Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 3,156,257 | (CCA)2→1 | coding (594‑596/930 nt) | yqhG → | hypothetical protein |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 3156257 | 3156259 | 3 | 208 [0] | [0] 209 | yqhG | hypothetical protein |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 3156256 | 0 (0.000) | 201 (1.140) | 111/178 | 0.1 | 100% | coding (593/930 nt) | yqhG | hypothetical protein |
? | NC_000913 | 3156260 = | 0 (0.000) | coding (597/930 nt) | yqhG | hypothetical protein |
Only 100 of 209 total aligned reads displayed.
GCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCACCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATCC > NC_000913/3156170‑3156352 | acagccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGc < 1:2918107‑M2/3‑1 (MQ=255) acagccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGc < 1:1738734‑M2/3‑1 (MQ=255) cagccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCg < 1:901905‑M2/4‑1 (MQ=255) cggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggttttcgactcttaccgccaGGCGGTTa > 2:2220677‑M2/86‑93 (MQ=255) cggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTa > 1:4610779‑M2/86‑93 (MQ=255) cggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTa > 1:2335832‑M2/86‑93 (MQ=255) cggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTa > 2:1505414‑M2/86‑93 (MQ=255) ggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtgcacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTaa < 2:951465‑M2/9‑1 (MQ=255) gaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAAt < 1:986232‑M2/10‑1 (MQ=255) gaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAAt < 1:1600756‑M2/10‑1 (MQ=255) gaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAAt > 2:1986811‑M2/84‑93 (MQ=255) agcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGc < 2:2902832‑M2/12‑1 (MQ=255) cctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCt < 2:1562807‑M2/14‑1 (MQ=255) ctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCtt > 2:1870750‑M2/79‑93 (MQ=255) ctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCtt < 1:848626‑M2/15‑1 (MQ=255) ctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCtt > 1:3018846‑M2/79‑93 (MQ=255) tttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTc > 2:600954‑M2/78‑93 (MQ=255) tttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTc < 2:715287‑M2/16‑1 (MQ=255) ttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCt < 2:2477052‑M2/17‑1 (MQ=255) tgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCta < 1:244751‑M2/18‑1 (MQ=255) gttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCtat < 1:484760‑M2/19‑1 (MQ=255) gccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATaaa > 2:1878459‑M2/72‑93 (MQ=255) cgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAac > 1:1521716‑M2/70‑93 (MQ=255) gatctctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAacc < 1:3851318‑M2/25‑1 (MQ=255) gaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAacc > 2:3729307‑M2/69‑93 (MQ=255) gaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAacc > 2:1372575‑M2/69‑93 (MQ=255) gaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAacc > 2:1430982‑M2/69‑93 (MQ=255) actctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAaccac > 2:2235018‑M2/67‑93 (MQ=255) actctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAaccac > 1:1892642‑M2/67‑93 (MQ=255) ctctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAaccacc > 2:4347004‑M2/66‑93 (MQ=255) ctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCtt > 1:1274669‑M2/64‑93 (MQ=255) ctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCtt > 1:1280534‑M2/64‑93 (MQ=255) tgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCaa > 1:1348385‑M2/61‑93 (MQ=255) gaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAg > 1:1174139‑M2/60‑93 (MQ=255) aacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGa > 1:2502988‑M2/59‑93 (MQ=255) aacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGa > 2:4231972‑M2/59‑93 (MQ=255) acatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGAc < 1:1658721‑M2/36‑1 (MQ=255) acatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGAc < 1:4021053‑M2/36‑1 (MQ=255) acatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGAc < 1:4267225‑M2/36‑1 (MQ=255) atattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGAcgc > 1:3495880‑M2/56‑92 (MQ=255) tattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGc > 2:2365526‑M2/55‑93 (MQ=255) tattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGc > 2:2814446‑M2/55‑93 (MQ=255) tattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGc > 2:2550662‑M2/55‑93 (MQ=255) ttgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCa < 2:3793903‑M2/41‑1 (MQ=255) ttgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCa < 2:4296869‑M2/41‑1 (MQ=255) gcggattatagctggccgcggacgtgggtggtttccgactcctaccgccaGGCTGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCaat > 2:1722541‑M2/51‑93 (MQ=255) ctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCaata > 1:4466338‑M2/50‑93 (MQ=255) tgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCaataa < 2:936763‑M2/45‑1 (MQ=255) tgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCaataa > 1:3351659‑M2/49‑93 (MQ=255) tgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCaataa > 1:3417731‑M2/49‑93 (MQ=255) tgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCaataa > 1:4231408‑M2/49‑93 (MQ=255) gattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACTAACTTCAAGAGGGGCaattat > 2:3716653‑M2/48‑93 (MQ=255) gattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCaataat > 1:938741‑M2/48‑93 (MQ=255) attatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATc > 2:3926656‑M2/47‑93 (MQ=255) ttatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATcc > 1:2116278‑M2/46‑93 (MQ=255) ttatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATcc > 1:3258319‑M2/46‑93 (MQ=255) ttatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGCTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATcc > 2:2418483‑M2/46‑93 (MQ=255) atagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCg > 1:4218065‑M2/44‑93 (MQ=255) tagctggccgtggacgtgggttgtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGa < 2:1595883‑M2/51‑1 (MQ=255) tagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGa > 1:2673940‑M2/43‑93 (MQ=255) tagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGa > 1:2042221‑M2/43‑93 (MQ=255) agctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGAt > 1:3085421‑M2/42‑93 (MQ=255) agctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGAt > 1:3578199‑M2/42‑93 (MQ=255) gctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATg > 1:636869‑M2/41‑93 (MQ=255) gctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATg < 1:52871‑M2/53‑1 (MQ=255) gccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGa > 2:3385901‑M2/37‑93 (MQ=255) cgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGata < 1:442444‑M2/59‑1 (MQ=255) cgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGata < 2:3326047‑M2/59‑1 (MQ=255) tggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATg > 2:78132‑M2/33‑93 (MQ=255) ggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGc < 1:677390‑M2/62‑1 (MQ=255) gacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCa > 1:3100994‑M2/31‑93 (MQ=255) gacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCa < 1:2464500‑M2/63‑1 (MQ=255) cgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCaaa < 2:4607945‑M2/65‑1 (MQ=255) gtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAAt > 1:1430711‑M2/28‑93 (MQ=255) tgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATa > 1:3864452‑M2/27‑93 (MQ=255) tgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATa > 1:254362‑M2/27‑93 (MQ=255) ggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCGATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGa < 2:3830295‑M2/69‑1 (MQ=255) gtggtttccgcctcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGaa < 2:499785‑M2/70‑1 (MQ=255) 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tcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAatttatt < 2:3547047‑M2/82‑1 (MQ=255) cttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAatttattt > 2:111875‑M2/11‑93 (MQ=255) ttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAAtttattta > 2:4564924‑M2/10‑93 (MQ=255) ttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAAtttattta < 1:794216‑M2/84‑1 (MQ=255) ttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAAtttattta > 1:281413‑M2/10‑93 (MQ=255) tacggccaGCCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGcaatttattttc < 2:1812776‑M2/85‑3 (MQ=255) accgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACg < 1:754396‑M2/86‑1 (MQ=255) ccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCGAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGa < 2:4061634‑M2/87‑1 (MQ=255) ccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGa > 2:3436698‑M2/7‑93 (MQ=255) gccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACa > 2:369868‑M2/5‑93 (MQ=255) ccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACaa < 1:1482139‑M2/90‑1 (MQ=255) aGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATc > 1:4567635‑M2/2‑93 (MQ=255) aGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATc < 1:1082871‑M2/92‑1 (MQ=255) ggCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATcc < 1:1026701/93‑1 (MQ=255) | GCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCACCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATCC > NC_000913/3156170‑3156352 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |