| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 269765 = | NA (NA) | 188 (1.030) | 106/184 | 0.2 | 96.9% | coding (300/405 nt) | yi91a | hypothetical protein |
| ? | NC_000913 | = 370983 | 6 (0.030) | coding (536/882 nt) | mhpC | 2‑hydroxy‑6‑ketonona‑2,4‑dienedioic acid hydrolase | |||||
Only 100 of 180 total aligned reads displayed.
TCCCCCATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTACAGCAGAGGAAA > NC_000913/269673‑269854 | tCCCCCATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACt < 2:1749655/93‑1 (MQ=255) cccccATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTg < 2:4426831/93‑1 (MQ=255) cATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGa < 2:443281/93‑1 (MQ=255) aTTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGAt < 1:2827375/93‑1 (MQ=255) ccccGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCaa > 2:4240154/1‑93 (MQ=255) cccGGGACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAAt > 2:3053967/1‑93 (MQ=255) cccGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAAt < 2:695521/93‑1 (MQ=255) ccGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAAtt < 1:1750142/93‑1 (MQ=255) ccGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAAtt > 1:3711263/1‑93 (MQ=255) ccGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAAtt > 1:4619732/1‑93 (MQ=255) cGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTg < 2:2289307/93‑1 (MQ=255) cGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTg < 2:3667627/93‑1 (MQ=255) cGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTg < 1:545098/93‑1 (MQ=255) gAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGt > 1:4560205/1‑93 (MQ=255) 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tCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGtt > 2:3881163/1‑93 (MQ=255) tGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAAAATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTAAATTGGTCAACGCAACAGTTAtgt < 1:4257916/93‑1 (MQ=255) gAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTAtgtg < 1:1188844/93‑1 (MQ=255) cTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGaaa < 1:2197369/93‑1 (MQ=255) aGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACa > 2:1857088/1‑93 (MQ=255) aGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACa > 2:2839205/1‑93 (MQ=255) ggAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACAt > 2:3219552/1‑93 (MQ=255) ggAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACAt > 2:1511647/1‑93 (MQ=255) ggAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACAt < 2:4141603/93‑1 (MQ=255) ggAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACAt < 1:2159376/93‑1 (MQ=255) ggAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACAt < 1:1462008/93‑1 (MQ=255) aaaaaGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATgg > 1:2461726/1‑93 (MQ=255) aaaaaGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATgg > 1:1477337/1‑93 (MQ=255) aaaaGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATggg > 1:3838826/1‑93 (MQ=255) aaaGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATgggg < 1:261304/93‑1 (MQ=255) aaaGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATgggg < 1:1995597/93‑1 (MQ=255) aaGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGt < 1:3577581/93‑1 (MQ=255) aaGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGt < 2:2429937/93‑1 (MQ=255) aaGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGt < 1:3828420/93‑1 (MQ=255) gCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTg > 1:4001273/1‑93 (MQ=255) cAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGa < 2:1302402/93‑1 (MQ=255) cAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGa < 2:395276/93‑1 (MQ=255) aaCGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAg > 1:4383603/1‑93 (MQ=255) aCGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAgg > 1:1360132/1‑93 (MQ=255) aCGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAgg > 1:2779615/1‑93 (MQ=255) aCGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAgg < 2:3172392/93‑1 (MQ=255) tATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGttt > 2:3436469/1‑93 (MQ=255) tATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGttt > 2:205050/1‑93 (MQ=255) tATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGttt < 1:302968/93‑1 (MQ=255) aTTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGtttt > 1:1887368/1‑93 (MQ=255) aTTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGtttt < 1:1295818/93‑1 (MQ=255) ttGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGttttt > 2:3421261/1‑93 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |