| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP043523 | 1890321 = | NA (NA) | coding (316/330 nt) | FTN78_chr1939 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 1004 total aligned reads displayed.
GATTCCCTAAGGATATTAAACCCAAAATTAAGCCACATATCGGGAGGGGAATTTGTTTTAAAAATGATATGAATTTTGAATACATCATAGACTTCTCTTTCTATATTTTTTATTAATTCGTCTTTAATAATTGATTCTATTAATAATATATAATAGTTGATTTAATTTGTAAAATAAATTATTATAATCATATAAATTAAAAAAAATAATTTGTTATTTTTGTATTTTAGGGAGAAAATCACATGTTTTCATTATTTGAGACCTTTATCGTCGTTTATGAAACTAAAAGTTTTAC > CP043523/1596071‑1596365 | aTTCCCTAAGGATATTAAACCCAAAATTAAGCCACATATCGGGAGAGGAATTTGTTTTAAAAATGATATGAATTTTGAATACATCATAAACTTCTCTTTCTATATTTTTTATTAATTCGTCTTAAATAATTGATTCTATTAATAATAa > 1:3453949‑M1/1‑147 (MQ=255) ttCCCTAAGGATATTAAACCCAAAATTAAGCCACATATCGGGAGGGGAATTTGTTTTAAAAATGATATGAATTTTGAATACATCATAGACTTCTCTTTCTATATTTTTTATTAATTCGTCTTTAATAATTGATTCTATTAATAatata < 1:386648/148‑1 (MQ=255) ttCCCTAAGGATATTAAACCCAAAATTAAGCCACATATCGGGAGGGGAATTTGTTTTAAAAATGATATGAATTTTGAATACATCATAGACTTCTCTTTCTATATTTTTTATTAATTCGTCTTTAATAATTGATTCTATTAATAatata < 1:2662050/148‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |