| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | CP043523 | 1885987 | 1890477–1890320 | 4334–4491 | 343 [335] | [331] 343 | [FTN78_chr1931]–[FTN78_chr1940] | [FTN78_chr1931],FTN78_chr1932,FTN78_chr1933,FTN78_chr1934,FTN78_chr1935,FTN78_chr1936,FTN78_chr1937,FTN78_chr1938,FTN78_chr1939,[FTN78_chr1940] |
Only 100 of 343 total aligned reads displayed.
TGAAATGGGGGGCATTTGCGACTGGGGAATTAACTGAAGCCCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGAAGATAAGATAATTCAAGCATTACCACATCATCTCGTGCTTCATCTTCTTAACCAGTCCTTTTCTAATCAGGTGCAAATTAAAATTCAATATCAAGCCAAAGATAAATTAACTGAAGTCTATGGTAATGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTAAGCAAATCGTAAATATATCATAAAAAAA > CP043523/1885839‑1886130 | aaaTGGGGCGCATTTGCGACTGGAGAACTCACGGAGGCTCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAAtca < 2:1035787/148‑3 (MQ=255) aaaGGGGGCGCATTTGACACTGGACAACTCCCGGAGGCTCAAAATAATCTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAAtca < 1:2784420/148‑3 (MQ=255) aaTGGGGCGCATTTGCGACTGGAGAACTCACGGAGGCTCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCaa < 1:4604175/148‑1 (MQ=255) aaTGGGCCGCATTGGGAACTGGAGAACTCACGGAGGCTCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCaa < 1:243568/148‑1 (MQ=255) aTGGGGCGCATTTGCGACTGGAGAACTCACGGAGGCTCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCaaa > 1:1360633/1‑148 (MQ=255) aTGGGGCGCATTTGCGACTGGAGAACTCACGGAGGCTCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCaaa > 1:3113949/1‑148 (MQ=255) ggcgCATTTGCGACTGGAGAACTCACGGAGGCTCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTATCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCaaagtta < 1:1415097/145‑5 (MQ=255) cgCATTTGCGACTGGAGAACTCACGGAGGCTCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGttaaa > 1:1537414/2‑145 (MQ=255) gCATTTGCGACTGGAGAACTCACGGAGGCTCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCaaagttaaat < 1:1796886/148‑8 (MQ=255) cATTTGCGACTGGAGAACTCACGGAGGCTCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAata > 1:3983045/1‑148 (MQ=255) cATTTGCGACTGGAGAACTCACGGAGGCTCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAata < 2:530145/148‑1 (MQ=255) cATTTGCGACTGGAGAACTCACGGAGGCTCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAata < 2:4346069/148‑1 (MQ=255) cATTTGCGACTGGAGAACTCACGGAGGCTCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAata < 2:4394197/148‑1 (MQ=255) aTTTGCGACTGGAGAACTCACGGAGGCTCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAatat < 1:807399/148‑1 (MQ=255) aTTTGCGACTGGAGAACTCACGGAGGCTCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAatat > 2:1461167/1‑148 (MQ=255) ttGCGACTGGAGAACTCACGGAGGCTCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCa > 1:4423532/1‑148 (MQ=255) ttGCGACTGGAGAACTCACGGAGGCTCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCa > 2:555132/1‑148 (MQ=255) gaggctcAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATg < 2:950458/142‑1 (MQ=255) ggctcAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGaa > 1:1699494/5‑148 (MQ=255) gctcAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAg > 1:4230960/4‑148 (MQ=255) gctcAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAg > 2:884261/4‑148 (MQ=255) ctcAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGt < 2:651969/146‑1 (MQ=255) tcAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGCTGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTc < 2:4253744/147‑1 (MQ=255) tcAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTc > 1:2589944/2‑148 (MQ=255) tcAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTc > 2:3416312/2‑148 (MQ=255) tcAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTc < 2:839984/147‑1 (MQ=255) tcAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTc < 1:3542210/147‑1 (MQ=255) cAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCt > 2:4564054/1‑148 (MQ=255) aaaaTACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTa < 2:3020167/148‑1 (MQ=255) aaaaTACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTa < 2:495226/148‑1 (MQ=255) aaaTACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCTAAGGTTAAAATAACTGAAGttttt > 2:3885093/1‑144 (MQ=2) aaaTACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTAt < 2:2864727/148‑1 (MQ=255) aTACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATgg > 1:2280189/1‑148 (MQ=255) tACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGt > 2:2402361/1‑148 (MQ=255) aCTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGtt < 2:1223998/148‑2 (MQ=255) ttttGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGtttt > 1:1309051/1‑145 (MQ=255) tttGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGttttg < 2:2322025/148‑5 (MQ=255) agatgataagaaaaTTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCaat < 2:4069209/144‑1 (MQ=9) gatgataagaaaaTTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCaata < 2:261087/145‑1 (MQ=9) tgataagaaaaTTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCaataat > 2:1787726/2‑148 (MQ=9) tgataagaaaaTTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCaataat < 2:2150030/147‑1 (MQ=9) tgataagaaaaTTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCaataat > 2:960757/2‑148 (MQ=9) tgataagaaaaTTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCaataat > 2:4206651/2‑148 (MQ=9) tgataagaaaaTTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCaataat > 1:4556284/2‑148 (MQ=9) ataagaaaaTTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCa > 1:1819257/1‑148 (MQ=9) aagaaaaTTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAg > 1:4066067/1‑148 (MQ=9) agaaaaTTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGt > 2:4472658/5‑148 (MQ=2) aaaaTTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTaa < 2:1816212/146‑1 (MQ=9) aaaTTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAag < 2:1121448/147‑1 (MQ=9) aaTTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAaga < 1:3716472/148‑1 (MQ=9) aTTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAagag < 1:3025028/148‑1 (MQ=9) ttCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGt > 2:3611621/1‑148 (MQ=9) tCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGtt > 2:1302160/1‑148 (MQ=9) tCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGtt < 1:4692355/148‑1 (MQ=9) tCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGtt > 2:768102/1‑148 (MQ=9) aaGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTaa > 2:4700676/1‑148 (MQ=9) aaGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTaa < 1:202096/148‑1 (MQ=9) agctttACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTaaa < 1:3222420/144‑1 (MQ=9) aGCATTACCACACCATGTAGTCCCTTGTCTTCTCCATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTCCAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTaaa > 2:3250012/1‑148 (MQ=9) gctttACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAAt < 2:3462887/145‑1 (MQ=9) gctttACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAAt < 1:3479348/145‑1 (MQ=9) tttACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCa < 1:2738707/147‑1 (MQ=9) ttACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCaa < 1:1740791/148‑1 (MQ=9) ttACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCaa > 2:357058/1‑148 (MQ=9) aCCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACg > 2:3830274/1‑148 (MQ=9) tcatgTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACACATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGTTaaa < 1:1090854/148‑1 (MQ=9) tcctttaTCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGACGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAatctatct > 1:941289/7‑148 (MQ=17) tcctttaTCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAatctatct > 2:1657044/7‑148 (MQ=12) tcctttaTCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAatctatct > 1:4352779/7‑148 (MQ=12) cctttaTCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTAtctc < 2:2913883/143‑1 (MQ=12) cctttaTCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTAtctc > 1:102600/6‑148 (MQ=14) ctttaTCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCa > 2:663862/5‑148 (MQ=12) tttaTCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGCTAGATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCat < 2:1355638/145‑1 (MQ=12) ttaTCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCata > 2:1980306/3‑148 (MQ=17) ttaTCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCata < 1:1449600/146‑1 (MQ=12) aTCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATc < 1:1315989/148‑1 (MQ=17) tcttctCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATcc > 2:2439588/1‑148 (MQ=17) cttctcAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCa < 1:1477821/148‑1 (MQ=18) ttctcAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATAAAAAAATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCAt < 1:2086698/148‑1 (MQ=17) tctcaatcAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCAtt > 2:2704041/8‑148 (MQ=18) caatcAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCAttgaa < 1:672976/144‑4 (MQ=17) aatcAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCAttgaac > 1:2305122/4‑144 (MQ=18) atcAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAGTCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATGTATCTCATATCCAttgaaca > 2:1406750/3‑143 (MQ=16) tcAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCAttgaacaa < 1:2803405/147‑7 (MQ=18) cAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCAttgaacaaa > 2:3718508/1‑141 (MQ=18) tctttttCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTGAACAAAtta > 2:3157687/4‑146 (MQ=18) tctttttCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTGAACAAAtta < 2:2573369/145‑3 (MQ=18) tctttttCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTGAACAAAtta > 1:3337314/4‑146 (MQ=18) tctttttCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTGAACAAAtta > 1:3198564/4‑146 (MQ=16) ttttCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTGAACAAAttataa < 2:3326064/148‑6 (MQ=18) tcaaaTCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTGAACAAATTATAAata > 1:381427/4‑148 (MQ=12) aaTCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTGAACAAATTATAAatattt < 1:1968328/148‑3 (MQ=17) agctacAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTGAACAAATTATAAATATTTCCTa > 2:1896796/6‑148 (MQ=17) ttacAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTGAACAAATTATAAATATTTCCTaaa > 2:4111216/4‑148 (MQ=17) ctacAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTGAACAAATTATAAATATTTCCTaaa > 2:3091180/4‑148 (MQ=12) ctacAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTGAACAAATTATAAATATTTCCTaaa > 2:2776430/4‑148 (MQ=12) ctacAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTGAACAAATTATAAATATTTCCTaaa > 1:4124523/4‑148 (MQ=17) acAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTGAACAAATTATAAATATTTCCTaaata > 2:4570922/2‑146 (MQ=12) cAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTGAACAAATTATAAATATTTCCTaaataa > 1:107855/1‑145 (MQ=12) cAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTGAACAAATTATAAATATTTCCTaaataa < 2:2294473/148‑1 (MQ=17) | TGAAATGGGGGGCATTTGCGACTGGGGAATTAACTGAAGCCCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGAAGATAAGATAATTCAAGCATTACCACATCATCTCGTGCTTCATCTTCTTAACCAGTCCTTTTCTAATCAGGTGCAAATTAAAATTCAATATCAAGCCAAAGATAAATTAACTGAAGTCTATGGTAATGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTAAGCAAATCGTAAATATATCATAAAAAAA > CP043523/1885839‑1886130 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |