| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 365527 = | 0 (0.000) | 318 (1.070) | 134/178 | 0.1 | 69.6% | coding (3/3075 nt) | lacZ | beta‑D‑galactosidase |
| ? | NC_000913 | 4589230 = | 278 (0.930) | coding (4/1656 nt) | tsr | methyl‑accepting chemotaxis protein I | |||||
Only 100 of 366 total aligned reads displayed.
TCATTAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/365621‑365527‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCTTTAATGC > NC_000913/4589230‑4589321 TCATTAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTA > 2:4498121/1‑93 CATTAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTTTGGGATTGTGAGCGGCTAACCATTTCACACAGGAAACAGCTAT > 1:4454601/1‑93 ATTAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATG < 1:7609166/93‑1 ATTAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATG > 1:1948681/1‑93 ATTAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATG < 1:4280322/93‑1 ATTAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATG > 1:4154733/1‑93 TAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTT < 1:128125/93‑1 TAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTT < 2:2576402/93‑1 AGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTA < 2:4681594/93‑1 GGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAA > 1:7226677/1‑93 GCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAA < 1:1149203/93‑1 CACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAA < 2:3698963/93‑1 ACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAAC > 1:926417/1‑93 CCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACG > 1:977385/1‑93 CCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACG > 2:429978/1‑93 CCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTA > 1:1001278/1‑93 CCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTA > 1:3918619/1‑93 CAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTAT > 2:3048472/1‑93 cGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATC < 2:2421515/92‑1 AGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATC > 2:4838636/1‑93 GGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACAAAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCA < 2:1644714/93‑1 GCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAA > 1:4578247/1‑93 GCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGATATGTTAAAACGTATCAA < 2:1999988/93‑1 CTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAA > 1:667141/1‑93 CTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAA > 1:3549427/1‑93 TTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAA > 2:712636/1‑93 TTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAA > 1:4054022/1‑93 ACACTTTGTGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTG < 2:81252/93‑1 ACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTG < 2:3343524/93‑1 CACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGT < 1:6171701/93‑1 CACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGT < 2:1161529/93‑1 ACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTG < 1:6781021/93‑1 CTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGA < 2:5476346/93‑1 TTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGAC > 1:131552/1‑93 TTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCTGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTA < 2:1062704/93‑1 TTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTA > 2:4895354/1‑93 TTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTA < 1:3429162/93‑1 TCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTAC < 1:2262612/93‑1 gtCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGC < 2:5256881/91‑1 GGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGC > 2:293384/1‑93 GGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGC > 2:6470606/1‑93 GCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCT > 1:5483557/1‑93 GCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCT < 1:3304908/93‑1 CTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTG > 1:2533522/1‑93 CTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTG < 1:3860602/93‑1 TCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGG > 1:6991191/1‑93 TCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGG > 1:1647/1‑93 TCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGG > 1:2858977/1‑93 CGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGT > 2:2726570/1‑93 CGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGT > 1:312307/1‑93 CGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGT < 2:6806754/93‑1 GTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTT > 1:4798163/1‑93 TATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACCCAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTT < 1:3716014/93‑1 TATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTT < 1:5581545/93‑1 TATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTT < 2:7580196/93‑1 TATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTT > 1:2659474/1‑93 ATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTT < 2:7355969/93‑1 TGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTG > 2:1262774/1‑93 TGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTG > 1:3812594/1‑93 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |