGTCGGTCACGCTATGAAGTCGTCAGCCAAGTGATTTTTGATGAGCTCCCTCATGGACTAGCGAGCAAAAGAATTATTGATTTAGCCTTGCTTATTAACGGAATCCCAGTAGCGCAT > CP043523/249116‑249410 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |