| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3650480 | NA (NA) | 12 (0.020) | 5/170 | 43.0 | 1.7% | coding (349/1017 nt) | trs511 | IS5 transposase |
| ? | NC_000913 | = 3914556 | 758 (1.310) | coding (448/1383 nt) | atpD | membrane‑bound ATP synthase, F1 sector, beta‑subunit | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 740 total aligned reads displayed.
ATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATggtggtgcgg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3650386‑3650480‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGGTGCGGGTGTAGGTAAAACCGTAAACATGATGGAGCTCATTCGTAACATCGCGATCGAGCACTCCGGTTACTCTGTGTTTGCGGGCGTAGGTGAACGTACT < NC_000913/3914556‑3914452 ATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATG < 2:10803053/96‑1ATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATG > 2:2670298/1‑96ATCATGACGCCTGCTGCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCTGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATG < 1:4012948/96‑1ATCANGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATG > 2:3647888/1‑96 TCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGG < 1:6873277/96‑1 TCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGG > 1:2144568/1‑96 TCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGAATGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGG < 1:9846383/96‑1 CATGACTCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGT < 2:12364464/96‑1 CATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGtt < 1:7563310/96‑3 CATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGT > 2:11747534/1‑96 CATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGT > 1:1646164/1‑96 CATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGT < 1:8691120/96‑1 CATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGT < 1:7052660/96‑1 CATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGT < 2:3079275/96‑1 CATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGGGGCGGAAATTCATGATGGg > 2:6457794/1‑95 aaGACGCCTGCGTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGGCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTGCAGCAGGGGGCGGAATTTGATGAGGGTG > 1:11660462/3‑96 ATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCATCTATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTG < 2:3433731/96‑1 ATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTG < 1:1368172/96‑1 ATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTG < 1:13500575/96‑1 ATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTG < 1:4215199/96‑1 ATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTG < 2:8945796/96‑1 ATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTG < 2:7065468/96‑1 ATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTG < 1:7975166/96‑1 tgcCGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGG < 2:1056571/93‑1 TGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGGACAATTGGCGGGCCAGGTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGG > 2:13374138/1‑96 TGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGATCAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGG < 1:9623950/96‑1 TGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCATGTGGCGGAAATTCATGATGGTGG > 1:12453669/1‑96 TGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGG < 1:381287/96‑1 TGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGG < 1:2600526/96‑1 TGACGCCTGCTTAGGCCATCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGG < 1:850548/96‑1 TGACGCATGCTTCGCCCAGCCAGCGCTTGACGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTag < 1:11468876/96‑3 acCGCCTCCTCCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGT < 1:12907071/94‑1 GACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGT < 1:9186705/96‑1 GACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGT < 1:7437091/96‑1 GACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGT > 1:5102304/1‑96 GACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAACTCATGTTGGTGGT < 1:13856931/96‑1 GACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGGGGCGGAAATTCATGATGGTGGT > 2:2916418/1‑96 GACGCCTGCTACGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGT < 2:13187843/96‑1 ACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTG < 1:5331230/96‑1 ACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTG < 1:10755045/96‑1 ACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTG < 2:7436802/96‑1 ACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCCCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTG < 2:7740478/96‑1 ACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGACTTGACTAATTGTAGGGCCAGATGATGCTGCTCCAGCAGGAGGCGGAAATTCATGATCGGGGTG > 2:12615445/1‑96 CGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTcc < 1:10287042/96‑3 CGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGC < 2:4920717/96‑1 CGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGC < 1:10421493/96‑1 CGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGC < 1:5497031/96‑1 CGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGC < 2:3287753/96‑1 CGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGC < 2:5571529/96‑1 CGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGC < 2:12982021/96‑1 CGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGC < 1:366847/96‑1 CGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGC < 1:10019929/96‑1 CGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGC < 2:8547815/96‑1 CGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGC < 2:8793591/96‑1 CGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGAGGTGC > 1:11901818/1‑96 gaCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCG > 1:11076541/3‑96 GCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCGGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCG > 2:1794559/1‑96 GCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCG > 2:1662640/1‑96 GCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCG < 2:3924134/96‑1 GCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCG > 2:9537585/1‑96 GCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCG > 2:1997752/1‑96 GCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCG < 2:9367088/96‑1 GCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCG > 2:6831343/1‑96 GCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCG < 2:6101590/96‑1 GCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCG > 2:5276669/1‑96 GCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCG < 2:449178/96‑1 GCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCG > 2:4262497/1‑96 GCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCG < 1:1268004/96‑1 GCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCG > 2:1210861/1‑96 GCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCG > 1:1876808/1‑96 GCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCG < 1:2396911/96‑1 GCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCG > 1:449994/1‑96 GCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCG > 1:6059490/1‑96 GCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGAGGTGCG > 1:6489594/1‑96 GCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATGCATGATGGAGGAGCG > 2:13601586/1‑96 GCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGGGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCG > 2:7992066/1‑96 CCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGGTGGGCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGAGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGG > 2:8206963/1‑96 CCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGG < 1:626615/96‑1 CCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGG < 1:10880330/96‑1 CCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGG > 1:14210950/1‑96 CCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGG < 1:3323444/96‑1 CCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGG > 2:10285060/1‑96 CCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGG < 1:9433507/96‑1 CTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGGGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGG > 1:4657113/1‑96 TGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGGc > 1:12142619/1‑95 TTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGGGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGGGccgg > 1:4914199/1‑92 aCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGG > 2:14367950/2‑82 GGTGGTGCGGGTGTAGGTAAAACCGTAAACATGATGGAGCTCATTCGTAACATCGCGATCGAGCACTCCGGTTACTCTGTGTTTGCGGGCGTAGGT > 2:11285194/1‑96 GTGGTGCGGGTGTAGGTAAAACCGTAAACATGATGGAGCTCATTCGTAACATCGCGATCGAGCACTCCGGTTACTCTGTGTTTGCGGGCGTAGGTG > 2:13764840/1‑96 GTGGTGCGGGTGTAGGTAAAACCGTAAACATGATGGAGCTCATTCGTAACATCGCGATCGAGCACTCCGGTTACTCTGTGTTTGCGGGCGTAGGTG > 1:3128773/1‑96 TGGGGCGGGTGTAGGTAAAACCGTAAACATGATCGAGCTCATTCGTAACATCGCGATCGAGCACTCCGGTTACTCTGTGTTTGCGGGCGTAGGTGA > 2:14082152/1‑96 GGTGCGGGTGTAGGTAAAACCGTAAACATGATGGAGCTCATTCGTAACATCGCGATCGAGCACTCCGGTTACTCTGTGTTTGCGGGCGTAGGTGAA < 1:14395099/96‑1 GTGCGGGTGTAGGTAAAACCGTAAACATGATGGAGCTCATTCGTAACATCGCGATCGAGCACTCCGGTTACTCTGTGTTTGCGGGCGTAGGTGAAC < 1:9035502/96‑1 GTGCGGGTGTAGGTAAAACCGTAAACATGATGGAGCTCATTCGTAACATCGCGATCGAGCACTCCGGTTACTCTGTGTTTGCGGGCGTAGGTGAAC > 1:5687707/1‑96 GTGCGGGTGTAGGTAAAACCGTAAACATGATGGAGCTCATTCGTAACATCGCGATCGAGCACTCCGGTTACTCTGTGTTTGCGGGCGTAGGTGAAC > 2:4112872/1‑96 CGGGTGTAGGTAAAACCGTAAACATGATGGAGCTCATTCGTAACATCTCGATCGAGCACTCCGGTTACTCTGTGTTTGCGGGCGTAGGTGAACGTA < 2:1003171/96‑1 CGGGTGTAGGTAAAACCGTAAACATGATGGAGCTCATTCGTAACATCGCGATCGAGCACTCCGGTTACTCTGTGTTTGCGGGCGTAGGTGAACGTA > 2:232299/1‑96 CGGGTGTAGGTAAAACCGTAAACATGATGGAGCTCATTCGTAACATCGCGATCGAGCACTCCGGTTACTCTGTGTTTGCGGGCGTAGGTGAACGTA > 1:8204959/1‑96 GGGTGTAGGTAAAACCGTAAACATGATGGAGCTCATTCGTAACATCGCGATCGAGCACTCCGGTTACTCTGTGTTTGCGGGCGTAGGTGAACGTAC > 1:7744991/1‑96 GGGTGTAGGTAAAACCGTAAACATGATGGAGCTCATTCGTAACATCGCGATCGAGCACTCCGGTTACTCTGTGTTTGCGGGCGTAGGGGAACGTAC > 2:11096283/1‑96 ATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGGCGGGCCAGTTGATGCTGCTCCAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATggtggtgcgg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3650386‑3650480‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGGTGCGGGTGTAGGTAAAACCGTAAACATGATGGAGCTCATTCGTAACATCGCGATCGAGCACTCCGGTTACTCTGTGTTTGCGGGCGTAGGTGAACGTACT < NC_000913/3914556‑3914452 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |