Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC | NC_000913 | 3,951,167 | +GCG | coding (36/1818 nt) | ilvD → | dihydroxyacid dehydratase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 3951166 | 10 (0.060) | 133 (0.750) +GGC |
76/176 | 0.7 | 93.2% | coding (35/1818 nt) | ilvD | dihydroxyacid dehydratase |
? | NC_000913 | 3951167 = | 10 (0.050) | coding (36/1818 nt) | ilvD | dihydroxyacid dehydratase |
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
AGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3951075‑3951166 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACGTCC > NC_000913/3951167‑3951252 ||| AGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGGCGGGCGCTGTGGG > 1:862998/1‑93 CACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCGCCac < 2:2359060/93‑3 CTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGGCGTGGGGCGCCgccg > 1:4101370/1‑89 GGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGA < 1:2582171/93‑1 GGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAA < 1:2016868/93‑1 GGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAA < 1:1862416/93‑1 GGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTTGGGTGTGGCGCGCCCCCCGGA > 2:818375/1‑93 GAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCTGCCTCCACCACTCATGGTCGTAATATGTCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAAT < 2:4352926/93‑1 GAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAAT < 2:2733213/93‑1 GAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAAT < 1:1710014/93‑1 GTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTTATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGA < 1:2514428/93‑1 GTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGA < 1:1461103/93‑1 GTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGA < 2:3442597/93‑1 GTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGCTGTGGGGCGCCACCCGGgcga > 2:3198068/1‑89 AAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACC < 1:2580357/93‑1 ATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGA < 1:3774570/93‑1 ATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGA < 2:2552032/93‑1 ATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGA < 2:4441387/93‑1 TAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGAC < 2:150120/93‑1 AAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACG < 1:426568/93‑1 AAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGC < 1:2597083/93‑1 AAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGC < 2:4202934/93‑1 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1:2078426/93‑1 CTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCG < 1:4581764/93‑1 TAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGGGCTGTGGGGCGCCCCCCGGAA‑GACCGGCGCCGCTTTtcg > 2:3879453/1‑90 AAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGT < 1:653542/93‑1 GTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAA < 1:1285815/93‑1 GTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAA < 2:2820909/93‑1 GTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAA < 2:3576927/93‑1 GTACCATTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAA < 2:713075/93‑1 TACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAG < 1:2253934/93‑1 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1:2298397/93‑1 GCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATC < 2:4027100/93‑1 GCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATC < 2:675469/93‑1 CACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGC < 2:2770848/93‑1 CCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGG < 2:2466285/93‑1 CACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGT < 2:342621/93‑1 ACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTT < 2:575273/93‑1 CCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTG < 1:2823594/93‑1 CACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGT < 1:4365435/93‑1 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |