| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 279335 | NA (NA) | 296 (0.960) | 130/184 | 0.3 | 97.4% | coding (252/339 nt) | b4505 | hypothetical protein |
| ? | NC_000913 | 370982 = | 8 (0.030) | coding (535/882 nt) | mhpC | 2‑hydroxy‑6‑ketonona‑2,4‑dienedioic acid hydrolase | |||||
Only 100 of 303 total aligned reads displayed.
CAGCTAAACAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGATCTCGGCCTGAGCATCTGACTGTTCTTT > NC_000913/279245‑279427 | aGCTAAACAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTAcagca < 2:6892746/93‑1 (MQ=32) aGCTAAACAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTAcagca < 2:362192/93‑1 (MQ=32) gCTAAACAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTAcagcag < 2:1215223/93‑1 (MQ=33) tAAACAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCt < 1:103108/93‑1 (MQ=34) aacaacAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAATGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCttt > 1:3609980/1‑93 (MQ=37) aacaacAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCttt < 1:7621239/93‑1 (MQ=38) acaacaGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCtttt < 1:7572012/93‑1 (MQ=38) acaacaGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCtttt > 2:249735/1‑93 (MQ=37) acaacaGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCtttt < 2:4214201/93‑1 (MQ=38) acaacaGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCtttt > 2:7348704/1‑93 (MQ=37) aacaGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCtttttt > 1:2331115/1‑93 (MQ=37) aacaGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCtttttt < 2:674540/93‑1 (MQ=39) caGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTa < 2:2034511/93‑1 (MQ=255) gACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAat < 1:2651556/93‑1 (MQ=255) gACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAat < 1:6294995/93‑1 (MQ=255) ccGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAatat < 1:5015788/93‑1 (MQ=255) cGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATg < 1:7473198/93‑1 (MQ=255) cGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATg < 1:7031381/93‑1 (MQ=255) agaAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTc > 1:2968245/1‑93 (MQ=255) aaaGGCACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTccc > 2:3607073/1‑93 (MQ=255) aaGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCg > 1:2580883/1‑93 (MQ=255) aGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGt < 1:804940/93‑1 (MQ=255) acTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTtcgt > 2:2819255/1‑93 (MQ=255) cTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTtcgtc < 1:6717906/93‑1 (MQ=255) cTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTtcgtc < 1:3193401/93‑1 (MQ=255) cTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGGGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTtcgtc > 2:7183529/1‑93 (MQ=255) tGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTtcgtcg < 1:5946349/93‑1 (MQ=255) tGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTtcgtcg < 1:5795578/93‑1 (MQ=255) tGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTtcgtcg < 1:5557954/93‑1 (MQ=255) gAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCgg > 1:419444/1‑93 (MQ=255) gTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTACTATGTCCCGTTCGTCGGTaa > 1:4038904/1‑93 (MQ=255) gTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTaa > 2:7261186/1‑93 (MQ=255) ttCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAAc > 1:6452793/1‑93 (MQ=255) ttCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAAc < 1:4639489/93‑1 (MQ=255) tCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAAcc < 2:5208972/93‑1 (MQ=255) tCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAAcc < 2:6642729/93‑1 (MQ=255) cAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAAccc < 1:2184414/93‑1 (MQ=255) cAAAACACCGAAAGAGAGAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGGTTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAAccc > 2:3490014/1‑93 (MQ=255) aaaaCACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCg > 2:2962683/1‑93 (MQ=255) aaaaCACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCg > 1:4228553/1‑93 (MQ=255) aaCACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGtt > 1:4902589/1‑93 (MQ=255) aaCACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGtt < 2:3077111/93‑1 (MQ=255) acacCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGttt < 2:5994264/93‑1 (MQ=255) cacCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTTTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTc < 1:6531302/93‑1 (MQ=255) cacCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGC‑TTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCa < 1:4414321/93‑1 (MQ=255) ccGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAg < 1:3351470/93‑1 (MQ=255) ccGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAg > 1:4059563/1‑93 (MQ=255) cGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGc > 2:485222/1‑93 (MQ=255) aaaGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCGGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGctc > 2:6377525/1‑93 (MQ=255) aaaGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGctc > 1:6395249/1‑93 (MQ=255) aaaGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGctc > 2:5430156/1‑93 (MQ=255) aaaGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGctc > 1:2777575/1‑93 (MQ=255) aaGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGctct > 2:3525589/1‑93 (MQ=255) aaGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGctct > 1:3811609/1‑93 (MQ=255) agagATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTCAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCtt < 2:2246338/93‑1 (MQ=255) gagaTAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCttt < 1:2905146/93‑1 (MQ=255) gaTAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCt > 1:1086835/1‑93 (MQ=255) gaTAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCt > 1:7266211/1‑93 (MQ=255) gaTAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCt > 1:7197050/1‑93 (MQ=255) gaTAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCt > 1:4297532/1‑93 (MQ=255) gaTAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCt < 1:6908470/93‑1 (MQ=255) aTAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTg < 1:1741022/93‑1 (MQ=255) tAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTgg < 1:6118221/93‑1 (MQ=255) aaTTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGga < 1:3121379/93‑1 (MQ=255) aTTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGgag > 2:242087/1‑93 (MQ=255) ttGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGgaga < 2:5614861/93‑1 (MQ=255) gAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGAcg > 1:1658334/1‑93 (MQ=255) aaaGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGAcgg < 1:1929301/93‑1 (MQ=255) aaaGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGAcgg < 2:4722987/93‑1 (MQ=255) aaGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGAcggc < 1:5260875/93‑1 (MQ=255) aaGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGAcggc > 1:2503705/1‑93 (MQ=255) gggTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGa < 1:683689/93‑1 (MQ=255) ggTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGAt < 1:3746255/93‑1 (MQ=255) gtgtTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGAtc < 1:1533779/93‑1 (MQ=255) gtgtTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGAtc < 1:4516330/93‑1 (MQ=255) gtTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGAtctc < 1:497496/93‑1 (MQ=255) ttGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGATCTCg > 1:5729378/1‑93 (MQ=255) gCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGATCTCGGc > 2:7871544/1‑93 (MQ=255) cATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGATCTCGGcc < 1:1835628/93‑1 (MQ=255) aTTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGATCTCGGCCt < 2:1522946/93‑1 (MQ=255) aTTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGATCTCGGCCt > 2:5783702/1‑93 (MQ=255) ttGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGATCTCGGCCTg < 1:535748/93‑1 (MQ=255) ttGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGATCTCGGCCTg > 1:6984432/1‑93 (MQ=255) gACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGATCTCGGCCTGAg < 1:3023938/93‑1 (MQ=255) aCAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGATCTCGGCCTGAGc < 2:827888/93‑1 (MQ=255) aCAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGATCTCGGCCTGAGc > 1:4370334/1‑93 (MQ=255) cAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGCTCTCGGCCTGAGCa > 1:7770152/1‑93 (MQ=255) cAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGATCTCGGCCTGAGCa < 2:5931619/93‑1 (MQ=255) gATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGATCTCGGCCTGAGCATc < 2:7691506/93‑1 (MQ=255) tGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGATCTCGGCCTGAGCATCTGa < 2:3162136/93‑1 (MQ=255) tGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGATCTCGGCCTGAGCATCTGa < 2:2769890/93‑1 (MQ=255) tGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGATCTCGGCCTGAGCATCTGa > 2:2731126/1‑93 (MQ=255) gAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGATCTCGGCCTGAGCATCTGAc > 2:126403/1‑93 (MQ=255) tCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGATCTCGGCCTGAGCATCTGACTGt > 1:5155609/1‑93 (MQ=255) tACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGATCTCGGCCTGAGCATCTGCCTGttt > 1:38453/1‑92 (MQ=255) tACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGATCTCGGCCTGAGCATCTGACTGTTc < 2:1321767/93‑1 (MQ=255) aCAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGATCTCGGCCTGAGCATCTGACTGTTCt > 1:1376314/1‑93 (MQ=255) cagcagCTTTTTTTACTATATCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGATCTCGGCCTGAGCATCTGACTGTTCtt < 2:7046533/93‑1 (MQ=255) agcagcTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGATCTCGGCCTGAGCATCTGACTGTTCttt < 2:1139144/93‑1 (MQ=255) agcagcTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGATCTCGGCCTGAGCATCTGACTGTTCttt > 2:1025273/1‑93 (MQ=255) | CAGCTAAACAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGATCTCGGCCTGAGCATCTGACTGTTCTTT > NC_000913/279245‑279427 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |