| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 3,156,257 | (CCA)2→1 | coding (594‑596/930 nt) | yqhG → | hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3156256 | 1 (0.000) | 501 (1.340) | 151/178 | 0.1 | 99.8% | coding (593/930 nt) | yqhG | hypothetical protein |
| ? | NC_000913 | 3156260 = | 1 (0.000) | coding (597/930 nt) | yqhG | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 542 total aligned reads displayed.
AGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCACCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACA > NC_000913/3156164‑3156348 | gAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAg < 1:10014183‑M1/93‑2 (MQ=255) aaCAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAgg < 1:8199041‑M1/93‑3 (MQ=255) aCAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggc < 1:4384268‑M1/93‑4 (MQ=255) cGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCAGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggtta < 2:5586904‑M1/93‑9 (MQ=255) ggAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGTTTATATCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaa > 1:6440859‑M1/1‑84 (MQ=255) ggAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaa < 1:6048493‑M1/93‑10 (MQ=255) ggAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaa < 1:901120‑M1/93‑10 (MQ=255) gAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaat < 1:862263‑M1/93‑11 (MQ=255) cTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgcctt < 1:1851496‑M1/93‑16 (MQ=255) tttGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttc < 1:693095‑M1/93‑17 (MQ=255) tttGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttc > 2:6519622‑M1/1‑77 (MQ=255) tttGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcgggtaatgccttc > 1:4164863‑M1/1‑77 (MQ=255) ttgttgCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttct < 1:9621352‑M1/93‑18 (MQ=255) ttgttgCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttct < 1:365426‑M1/93‑18 (MQ=255) tgttgCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttcta < 1:4247227‑M1/93‑19 (MQ=255) gttgCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctat > 2:27448‑M1/1‑74 (MQ=255) ttgCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctata < 1:7212941‑M1/93‑21 (MQ=255) ttgCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctata < 1:6382939‑M1/93‑21 (MQ=255) tgCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataa < 2:2224905‑M1/93‑22 (MQ=255) gCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaa < 2:2909969‑M1/93‑23 (MQ=255) gCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaa > 1:7424758‑M1/1‑71 (MQ=255) gCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggtaaatgccttctataaa > 1:9989136‑M1/1‑71 (MQ=255) 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tctTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccacct < 1:8558353‑M1/93‑30 (MQ=255) tctTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccacct > 2:6172757‑M1/1‑64 (MQ=255) ctTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaacctcctt < 2:6692781‑M1/93‑31 (MQ=255) tttGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttc > 2:4801983‑M1/1‑62 (MQ=255) ttGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttca > 1:1277064‑M1/1‑61 (MQ=255) tGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaa < 2:3609551‑M1/93‑34 (MQ=255) aaCATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaaga < 1:4660363‑M1/93‑36 (MQ=255) aaCATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaaga < 2:8319151‑M1/93‑36 (MQ=255) tatTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggc > 2:2443843‑M1/1‑54 (MQ=255) tGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaacccccttcaagacggccaa < 1:1034115‑M1/93‑43 (MQ=255) gCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaat < 1:3799451‑M1/93‑44 (MQ=255) cTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaata < 1:297134‑M1/93‑45 (MQ=255) cTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaata < 2:6860631‑M1/93‑45 (MQ=255) tGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGGCTCTTACCGCCAggcggttaatgacttctataaaaccaccttcaagacggccaataa > 2:8490581‑M1/1‑48 (MQ=255) tGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataa < 1:5482325‑M1/93‑46 (MQ=255) gATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataat < 2:1541207‑M1/93‑47 (MQ=255) 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tataGCTGGCCGCGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatccc > 1:1542630‑M1/1‑44 (MQ=255) taGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccga < 1:4475433‑M1/93‑52 (MQ=255) taGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccga > 2:3417037‑M1/1‑42 (MQ=255) aGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgat > 2:8888757‑M1/1‑41 (MQ=255) gCTGGCCGTGGACGTGGGGGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcgggtaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatg > 1:5411781‑M1/1‑40 (MQ=255) cTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatga > 1:507731‑M1/1‑39 (MQ=255) gCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaaga < 2:6406365‑M1/93‑58 (MQ=255) gCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaaga < 2:2581937‑M1/93‑58 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |