| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP043523 | 336292 = | 542 (1.020) | 144 (0.280) +CTCGGTG |
60/280 | 25.5 | 21.7% | intergenic (+518/+92) | FTN78_chr0384/FTN78_chr0385 | tRNA‑specific adenosine‑34 deaminase/Mobile element protein |
| ? | CP043523 | 838360 = | 548 (1.030) | intergenic (‑66/+92) | FTN78_chr0888/FTN78_chr0889 | hypothetical protein/General stress protein, Gls24 family | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
AAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP043523/336385‑336292‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTCTATCTAAATAAAAAACTATACAATTGAAGTAACTTACTAAAAAAGCCTCACAATAGAGGCCTTTGTTCATCAGGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTTTATCTGTACTGTCTTCTACTTTGTCTTTTACTTT > CP043523/838360‑838505 ||||||| AAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAAA < 1:848567/148‑1AAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAAA > 1:1138778/1‑148AAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAAA < 1:1282108/148‑1AAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAAA > 1:3711859/1‑148AAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCAAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAAA < 2:2396692/148‑1AAGCATATCAGAGTATTTTCTAGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAAA < 2:936811/148‑1 AGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCCATCCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAATAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAAAg < 1:4240460/148‑2 AGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAAAg < 1:718385/148‑2 AGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAAAg > 2:2080135/1‑147 AGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAAAg < 1:3919632/148‑2 AGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAAAg > 1:3961862/1‑147 GCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAAAgc > 2:403086/1‑146 GCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAAAgc > 2:1451296/1‑146 acgATCAGAGTATTTGCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCAGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGCACTCACTGACTAAAAAgca > 2:1995874/4‑145 CCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAAAgcc < 1:3439073/148‑4 CCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAAAgcc < 1:1016342/148‑4 CCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAAAgcc < 1:1992418/148‑4 CTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAAAgcct < 1:1854905/148‑5 CTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACTAAAAAgcct > 2:1163310/1‑144 TATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTC < 1:4276487/148‑1 CAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCAta < 1:4242645/148‑3 AGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCAtaa > 1:1600447/1‑145 GAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAAT > 2:341649/1‑148 AGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATA < 2:121805/148‑1 AGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATA < 1:110396/148‑1 AGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATA < 1:1227136/148‑1 AGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATA > 2:3531075/1‑148 AGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATA > 2:3543300/1‑148 GTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAG > 2:3793595/1‑148 GTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAG < 1:4405188/148‑1 TATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGA < 2:366297/148‑1 TATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGA < 2:4276869/148‑1 TATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGA < 1:1361052/148‑1 TATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGA < 2:2101729/148‑1 ATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAG > 2:1764024/1‑148 ATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAG < 2:3222162/148‑1 ATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAG > 1:21753/1‑148 ATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAG < 2:3294348/148‑1 TTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGG > 2:449489/1‑148 TTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGG > 1:1067833/1‑148 TTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGG > 1:4284565/1‑148 TTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGC < 1:1689118/148‑1 TTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGC < 1:285581/148‑1 TTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCa < 2:2158659/148‑2 TCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCat > 2:3843154/1‑146 TCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCat > 2:1249486/1‑146 TCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCat > 2:2752469/1‑146 TCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCat < 1:3083443/148‑3 CTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCatt > 1:818531/1‑145 CTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCatt > 2:3627510/1‑145 TGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAAAAAAAAAA‑AAAAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTT < 2:2391321/148‑1 TGGTACATCGAAGCCATTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTCATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTT < 2:1571805/148‑1 GGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTa < 1:1228239/148‑2 GGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTa < 1:1693381/148‑2 GGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCATCATAATAGAGGCATTTa < 2:144174/148‑2 ACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTattt > 2:2932843/1‑144 ACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTattt > 1:2656266/1‑144 ATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAGAAGCCTCATAATAGAGGCATTTatttct > 2:1770751/1‑142 ATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTatttct > 1:3045968/1‑142 ATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTatttct > 1:3046071/1‑142 ATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTatttct < 1:1407049/148‑7 ATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTatttct > 2:1164102/1‑142 ATCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTatttct < 1:2419979/148‑7 TCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCTATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTatttctc < 2:4214480/148‑8 TCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCGATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTatttctc < 2:4224623/148‑8 TCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTatttctc < 2:2639364/148‑8 TCGAAGCCTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTatttctc < 1:3433839/148‑8 CTTTTATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTT > 2:2811036/1‑148 ATAATTCAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTA < 1:1396188/148‑1 CAAACCGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATT < 2:1933537/148‑1 GAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTA < 1:1995874/148‑1 GAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTA > 2:770662/1‑148 GAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTA > 1:495233/1‑148 AATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAA < 1:1375910/148‑1 ATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAAC > 2:1549223/1‑148 TCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACT > 1:3735418/1‑148 CCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTC < 2:334733/148‑1 CCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTC < 2:3053649/148‑1 CCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTC > 2:4482262/1‑148 CATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCT > 2:2795917/1‑148 AAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCT < 2:4340429/148‑1 AAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTT > 2:4663381/1‑148 AAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTT > 2:4203679/1‑148 AGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTC > 2:579052/1‑148 AGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTC > 2:3390030/1‑148 TTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTGTATCTGAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTT > 2:902240/1‑148 TAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTTTA < 2:1535819/148‑1 GGTATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTTTATCT > 1:720177/1‑148 TATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTTTATCTGT < 2:257057/148‑1 TATCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTTTATCTGT < 2:257201/148‑1 TCTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTTTATCTGTAt > 1:2081527/1‑147 CTTACACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTTTATCTGTAtt > 2:2169779/1‑146 CACCTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGACCTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTTTATCTGTATTGTCT < 2:2530751/148‑1 CTAATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTTTATCTGTATTGTCTTCT < 2:1975731/148‑1 AATCAATTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTTTATCTGTATTGTCTTCTAC < 1:2505326/148‑1 TTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTTTATCTGTATTGTCTTCTACTTTGTC > 2:2520245/1‑148 TTTGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTGTATCTGTATTGTCTTCTACTTTGTC > 2:4620803/1‑148 TGACTCGGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTTTATCTGTATTGTCTTCTACTTTGTCTT > 2:1992069/1‑148 GGTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTTTATCTGTATTGTCTTCTACTTTGTCTTTTACTT < 1:163448/148‑1 GTGCTTCTATCTAAATAAAAAACTATATAAATGAACTCACTTACT‑AAAAAGCCTCATAATAGAGGCATTTATTTCTCACGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTTTATCTGTATTGTCTTATACTTTGTCTTTTACTTT > 1:1902155/1‑148 ||||||| AAGCCTATCAGAGTATTTTCTGGTACATCGAAGCCTTTTATAATTCAAAACGAATCCATCAAAGTTTAGGGTATCTTACACCTAATCAATTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP043523/336385‑336292‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTCTATCTAAATAAAAAACTATACAATTGAAGTAACTTACTAAAAAAGCCTCACAATAGAGGCCTTTGTTCATCAGGATTTATCTAGAAATTTATTTAACTCTAGCTTCTTTATCTGTACTGTCTTCTACTTTGTCTTTTACTTT > CP043523/838360‑838505 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |