| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 3,156,257 | (CCA)2→1 | coding (594‑596/930 nt) | yqhG → | hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3156256 | 1 (0.000) | 501 (1.340) | 151/178 | 0.1 | 99.8% | coding (593/930 nt) | yqhG | hypothetical protein |
| ? | NC_000913 | 3156260 = | 1 (0.000) | coding (597/930 nt) | yqhG | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 541 total aligned reads displayed.
CAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCACCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATCC > NC_000913/3156168‑3156352 | gaacagccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccag < 1:4788529‑M2/1‑1 (MQ=255)gaacagccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccag < 1:3666464‑M2/1‑1 (MQ=255)gaacagccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccag < 1:10014183‑M2/1‑1 (MQ=255) aacagccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccagg < 1:8199041‑M2/2‑1 (MQ=255) cagccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCg > 2:1961075‑M2/90‑93 (MQ=255) gccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGt < 2:1650320‑M2/6‑1 (MQ=255) gccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGt < 1:6370142‑M2/6‑1 (MQ=255) cggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTa < 1:2984239‑M2/8‑1 (MQ=255) ggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgtttatatctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTaa > 1:6440859‑M2/85‑93 (MQ=255) ggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTaa > 2:6492317‑M2/85‑93 (MQ=255) ggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTaa < 1:6048493‑M2/9‑1 (MQ=255) ggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTaa > 1:8669787‑M2/85‑93 (MQ=255) gaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAAt < 1:862263‑M2/10‑1 (MQ=255) gaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAAt > 2:8260385‑M2/84‑93 (MQ=255) agcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGc < 1:2747614‑M2/12‑1 (MQ=255) gcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGcc < 2:8076437‑M2/13‑1 (MQ=255) gcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGcc < 1:4708277‑M2/13‑1 (MQ=255) cctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCt < 1:4606983‑M2/14‑1 (MQ=255) ctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCtt < 1:5354205‑M2/15‑1 (MQ=255) tttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTc < 1:693095‑M2/16‑1 (MQ=255) tttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTc > 2:8449830‑M2/78‑93 (MQ=255) tgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCta > 2:6573836‑M2/76‑93 (MQ=255) ttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCtata < 1:7212941‑M2/20‑1 (MQ=255) ttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCtata > 2:2846596‑M2/74‑93 (MQ=255) ttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCtata < 2:3534505‑M2/20‑1 (MQ=255) tgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATaa < 2:1796094‑M2/21‑1 (MQ=255) tgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgcgtggtttccgactcttaccgcccGGCGGTTAATGCATTCTATaa > 2:6813980‑M2/73‑93 (MQ=255) cgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAac > 1:3903119‑M2/70‑93 (MQ=255) gaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAacc > 2:1377882‑M2/69‑93 (MQ=255) aactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAacca > 1:5860705‑M2/68‑93 (MQ=255) aactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAacca > 2:4243277‑M2/68‑93 (MQ=255) aactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAacca > 2:3975898‑M2/68‑93 (MQ=255) aactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAacca > 1:9606424‑M2/68‑93 (MQ=255) aactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAacca > 2:6943665‑M2/68‑93 (MQ=255) ctctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAaccacc < 1:7801943‑M2/28‑1 (MQ=255) tctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccgGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCt > 2:268251‑M2/65‑93 (MQ=255) tctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCt > 1:4451194‑M2/65‑93 (MQ=255) ttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCa > 1:1277064‑M2/62‑93 (MQ=255) ttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCa > 1:4233795‑M2/62‑93 (MQ=255) tgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCaa > 1:4942579‑M2/61‑93 (MQ=255) tgaacatattactgaatatagctggccgtggacctgggtggtttccgcctcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCaa < 2:8547167‑M2/33‑1 (MQ=255) aacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGa < 2:736041‑M2/35‑1 (MQ=255) aacatattgctgattatagcaagcggtcgacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGa < 1:2928917‑M2/35‑1 (MQ=255) acatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGAc < 1:9275114‑M2/36‑1 (MQ=255) tattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGc > 1:5469250‑M2/55‑93 (MQ=255) tattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGc > 1:9883209‑M2/55‑93 (MQ=255) tattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGc > 1:4332956‑M2/55‑93 (MQ=255) tattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGc < 2:6110349‑M2/39‑1 (MQ=255) tgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCCCCTTCAAGACGGCCaa < 1:1034115‑M2/42‑1 (MQ=255) gctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCaat > 1:6534713‑M2/51‑93 (MQ=255) gctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCaat < 1:9395393‑M2/43‑1 (MQ=255) tgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCaataa < 1:7869409‑M2/45‑1 (MQ=255) tgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCaataa < 2:6293994‑M2/45‑1 (MQ=255) tgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCaataa < 2:5754790‑M2/45‑1 (MQ=255) attatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATc < 1:4079227‑M2/47‑1 (MQ=255) attatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATc > 2:3827274‑M2/47‑93 (MQ=255) attataactggcagtggacatgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTACAAGACGGCCAATAATc < 2:8981554‑M2/47‑1 (MQ=255) ttatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATcc < 2:4935037‑M2/48‑1 (MQ=255) ttatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATcc < 1:7450098‑M2/48‑1 (MQ=255) tatatctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATTCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATccc < 1:5102997‑M2/49‑1 (MQ=255) tatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATccc > 1:6221836‑M2/45‑93 (MQ=255) tagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGa < 1:8820599‑M2/51‑1 (MQ=255) tagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGa > 2:2573562‑M2/43‑93 (MQ=255) tagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGa > 2:9134261‑M2/43‑93 (MQ=255) tagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGa > 2:3683417‑M2/43‑93 (MQ=255) agctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGAt > 1:2504112‑M2/42‑93 (MQ=255) agctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGAt < 1:2311276‑M2/52‑1 (MQ=255) agctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGAt < 1:191822‑M2/52‑1 (MQ=255) ggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAg > 1:9669549‑M2/38‑93 (MQ=255) cgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAtata < 1:1634240‑M2/59‑1 (MQ=255) cgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGata < 2:7510308‑M2/59‑1 (MQ=255) cgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGata < 2:9614928‑M2/59‑1 (MQ=255) gtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGatat > 2:5544849‑M2/34‑93 (MQ=255) tggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATg > 2:9448518‑M2/33‑93 (MQ=255) tggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATg < 1:7081482‑M2/61‑1 (MQ=255) cgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCaaa < 1:3254859‑M2/65‑1 (MQ=255) tgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATa > 2:9821559‑M2/27‑93 (MQ=255) gtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGaa < 2:7857804‑M2/70‑1 (MQ=255) ggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACg > 1:3486870‑M2/22‑93 (MQ=255) gtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACgg > 2:5169487‑M2/21‑93 (MQ=255) tttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGc < 2:328911‑M2/74‑1 (MQ=255) tttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGc > 2:7100579‑M2/20‑93 (MQ=255) tccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCaa < 1:3825130‑M2/76‑1 (MQ=255) tccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCaa < 1:8034964‑M2/76‑1 (MQ=255) gactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAattt < 1:4529941‑M2/79‑1 (MQ=255) actcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAattta > 2:4645041‑M2/14‑93 (MQ=255) actcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAattta > 1:2065799‑M2/14‑93 (MQ=255) actcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAattta > 2:1023949‑M2/14‑93 (MQ=255) tcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAatttatt > 1:7573506‑M2/12‑93 (MQ=255) ttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAAtttattta > 2:2333549‑M2/10‑93 (MQ=255) ccaGGCGGTTACTGCCTTCTATAAACACTCCTTAAAGACGGCAAATAATCCAGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACaa < 2:2956672‑M2/90‑1 (MQ=255) caGGCTGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAAt < 1:3168601‑M2/91‑1 (MQ=255) caGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAAt < 1:8963905‑M2/91‑1 (MQ=255) caGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAAt < 1:8320613‑M2/91‑1 (MQ=255) caGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAAt > 2:2183392‑M2/3‑93 (MQ=255) aGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAACTAGAACGGCAATTTATTTACGACAATc > 1:5670185‑M2/2‑93 (MQ=255) aGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATc > 2:700047‑M2/2‑93 (MQ=255) aGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATc > 1:9113394‑M2/2‑93 (MQ=255) aGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATc > 2:4559987‑M2/2‑93 (MQ=255) ggCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATcc > 1:5415165/1‑93 (MQ=255) | CAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCACCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATCC > NC_000913/3156168‑3156352 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |