| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 3,951,167 | +GCG | coding (36/1818 nt) | ilvD → | dihydroxyacid dehydratase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3951166 | 33 (0.090) | 275 (0.740) +GGC |
102/176 | 1.3 | 89.5% | coding (35/1818 nt) | ilvD | dihydroxyacid dehydratase |
| ? | NC_000913 | 3951167 = | 33 (0.090) | coding (36/1818 nt) | ilvD | dihydroxyacid dehydratase | |||||
Only 100 of 318 total aligned reads displayed.
GAGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GG‑GC‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACGTC > NC_000913/3951074‑3951251 | ggacagataCTGGGAGTAAATAAAGTATGCATAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGATGCTCGTGCG‑‑C‑‑CGT‑ggc < 2:6016985/92‑2 (MQ=255) agacagacACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑ggc < 1:4227680/93‑2 (MQ=255) acagataCTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑ggcgc < 2:1881080/93‑4 (MQ=255) gatactggGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgcc < 2:1196687‑M1/90‑7 (MQ=255) tactGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccac < 1:9522283‑M1/92‑9 (MQ=255) tactGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccac < 2:4220998‑M1/92‑9 (MQ=255) gggAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCG‑‑C‑‑GGT‑GGggcgcccccgga > 1:6718668‑M1/1‑81 (MQ=255) ggAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaa < 1:1769531‑M1/93‑14 (MQ=255) ggAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaa < 1:4728966‑M1/93‑14 (MQ=255) aGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatg < 1:7159915‑M1/93‑16 (MQ=255) taaataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgac < 2:7045279‑M1/93‑18 (MQ=255) taaataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgac < 2:4862778‑M1/93‑18 (MQ=255) taaataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgac < 2:2058567‑M1/93‑18 (MQ=255) aaataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCCCGCG‑‑C‑‑CCT‑GGcgcgccccccggaagacc > 1:2080123‑M1/1‑75 (MQ=255) aataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGggcgccccccggatgaccg > 2:3523017‑M1/1‑74 (MQ=255) ataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccga < 1:3422006‑M1/93‑21 (MQ=255) ataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccga < 1:2940532‑M1/93‑21 (MQ=255) taaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgac < 1:2645545‑M1/93‑22 (MQ=255) aaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacg < 1:3580677‑M1/93‑23 (MQ=255) aaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcggcccccggatgaacgacc > 2:5703263‑M1/1‑71 (MQ=255) gatGCCTAAGTGCCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccga < 1:5016599‑M1/92‑27 (MQ=255) aTGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgat < 2:6902986‑M1/93‑28 (MQ=255) tGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatt < 2:3991619‑M1/93‑29 (MQ=255) gCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgattt < 1:625383‑M1/93‑30 (MQ=255) ccTAAGTTCCGTGCCGCCACCACCACTCATGGTCCTAATAGGACGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTc < 2:3565439/93‑1 (MQ=255) ccTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttc < 1:7406808‑M1/93‑31 (MQ=255) cTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcg < 2:2489596‑M1/93‑32 (MQ=255) aaGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggt < 1:3633456‑M1/93‑34 (MQ=255) aaGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggt < 2:1657489‑M1/93‑34 (MQ=255) aaGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCGCTC‑‑TGG‑GG‑GG‑GCCCCGGCATGAACGACGCCGCtttttgt > 2:9512961/1‑89 (MQ=255) aGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggta < 1:9640694‑M1/93‑35 (MQ=255) aGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggta < 1:8759809‑M1/93‑35 (MQ=255) aGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggta < 2:5077191‑M1/93‑35 (MQ=255) aGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggta < 2:6194207‑M1/93‑35 (MQ=255) aGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggta < 2:8929558‑M1/93‑35 (MQ=255) gTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaa < 2:2103129‑M1/93‑36 (MQ=255) tACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCCTGCG‑‑CCGTGG‑GG‑GG‑GCACCCGGATGACCGACGCCGCTTTCGGTAAg > 1:5253589/1‑93 (MQ=255) ccGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagcc < 2:576084‑M1/93‑39 (MQ=255) ccGTTCCGCCACCACCACTCATGCTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagcc < 2:5522542‑M1/93‑39 (MQ=255) cttcCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccga < 2:1529503‑M1/92‑41 (MQ=255) ttCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgat < 2:5214425‑M1/93‑42 (MQ=255) tCCGCCACCTCCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCTTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaaggaccgacgctgatttcggtaaaccgatt < 2:8351856‑M1/93‑43 (MQ=255) tCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgatt < 1:1979522‑M1/93‑43 (MQ=255) ccGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgatta < 1:1373520‑M1/93‑44 (MQ=255) ccGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgatta < 1:8372525‑M1/93‑44 (MQ=255) cGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattat < 2:8042802‑M1/93‑45 (MQ=255) cGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattat < 1:754664‑M1/93‑45 (MQ=255) gCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatc < 1:1000378‑M1/93‑46 (MQ=255) gCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGGGCG‑‑C‑‑CGTGGG‑GCGCCCCCCGAATGACCGACGCCGGTTTCGGGAAGCCGCTTATc > 2:3235323/1‑93 (MQ=255) cccaccaccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatc < 1:7842296‑M1/92‑46 (MQ=255) cccaccaccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatc < 1:2254575‑M1/92‑46 (MQ=255) caccaccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgc < 1:4002894‑M1/93‑48 (MQ=255) ccaccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑C‑‑GGG‑GG‑GCGCCCCCGGCATGGCCCACCCCCAGTTCGGGAAGCCGCCTATCGCgg > 2:5612384/1‑93 (MQ=255) ccaccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcgg < 1:8900437‑M1/93‑50 (MQ=255) caccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GTcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggt < 2:4383176‑M1/93‑51 (MQ=255) cccactCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggtt < 1:9914012‑M1/92‑52 (MQ=255) ccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttg < 1:8409719‑M1/93‑53 (MQ=255) cacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgt < 1:5572997‑M1/93‑54 (MQ=255) acTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtg < 1:8132132‑M1/93‑55 (MQ=255) acTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGGGGG‑‑C‑‑TGT‑GGCGCGCCCCCCGGATGACCGACCCCGATTTCGGGAAGCCCATTTTCGCGGGtgtg > 2:2981509/1‑93 (MQ=255) cTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtga < 1:1442584‑M1/93‑56 (MQ=255) tCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaa < 2:2316798‑M1/93‑57 (MQ=255) tCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCCCCTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGCGCGCCCCCGGGATGACCGCCGCCGATTTCTGTTAGCCGCATATCCCCGTTGTGaa > 2:5274518/1‑93 (MQ=255) tCATGGGCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaa < 1:6894905‑M1/93‑57 (MQ=255) cATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaac < 2:7360235‑M1/93‑58 (MQ=255) cATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaac < 1:6845709‑M1/93‑58 (MQ=255) cATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGggcgccaccgggatgaacgccgccgatttcggtaagccgattatcgcgggtgtgaac > 2:839785‑M1/1‑36 (MQ=255) aTGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaact < 1:7285268‑M1/93‑59 (MQ=255) tGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGTGGG‑GCGCCCCCCGGATGAACGACCCCGATTTTGGTAAGCCGATGAACGCGGGTGGGGACTc > 2:8965012/1‑93 (MQ=255) tCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaactcgtt < 2:4363561‑M1/93‑63 (MQ=255) cGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaactcgttc < 2:4675479‑M1/93‑64 (MQ=255) gTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaactcgttca < 2:9661990‑M1/93‑65 (MQ=255) tAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaactcgttcac < 2:7522749‑M1/93‑66 (MQ=255) aaTATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaactcgttcacc < 2:2406356‑M1/93‑67 (MQ=255) aaTATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaactcgttcacc < 1:8562970‑M1/93‑67 (MQ=255) atatGGCGTGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcccgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaactcgttcaccc < 2:9138819‑M1/93‑68 (MQ=255) atatGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaactcgttcaccc < 2:9382451‑M1/93‑68 (MQ=255) tatGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccggttatcgcggttgtgaactcgttcaccca > 1:80841‑M1/1‑25 (MQ=255) tatGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaactcgttcaccca < 2:8526751‑M1/93‑69 (MQ=255) tatGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcgggtgtgaaatcgttcaccca > 2:9879865‑M1/1‑25 (MQ=255) atGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaactcgttcacccaa < 1:3107850‑M1/93‑70 (MQ=255) atGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaactcgttcacccaa < 2:3801625‑M1/93‑70 (MQ=255) tGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGTGGG‑GCGCCACCGGGATGAACCAAGCCGATTTTCGTAAACCCATTCTTTCGGTTGTGAACTCGTTCTCCCCAt > 2:7887846/1‑93 (MQ=255) ggCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaactcgttcaccctatt > 1:6991369‑M1/1‑22 (MQ=255) ggCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaactcgttcacccaatt < 1:2713315‑M1/93‑72 (MQ=255) ggTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaactcgttcatccaatttgta > 2:3113339‑M1/1‑18 (MQ=255) ggTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaactcgttcacccaatttgta < 2:1756244‑M1/93‑76 (MQ=255) gTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaactcgttcacccaatttgtac < 1:3302602‑M1/93‑77 (MQ=255) tGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaactcgttcacccaatttgtacc < 1:4137567‑M1/93‑78 (MQ=255) tGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaactcgttcacccaatttgtacc < 1:9754887‑M1/93‑78 (MQ=255) tGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaactcgttcacccaatttgtacc < 1:1622792‑M1/93‑78 (MQ=255) gCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaactcgttcacccaatttgtaccg > 1:5981575‑M1/1‑15 (MQ=255) gCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaactcgttcacccaatttgtaccg < 1:9306473‑M1/93‑79 (MQ=255) tCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaactcgttcacccaatttgtaccggg > 2:9242456‑M1/1‑13 (MQ=255) tCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaactcgttcacccaatttgtaccggg < 1:6742205‑M1/93‑81 (MQ=255) cGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaactcgttcacccaatttgtaccgggt < 1:3892270‑M1/93‑82 (MQ=255) gTGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaactcgttcccccactttgtaccggggc > 2:8136547‑M1/1‑11 (MQ=255) tGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaactcgttcacccaatttgtaccgggtca < 1:6142984‑M1/93‑84 (MQ=255) tGCG‑‑C‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaactcgttcacccaatttgtaccgggtca > 2:1284284‑M1/1‑10 (MQ=255) c‑‑TGT‑GGcgcgccaccggaatgaccgacgccgatttcggtaagccgattatcgcggttgtgaactcgttcacccaatttgtaccgggtcacgtc < 1:5673565‑M1/93‑88 (MQ=255) | GAGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCG‑‑C‑‑TGT‑GG‑GC‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACGTC > NC_000913/3951074‑3951251 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |