Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC | NC_000913 | 3,951,167 | +GCG | coding (36/1818 nt) | ilvD → | dihydroxyacid dehydratase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 3951166 | 33 (0.090) | 275 (0.740) +GGC |
102/176 | 1.3 | 89.5% | coding (35/1818 nt) | ilvD | dihydroxyacid dehydratase |
? | NC_000913 | 3951167 = | 33 (0.090) | coding (36/1818 nt) | ilvD | dihydroxyacid dehydratase |
Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
AGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3951079‑3951166 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACGTCC > NC_000913/3951167‑3951252 ||| gatACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGGGCTGGGGCGCGCC > 2:2793005/4‑93 CTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCGCCaccg < 1:3240686/93‑5 TGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGG < 1:9032369/93‑1 TGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGG < 2:9530520/93‑1 GGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGA < 1:217125/93‑1 GGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAA < 2:9332332/93‑1 GGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAA < 1:143349/93‑1 GGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAA < 1:4728966/93‑1 GAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAAT < 2:8838398/93‑1 GAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAAGATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAAT < 1:8188208/93‑1 AGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATG < 2:4771632/93‑1 AGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATG < 1:7159915/93‑1 GTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCGCTGTGGGGGGCCCCCCGGAtga > 2:5763518/1‑90 TAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGAC < 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AGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCC < 2:4201615/93‑1 TATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGA < 1:4291175/93‑1 ATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGAT < 2:6902986/93‑1 TGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATT < 2:16123/93‑1 TGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATT < 2:3991619/93‑1 GCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTT < 1:625383/93‑1 CCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTC < 1:8381607/93‑1 CTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGCTGTTTGGCGCCC‑CCGGGATGACCGACGCCGCTTTCG > 1:395741/1‑93 AAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGT < 1:9520080/93‑1 AGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTA < 2:741345/93‑1 AGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTA < 2:8271535/93‑1 AGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTA < 2:6194207/93‑1 TACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGGGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGAGTTCGGTCAG > 2:55644/1‑93 ACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGC < 2:4495654/93‑1 cTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGA < 1:2853884/92‑1 GTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGGGCGCTGTGGGGCG‑CCACCGGCATGACCGACGCCGATTTTTGTAAGCCGA > 2:9918396/1‑93 TCCGCCACCACCGCTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATT < 2:5266367/93‑1 CCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTA < 2:318330/93‑1 CCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTA < 1:6870954/93‑1 CCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTA < 1:6515661/93‑1 CCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTA < 2:436758/93‑1 CGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTAT < 2:2487467/93‑1 CGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTAT < 2:8042802/93‑1 cCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATC < 1:7842296/92‑1 GCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATC < 1:1000378/93‑1 CACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGC < 2:4302623/93‑1 CACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGC < 2:5343164/93‑1 cCCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTT < 1:9914012/92‑1 CACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGT < 1:1981066/93‑1 ACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTG < 1:7371279/93‑1 CTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGA < 2:3699558/93‑1 TCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAA < 2:4875043/93‑1 TCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAA < 1:8428318/93‑1 TCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAA < 2:2316798/93‑1 TCATGGGCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAA < 1:6894905/93‑1 CATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGCTGTGGGGCG‑CCACCGGGATGAACGCCGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGGTGTGAAC > 2:839785/1‑93 ATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACT < 2:10023886/93‑1 ATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACT < 1:7285268/93‑1 ATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGAATATCGAGGTTGAGAACa < 2:8986892/93‑2 TGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTGAGCCAATTATCGCGGTTGTGAACTC < 2:2386372/93‑1 TGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTC < 1:3470196/93‑1 TGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGACTATCGCGGTTGTGAACTC < 2:9691214/93‑1 GGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCG < 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1:5673565/93‑1 TGTGGCGCG‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACGTCC < 2:7788522/93‑1 ||| AGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGTGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3951079‑3951166 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACGTCC > NC_000913/3951167‑3951252 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |