| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 365527 = | 0 (0.000) | 498 (1.330) | 162/178 | 0.0 | 63.4% | coding (3/3075 nt) | lacZ | beta‑D‑galactosidase |
| ? | NC_000913 | 4589230 = | 576 (1.540) | coding (4/1656 nt) | tsr | methyl‑accepting chemotaxis protein I | |||||
Only 100 of 564 total aligned reads displayed.
TCATTAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/365621‑365527‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCTTTAATGC > NC_000913/4589230‑4589321 TCATTAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTA > 1:10020551/1‑93TCATTAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTA < 2:9091361/93‑1 ATTAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATG < 2:344961/93‑1 ATTAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATG < 2:5654677/93‑1 TTAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGT > 1:9611220/1‑93 TAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTT > 2:5260154/1‑93 TAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGATTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTT < 1:5462450/93‑1 AGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTA > 1:2022370/1‑93 AGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTA > 2:5095272/1‑93 AGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTA > 2:2326231/1‑93 GGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAA < 2:3299965/93‑1 GGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAA > 1:3760761/1‑93 GCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAA < 1:14520/93‑1 gACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAA < 1:1253838/92‑1 CACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAA > 2:8840145/1‑93 CACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAA < 1:5594917/93‑1 ACCCCAGGGTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAAC > 1:4189955/1‑93 ACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAAC > 1:7680273/1‑93 CCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACG > 1:9175926/1‑93 CCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACG > 2:2173231/1‑93 CCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTA < 1:876358/93‑1 CAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTAT > 2:2742623/1‑93 GGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCA < 1:2613173/93‑1 GGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCA > 1:4161153/1‑93 GCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAA < 1:3527877/93‑1 CTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAA > 2:6146770/1‑93 TTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAAT > 2:1554736/1‑93 TACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATT < 2:8359265/93‑1 TACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATT > 1:7484025/1‑93 ACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGATATGTTAAAACGTATCAAAATTG > 2:7228726/1‑93 CACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGT < 1:1095764/93‑1 ACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTG < 2:8608981/93‑1 CTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGA < 1:2173231/93‑1 ggTATGCTTCCGGGTCTGATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAAGTTCACTCAGGAACCAGCTAGGTTAAAACGTATCAAAATTGTGAC < 2:3224762/91‑1 TATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAGCAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCA < 1:4057163/93‑1 ATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAG < 2:5366430/93‑1 TGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGC > 1:4448367/1‑93 GCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCT < 2:8171059/93‑1 GCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCT > 2:7842126/1‑93 GCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCT < 2:5347445/93‑1 CTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTT > 2:6316836/1‑93 TTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTA > 2:1877876/1‑93 TTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTA < 1:1885061/93‑1 TCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTAC < 1:8339110/93‑1 TCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTAC < 1:9450995/93‑1 CGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTG > 1:158618/1‑93 GCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGAATC‑AAATTTTGACCAAGTTACTTCTG > 1:7212396/1‑93 TCGTATGTTGTGTGGAATTGCGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGAGCAGCTTACTGCTGG > 2:4865533/1‑93 GTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTT < 1:864401/93‑1 ATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTT < 2:6232097/93‑1 TGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTG > 1:8017229/1‑93 TGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTG > 1:6810883/1‑93 TGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTG > 1:2953566/1‑93 GTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAGACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGG > 2:5909594/1‑93 GTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGG > 2:9333426/1‑93 TTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGC < 2:9442282/93‑1 GTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTT > 2:3680920/1‑93 GTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTT > 1:6105573/1‑93 GGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTT < 2:4010850/93‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |