New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? CP043523 838360 =548 (1.030)295 (0.580)
+CACCGAG		 121/280 10.0 36.1% intergenic (‑66/+92) FTN78_chr0888/FTN78_chr0889 hypothetical protein/General stress protein, Gls24 family
?CP043523 847992 = NA (NA)coding (239/255 nt) FTN78_chr0898 Mobile element protein
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff.

Only 100 of 334 total aligned reads displayed.

ATATTCACAGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGA  >  CP043523/847845‑848067
                                                                                                                                                   |                                                                           
atatTCACAGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCtttt                                                                             >  2:4014816/1‑148 (MQ=255)
 tatTCACAGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTc                                                                            >  2:1595878/1‑148 (MQ=255)
  atTCACAGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCa                                                                           >  1:2818792/1‑148 (MQ=255)
  atTCACAGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCGTTTCa                                                                           <  2:4344194/148‑1 (MQ=255)
    tCACAGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCaaa                                                                         <  1:3143270/148‑1 (MQ=255)
    tCACAGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCaaa                                                                         <  1:2229572/148‑1 (MQ=255)
    tCACAGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCaaa                                                                         <  1:2050701/148‑1 (MQ=255)
     cacaGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAAt                                                                        >  1:1136350/1‑148 (MQ=255)
     cacaGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAAt                                                                        <  1:1209341/148‑1 (MQ=255)
     cacaGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAAt                                                                        <  2:4022993/148‑1 (MQ=255)
      acaGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAAtt                                                                       <  1:2513434/148‑1 (MQ=255)
      acaGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAAtt                                                                       <  1:2502012/148‑1 (MQ=255)
       caGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTg                                                                      >  2:886493/1‑148 (MQ=255)
       caGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTg                                                                      >  1:1745922/1‑148 (MQ=255)
         gCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGac                                                                    <  1:4349387/148‑2 (MQ=255)
         gCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGAt                                                                    <  2:2441809/148‑1 (MQ=255)
          cTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGAtt                                                                   >  2:3047687/1‑148 (MQ=255)
          cTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGAtt                                                                   <  2:649262/148‑1 (MQ=255)
            gTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAg                                                                 >  1:561779/1‑148 (MQ=255)
            gTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAg                                                                 >  2:4702250/1‑148 (MQ=255)
            gTTCCTCGTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGGGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTCTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAg                                                                 <  2:3697051/148‑1 (MQ=255)
             ttCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAgg                                                                >  2:3847647/1‑148 (MQ=255)
               ccTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACTTTTTCAAATTGATTAGgtg                                                              >  2:3210104/1‑148 (MQ=255)
                ctctTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGgtgt                                                             <  1:1405365/148‑1 (MQ=255)
                ctctTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGgtgt                                                             <  1:1840465/148‑1 (MQ=255)
                 tctTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTa                                                            >  2:3921208/1‑148 (MQ=255)
                 tctTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTa                                                            >  1:3950647/1‑148 (MQ=255)
                 tctTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTa                                                            >  2:2941400/1‑148 (MQ=255)
                 tctTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTa                                                            <  1:2619488/148‑1 (MQ=255)
                    ttttCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGa                                                         >  1:2080986/1‑148 (MQ=255)
                    ttttCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGa                                                         <  2:1481304/148‑1 (MQ=255)
                     tttCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGAt                                                        >  2:4256045/1‑148 (MQ=255)
                      ttCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATa                                                       <  1:3287407/148‑1 (MQ=255)
                      ttCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATa                                                       <  2:847255/148‑1 (MQ=255)
                       tCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATATTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATAc                                                      >  2:1248965/1‑148 (MQ=255)
                        cTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATAcc                                                     <  1:3258512/148‑1 (MQ=255)
                         tAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATAccc                                                    >  2:2424112/1‑148 (MQ=255)
                         tAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATAccc                                                    <  2:4054593/148‑1 (MQ=255)
                          aaaTTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCt                                                   <  1:1917950/148‑1 (MQ=255)
                          aaaTTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCt                                                   >  1:3613388/1‑148 (MQ=255)
                          aaaTTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCt                                                   >  2:1737679/1‑148 (MQ=255)
                            aTTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTaa                                                 >  1:3213234/1‑148 (MQ=255)
                            aTTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTaa                                                 <  2:3393429/148‑1 (MQ=255)
                             ttAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTaaa                                                <  1:4388149/148‑1 (MQ=255)
                             ttAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTaaa                                                <  2:1423988/148‑1 (MQ=255)
                             cacaaatTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCTTaaa                                                >  2:541465/6‑148 (MQ=255)
                              tAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAAc                                               >  1:1246817/1‑148 (MQ=255)
                               aaTATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACt                                              <  1:2316151/148‑1 (MQ=255)
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                               aaTATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATGCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACt                                              >  2:20006/1‑148 (MQ=255)
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                                  atTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTg                                           <  1:698745/148‑1 (MQ=255)
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                                       ttGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGa                                      >  2:1904548/1‑148 (MQ=255)
                                        tGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGAt                                     <  1:2527065/148‑1 (MQ=255)
                                        tGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGAt                                     <  1:1186870/148‑1 (MQ=255)
                                          tAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTc                                   >  2:2023962/1‑148 (MQ=255)
                                           aGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCg                                  <  1:1690840/148‑1 (MQ=255)
                                           aGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCg                                  >  2:1111520/1‑148 (MQ=255)
                                             gAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGtt                                <  1:2181415/148‑1 (MQ=255)
                                               gTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGtttt                              >  1:2154581/1‑148 (MQ=255)
                                               gTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGtttt                              >  1:4022917/1‑148 (MQ=255)
                                                ttttCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTg                             >  1:3885573/1‑148 (MQ=255)
                                                ttttCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTg                             >  2:128381/1‑148 (MQ=255)
                                                ttttCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTg                             >  1:4157146/1‑148 (MQ=255)
                                                   tCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAAt                          >  1:4276086/1‑148 (MQ=255)
                                                    cATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAAtt                         <  1:3807450/148‑1 (MQ=255)
                                                    cATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAAtt                         >  2:2779270/1‑148 (MQ=255)
                                                    cATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAAtt                         >  2:50589/1‑148 (MQ=255)
                                                    cATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAAtt                         >  2:3713076/1‑148 (MQ=255)
                                                     atatTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATta                        <  1:4404072/148‑1 (MQ=255)
                                                      tatTCTCATTGTATTTCATCACTTGACGTTAAGTACAGTTTTTAGAGTAATAAACGTAGACTTTGAATCTATTTATTTTAAGCTCTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGCTACCATACACTTTGATGTATTCGTCTTGCATtat                       <  2:1016845/148‑1 (MQ=14)
                                                       atTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATtata                      >  1:898437/1‑148 (MQ=255)
                                                        ttCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTATAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATaa                     >  1:1822599/1‑148 (MQ=255)
                                                        ttCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATaa                     <  2:3550040/148‑1 (MQ=255)
                                                        ttCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATaa                     >  2:4543119/1‑148 (MQ=255)
                                                        ttCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATaa                     >  1:3986817/1‑148 (MQ=255)
                                                          ctcATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATaaaa                   >  1:3333263/1‑148 (MQ=255)
                                                          ctcATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATaaaa                   <  2:3954147/148‑1 (MQ=255)
                                                           tcATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAg                  >  1:3046401/1‑148 (MQ=255)
                                                            cATTCTATTTCATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACACACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACGTTCTCAGATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAgg                 >  2:2176113/1‑148 (MQ=14)
                                                              ttCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCt               >  1:3091882/1‑148 (MQ=40)
                                                                cTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTc             <  1:1003657/148‑1 (MQ=39)
                                                                 tATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCg            >  2:3111799/1‑148 (MQ=38)
                                                                  aTTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGa           <  1:3537756/148‑1 (MQ=38)
                                                                   ttttATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGAt          <  1:2185684/148‑1 (MQ=37)
                                                                    tttATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATg         >  1:41206/1‑148 (MQ=35)
                                                                    tttATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATg         >  2:4590760/1‑148 (MQ=35)
                                                                      tATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTa       >  2:3300456/1‑148 (MQ=34)
                                                                       aTCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTAc      >  1:3357825/1‑148 (MQ=33)
                                                                        tCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTAcc     <  2:2834955/148‑1 (MQ=32)
                                                                         cACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCa    <  1:87329/148‑1 (MQ=32)
                                                                          aCTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAg   <  1:4574307/148‑1 (MQ=31)
                                                                          aCTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAg   >  1:3645195/1‑148 (MQ=31)
                                                                          aCTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAg   <  1:4647293/148‑1 (MQ=31)
                                                                          aCTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAg   >  1:786174/1‑148 (MQ=31)
                                                                                                                                                   |                                                                           
ATATTCACAGCTGTTCCTCTTTTTCTAAATTAATATTTTTTGTAGGAGTTTTCATATTCTCATTCTATTTTATCACTTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTAAGATACCCTAAACTTTGATGGATTCGTTTTGAATTATAAAAGGCTTCGATGTACCAGA  >  CP043523/847845‑848067

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.