| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 365527 = | 0 (0.000) | 498 (1.330) | 162/178 | 0.0 | 63.4% | coding (3/3075 nt) | lacZ | beta‑D‑galactosidase |
| ? | NC_000913 | 4589230 = | 576 (1.540) | coding (4/1656 nt) | tsr | methyl‑accepting chemotaxis protein I | |||||
Only 100 of 1131 total aligned reads displayed.
ATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCTTTAATGCC > NC_000913/4589138‑4589322 | ttCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGtt > 1:7241092/1‑93 (MQ=255) ggcaccccaggctttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTaa > 1:3760761‑M2/90‑93 (MQ=255) cgccccaggctttacactttatgcgtccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTaaaa < 2:1602034‑M2/6‑1 (MQ=255) caccccaggctttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTaaaa < 1:1331691‑M2/6‑1 (MQ=255) tCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAAc < 2:3588207/93‑1 (MQ=255) cccaggctttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGt > 1:16752‑M2/85‑93 (MQ=255) ccaggctttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTa < 2:532304‑M2/10‑1 (MQ=255) tAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCa > 2:401999/1‑93 (MQ=255) tAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCa > 2:2837692/1‑93 (MQ=255) tAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCa > 1:9080531/1‑93 (MQ=255) aaTCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCaa < 2:4405779/93‑1 (MQ=255) tttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCaaaa > 2:7796618‑M2/78‑93 (MQ=255) ttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAAt > 1:8468052‑M2/77‑93 (MQ=255) cgcgGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCCTGTTAAAACGAATCAAAATtgt > 2:102756/1‑93 (MQ=255) gggATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGAc < 1:209592/93‑1 (MQ=255) ggATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGAcc > 1:9723127/1‑93 (MQ=255) ggATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGAcc > 2:9551194/1‑93 (MQ=255) gATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCa > 1:3899890/1‑93 (MQ=255) gATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCa < 2:9270516/93‑1 (MQ=255) atgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAg > 2:8108736‑M2/68‑93 (MQ=255) tatTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGc > 2:8330433/1‑93 (MQ=255) ttCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCtt > 1:7889959/1‑93 (MQ=255) cttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCtt < 1:4258749‑M2/29‑1 (MQ=255) cttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCtt > 2:9421661‑M2/65‑93 (MQ=255) tCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTa > 1:5684041/1‑93 (MQ=255) tCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTa < 2:704083/93‑1 (MQ=255) tccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTAc < 2:8434334‑M2/31‑1 (MQ=255) tccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTAc < 1:9450995‑M2/31‑1 (MQ=255) cATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTAc > 1:7486735/1‑93 (MQ=255) ccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTAct < 2:121610‑M2/32‑1 (MQ=255) ccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTAct > 1:151444‑M2/62‑93 (MQ=255) tAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTActg > 1:7085253/1‑93 (MQ=255) aaaGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTActgc < 1:9583802/93‑1 (MQ=255) gctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTActgct > 1:5446519‑M2/59‑93 (MQ=255) tcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTgg > 2:4865534‑M2/57‑93 (MQ=255) cgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGt < 2:2672798‑M2/38‑1 (MQ=255) tttcttttccAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGttt < 1:454322/93‑1 (MQ=255) tgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTg > 1:3080367‑M2/52‑93 (MQ=255) tcctttccAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTg > 2:7200376/1‑93 (MQ=255) cctttccAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTgg > 1:10022296/1‑93 (MQ=255) cctttccAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTgg > 2:2493178/1‑93 (MQ=255) tgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGcc > 1:3548952‑M2/49‑93 (MQ=255) tgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGcc > 2:6147602‑M2/49‑93 (MQ=255) tccAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGt < 1:4956842/93‑1 (MQ=255) cAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGttt < 2:7382551/93‑1 (MQ=255) ggCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGttttt > 2:1881614/1‑93 (MQ=255) gaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGttttt < 1:4168551‑M2/51‑1 (MQ=255) gCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTg < 2:9050680/93‑1 (MQ=255) ccGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTgg > 1:648520/1‑93 (MQ=255) ccGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTgg > 2:5018738/1‑93 (MQ=255) gAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGcc > 2:470221/1‑93 (MQ=255) aaaaTCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCt > 1:6776570/1‑93 (MQ=255) aaaTCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACAAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCtt > 1:2333731/1‑93 (MQ=255) aaTCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCttt < 2:9782836/93‑1 (MQ=255) aaTCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCttt < 1:6000823/93‑1 (MQ=255) aTCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCtttt > 2:5121434/1‑93 (MQ=255) gcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTa < 2:1687001‑M2/60‑1 (MQ=255) cggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGAATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTAc > 1:3382105‑M2/33‑93 (MQ=255) ttGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACa < 2:5673694/93‑1 (MQ=255) gataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACaa > 1:986850‑M2/31‑93 (MQ=255) taacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACt > 1:1101873‑M2/29‑93 (MQ=255) taacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACt < 2:3829177‑M2/65‑1 (MQ=255) 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tcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAg < 2:3218700‑M2/73‑1 (MQ=255) tcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAg > 1:5803741‑M2/21‑93 (MQ=255) cacaGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCCGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAg > 1:6343793/1‑93 (MQ=255) cacaGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAg > 2:2171262/1‑93 (MQ=255) cacaGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAg > 2:5373183/1‑93 (MQ=255) cacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAgg < 1:470108‑M2/74‑1 (MQ=255) acacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCaggg > 2:796862‑M2/19‑92 (MQ=255) aaaGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTc < 1:7342583/93‑1 (MQ=255) 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agctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCtt > 1:5209434‑M2/8‑93 (MQ=255) agctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCtt < 1:1790308‑M2/86‑1 (MQ=255) tatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCTTTaa > 1:4047478‑M2/5‑93 (MQ=255) tatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCTTTaa < 1:8971842‑M2/89‑1 (MQ=255) tatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCTTTaa < 1:2754276‑M2/89‑1 (MQ=255) cATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCTTTaa < 2:5888431/93‑1 (MQ=255) cATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCTTTaa < 1:8863663/93‑1 (MQ=255) cATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCTTTaa > 1:7032338/1‑93 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |