| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 269765 = | NA (NA) | 416 (1.080) | 147/184 | 0.2 | 98.6% | coding (300/405 nt) | yi91a | hypothetical protein |
| ? | NC_000913 | = 370983 | 6 (0.020) | coding (536/882 nt) | mhpC | 2‑hydroxy‑6‑ketonona‑2,4‑dienedioic acid hydrolase | |||||
Only 100 of 513 total aligned reads displayed.
TCCCCCATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTACAGCAGAGGAAA > NC_000913/269673‑269854 | tCCCCCATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACt > 2:6959122/1‑93 (MQ=255)tCCCCCATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACt > 2:4177126/1‑93 (MQ=255) cccccATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTg < 1:3978483/93‑1 (MQ=255) ccccATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGt > 1:4386518/1‑93 (MQ=255) cccATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTa > 2:4940150/1‑93 (MQ=255) cccATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTa > 1:1683833/1‑93 (MQ=255) ccATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAg < 1:8785863/93‑1 (MQ=255) aTTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGAt > 1:9161682/1‑93 (MQ=255) aTTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGAt < 2:3202507/93‑1 (MQ=255) tACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTc < 1:6337920/93‑1 (MQ=255) tACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTc < 1:2873743/93‑1 (MQ=255) ccGGAACACATTGAAATCCGTGAGCTGAGGAAAAAGCTAAAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAAtt < 2:2968007/93‑1 (MQ=255) ccGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAAtt < 2:620468/93‑1 (MQ=255) ccGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAAtt > 2:817990/1‑93 (MQ=255) ccGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAAtt > 2:9635769/1‑93 (MQ=255) cGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTg > 1:5315286/1‑93 (MQ=255) ggAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTgg > 2:3993785/1‑93 (MQ=255) gAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGt > 1:8182369/1‑93 (MQ=255) aaCAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTc < 1:9486668/93‑1 (MQ=255) cAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCaa < 1:7304701/93‑1 (MQ=255) cAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCaa < 2:5842039/93‑1 (MQ=255) cAAATTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCaa < 1:4515005/93‑1 (MQ=255) aaaTTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAACTGAAATATTAAAAAAGCCTACTGTAGATTCAATTGGTCacc > 1:3169891/1‑91 (MQ=255) aaTTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGGAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACg > 1:6827247/1‑93 (MQ=255) aTTGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGc < 1:8413555/93‑1 (MQ=255) tGAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCaa < 1:650162/93‑1 (MQ=255) gAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAAc < 1:3275890/93‑1 (MQ=255) gAAATCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAAc > 2:7178037/1‑93 (MQ=255) aaTCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAg < 1:5192058/93‑1 (MQ=255) aaTCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAg < 1:642871/93‑1 (MQ=255) aaTCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTATAGATTCAATTGGTCAACGCAACAg < 1:5425062/93‑1 (MQ=255) aTCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGt > 2:7142180/1‑93 (MQ=255) aTCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGt < 2:4298365/93‑1 (MQ=255) tCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGtt > 1:7970216/1‑93 (MQ=255) tCCGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGtt > 1:9893659/1‑93 (MQ=255) ccGTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTa < 1:548362/93‑1 (MQ=255) gTGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTAtg > 1:8663508/1‑93 (MQ=255) tGAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTAtgt > 1:1222589/1‑93 (MQ=255) gAGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTAtgtg > 1:6064792/1‑93 (MQ=255) aGCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGa < 2:7920627/93‑1 (MQ=255) gCTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGaa > 1:7380425/1‑93 (MQ=255) cTCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGaaa < 2:7741124/93‑1 (MQ=255) tCAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGaaaa > 2:5469080/1‑93 (MQ=255) cAGGAAAAAGCTACAACGTATTTAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAAc > 1:1779154/1‑93 (MQ=255) cAGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAAc > 2:6316357/1‑93 (MQ=255) aGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACa > 2:2318273/1‑93 (MQ=255) aGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACa > 2:4680245/1‑93 (MQ=255) aGGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACa < 2:5053789/93‑1 (MQ=255) ggAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACAt > 2:1323177/1‑93 (MQ=255) ggAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACAt > 2:3911940/1‑93 (MQ=255) ggAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACAt < 1:3720602/93‑1 (MQ=255) gAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATg > 2:1907182/1‑93 (MQ=255) gAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATg < 2:746325/93‑1 (MQ=255) gAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATg > 1:3508972/1‑93 (MQ=255) aaaaaGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATgg < 2:5981946/93‑1 (MQ=255) aaaaGCTACACCGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATggg < 2:4506772/93‑1 (MQ=255) aaaaGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATggg > 1:8575616/1‑93 (MQ=255) aaaGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATCTTAAAAAAGGCTACTGTTGATTCAATTGTTCACCGCAACAGTTATGAGAAAACCTgggg > 2:6451788/1‑93 (MQ=255) aaaGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATgggg < 2:8783665/93‑1 (MQ=255) aaGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGt < 2:7515013/93‑1 (MQ=255) aCAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGAACCAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCgg > 1:2711899/1‑93 (MQ=255) aaCGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAg > 2:10024075/1‑93 (MQ=255) 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aaaTGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGa > 2:8091574/1‑93 (MQ=255) aaTGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGaa < 2:991594/93‑1 (MQ=255) aTGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAAt > 1:5710493/1‑93 (MQ=255) tgtaaaaTGAAATATTATAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATg > 2:8962811/4‑93 (MQ=255) tGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAGCATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATg < 1:7738783/93‑1 (MQ=255) ggAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATga < 1:2396938/93‑1 (MQ=255) gAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATgag < 1:1500321/93‑1 (MQ=255) aagaTGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATgaga < 2:1112884/90‑1 (MQ=255) 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atatTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACAtt < 1:42057/93‑1 (MQ=37) tatTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACAttt > 2:5205764/1‑93 (MQ=38) ttAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTAc < 2:347721/93‑1 (MQ=37) aaaaGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTAcagca < 1:8938289/93‑1 (MQ=37) aaaaGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTAcagca < 2:1481779/93‑1 (MQ=37) aaaGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTAcagcag > 1:7175786/1‑93 (MQ=38) aaGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTACAGCaga > 2:678119/1‑93 (MQ=37) aaGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTACAGCaga < 2:2823697/93‑1 (MQ=37) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |