| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 365527 = | 20 (0.070) | 252 (0.880) | 124/178 | 0.4 | 68.0% | coding (3/3075 nt) | lacZ | beta‑D‑galactosidase |
| ? | NC_000913 | 4589230 = | 218 (0.770) | coding (4/1656 nt) | tsr | methyl‑accepting chemotaxis protein I | |||||
Only 100 of 279 total aligned reads displayed.
TCATTAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/365621‑365527‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCTTTAATGC > NC_000913/4589230‑4589321 CATTAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTAT < 1:1790268/93‑1 TTAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGT > 2:6422532/1‑93 AGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTA > 1:1751211/1‑93 GCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAA < 1:1224369/93‑1 GCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAA < 1:3517652/93‑1 GCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAA < 1:5411807/93‑1 CACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAA < 2:4405026/93‑1 ACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAAC < 2:2771950/93‑1 CCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACG > 1:7153941/1‑93 CCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACG > 2:4474056/1‑93 CCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTA > 1:1137480/1‑93 CCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTA < 2:4588497/93‑1 CCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTA > 1:1411695/1‑93 CAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTAT < 2:5916469/93‑1 CAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTAT < 2:4511458/93‑1 AGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATC > 1:3691409/1‑93 AGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATC < 1:45200/93‑1 AGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATC > 1:3368412/1‑93 AGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATC < 2:7272671/93‑1 GGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCA > 1:7371730/1‑93 GCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAA < 2:4926366/93‑1 CTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAA < 1:2200182/93‑1 TTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAA < 2:6345343/93‑1 TTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAA < 1:2993321/93‑1 TTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAA > 2:331824/1‑93 TTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATAAAAA < 2:513801/93‑1 TTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCGAAAT > 2:3984617/1‑93 TTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAAT > 2:1461622/1‑93 TACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATT > 1:4898022/1‑93 TACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATT < 2:1423659/93‑1 TACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATT < 1:2709433/93‑1 ACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTG < 1:1893689/93‑1 ACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTG > 2:7429835/1‑93 TTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACC > 1:4071325/1‑93 TATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCA > 2:2026012/1‑93 ATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAG < 2:17401/93‑1 TGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGC < 1:4310838/93‑1 TGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGC > 1:5598297/1‑93 GCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCT > 2:2569782/1‑93 TTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTA < 2:5270583/93‑1 TTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTA > 2:3729243/1‑93 TTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTA > 2:5650397/1‑93 TCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTAC > 1:617225/1‑93 CGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTG > 2:6117110/1‑93 GGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGC > 1:4870486/1‑93 GCTCGTCTGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCT > 2:7094963/1‑93 CTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTG > 2:6246156/1‑93 CTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTG < 2:4832340/93‑1 TCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGG > 1:6367540/1‑93 CGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGT < 2:3797320/93‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |