Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 3,156,257 | (CCA)2→1 | coding (594‑596/930 nt) | yqhG → | hypothetical protein |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 3156257 | 3156259 | 3 | 222 [0] | [0] 220 | yqhG | hypothetical protein |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3156256 | 0 (0.000) | 203 (0.860) | 118/178 | 0.4 | 100% | coding (593/930 nt) | yqhG | hypothetical protein |
? | NC_000913 | 3156260 = | 0 (0.000) | coding (597/930 nt) | yqhG | hypothetical protein |
Only 100 of 220 total aligned reads displayed.
CAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCACCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATCC > NC_000913/3156168‑3156352 | gaacagccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccag < 1:34758‑M2/1‑1 (MQ=255) gaacagccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtggggggtttccgtctcttaccgccag > 2:5046097‑M2/93‑93 (MQ=255) aacagccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccagg < 1:1492169‑M2/2‑1 (MQ=255) agccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCgg > 2:4889581‑M2/89‑93 (MQ=255) agccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCgg < 1:2786011‑M2/5‑1 (MQ=255) agccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCgg < 1:3790435‑M2/5‑1 (MQ=255) gccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGt < 1:5657992‑M2/6‑1 (MQ=255) gccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGt > 2:743265‑M2/88‑93 (MQ=255) gccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGt < 2:298766‑M2/6‑1 (MQ=255) ccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgcccGGCGGtt > 2:2348923‑M2/87‑93 (MQ=255) ccggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGtt > 1:4508688‑M2/87‑93 (MQ=255) ggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTaa < 1:4705609‑M2/9‑1 (MQ=255) ggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTaa < 2:870099‑M2/9‑1 (MQ=255) ggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTaa < 1:585073‑M2/9‑1 (MQ=255) ggaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTaa < 1:2635576‑M2/9‑1 (MQ=255) gaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAAt > 1:5781953‑M2/84‑93 (MQ=255) gaagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAAt > 1:5996769‑M2/84‑93 (MQ=255) aagcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATg > 1:4724151‑M2/83‑93 (MQ=255) agcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGc > 2:161577‑M2/82‑93 (MQ=255) agcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGc < 2:6295342‑M2/12‑1 (MQ=255) gcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGcc > 1:5068410‑M2/81‑93 (MQ=255) gcctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGcc < 1:1812302‑M2/13‑1 (MQ=255) ctttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCtt < 2:759469‑M2/15‑1 (MQ=255) tttgttgccgaactctttgaacatattgctgattctagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTc > 2:4417272‑M2/78‑93 (MQ=255) tttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttatcgccaGGCGGTTAATGCCTTc > 2:1624970‑M2/78‑93 (MQ=255) tttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTc > 2:4546873‑M2/78‑93 (MQ=255) ttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCt < 2:3831836‑M2/17‑1 (MQ=255) ttgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCt > 1:217245‑M2/77‑93 (MQ=255) tgttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCta < 2:1882386‑M2/18‑1 (MQ=255) gttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCtat > 1:3359187‑M2/75‑93 (MQ=255) gttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCtat > 2:3268634‑M2/75‑93 (MQ=255) ttgccgaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCtata < 1:869578‑M2/20‑1 (MQ=255) gaactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAacc > 1:1784435‑M2/69‑93 (MQ=255) aactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAacca < 2:3233538‑M2/26‑1 (MQ=255) aactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAacca > 2:3333726‑M2/68‑93 (MQ=255) aactctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAacca > 1:1611932‑M2/68‑93 (MQ=255) actctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAaccac < 2:3542472‑M2/27‑1 (MQ=255) ctctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAaccacc < 1:4280332‑M2/28‑1 (MQ=255) tctttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCt > 1:4751958‑M2/65‑93 (MQ=255) ttgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCa > 2:1484281‑M2/62‑93 (MQ=255) tgaacatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgcctcttcccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCaa < 2:3782310‑M2/33‑1 (MQ=255) acatattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGAc < 1:5026095‑M2/36‑1 (MQ=255) atattgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACgg > 1:660608‑M2/56‑93 (MQ=255) tattgctgattatagctggccgtggacgtgggtgggttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATCAAACCACCTTCAAGACGGc > 2:4341177‑M2/55‑93 (MQ=255) tattgctgattatagcgggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGc < 2:2533601‑M2/39‑1 (MQ=255) attgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGcc > 1:3104939‑M2/54‑93 (MQ=255) ttgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCa > 2:4603717‑M2/53‑93 (MQ=255) tgctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCaa < 1:1263934‑M2/42‑1 (MQ=255) ctgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCaata < 2:2469391‑M2/44‑1 (MQ=255) tgattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCaataa > 1:5331168‑M2/49‑93 (MQ=255) gattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCaataat < 2:4313869‑M2/46‑1 (MQ=255) gattatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCaataat > 1:733684‑M2/48‑93 (MQ=255) ttatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATcc < 2:498220‑M2/48‑1 (MQ=255) ttatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATcc < 1:197064‑M2/48‑1 (MQ=255) tatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATccc < 1:1057126‑M2/49‑1 (MQ=255) tatagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATccc > 1:3194380‑M2/45‑93 (MQ=255) atagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCg > 2:5464650‑M2/44‑93 (MQ=255) atagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCg > 2:3252704‑M2/44‑93 (MQ=255) atagctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCg > 2:124514‑M2/44‑93 (MQ=255) agctggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGAt < 2:5892376‑M2/52‑1 (MQ=255) ggccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAg > 2:258165‑M2/38‑93 (MQ=255) gccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGa < 2:3665377‑M2/57‑1 (MQ=255) gccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGa < 1:3955538‑M2/57‑1 (MQ=255) gccgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGa < 2:2282135‑M2/57‑1 (MQ=255) cgtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGata > 2:2122911‑M2/35‑93 (MQ=255) gtggacgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGatat < 2:5734127‑M2/60‑1 (MQ=255) cgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCaaa < 2:5636297‑M2/65‑1 (MQ=255) cgtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCaaa < 1:6010425‑M2/65‑1 (MQ=255) gtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAAt < 2:4250275‑M2/66‑1 (MQ=255) gtgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGGTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAAt > 1:2463158‑M2/28‑93 (MQ=255) tgggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATa < 1:3597984‑M2/67‑1 (MQ=255) gggtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAg > 1:5046332‑M2/26‑93 (MQ=255) gtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGaa < 1:4854821‑M2/70‑1 (MQ=255) gtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGaa < 2:2719487‑M2/70‑1 (MQ=255) gtggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGaa < 2:599235‑M2/70‑1 (MQ=255) tggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAAc < 2:2005884‑M2/71‑1 (MQ=255) tggtttccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAAc > 1:1911839‑M2/23‑93 (MQ=255) tccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCaa < 2:3431871‑M2/76‑1 (MQ=255) tccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCaa < 1:4061673‑M2/76‑1 (MQ=255) ccgactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAat < 1:114091‑M2/77‑1 (MQ=255) gactcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAattt > 1:170833‑M2/15‑93 (MQ=255) ctcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAatttat < 2:914837‑M2/81‑1 (MQ=255) ctcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAatttat > 2:4091287‑M2/13‑93 (MQ=255) ctcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAatttat < 1:2849448‑M2/81‑1 (MQ=255) ctcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAatttat < 2:5938420‑M2/81‑1 (MQ=255) tcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAatttatt < 1:132410‑M2/82‑1 (MQ=255) tcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAatttatt > 1:973273‑M2/12‑93 (MQ=255) tcttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAatttatt > 1:5978026‑M2/12‑93 (MQ=255) ttaccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAAtttattta < 1:1331056‑M2/84‑1 (MQ=255) ccgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGa > 2:127128‑M2/7‑93 (MQ=255) cgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGAc > 2:5501023‑M2/6‑93 (MQ=255) cgccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGAc < 1:1855461‑M2/88‑1 (MQ=255) ccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACaa < 2:324321‑M2/90‑1 (MQ=255) caGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAAt > 1:4578454‑M2/3‑93 (MQ=255) caGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAAt > 1:4236600‑M2/3‑93 (MQ=255) caGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAAt > 2:3950424‑M2/3‑93 (MQ=255) aGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCTATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATc < 1:4429488‑M2/92‑1 (MQ=255) aGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATc > 2:5343716‑M2/2‑93 (MQ=255) aGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATc < 2:406721‑M2/92‑1 (MQ=255) ggCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATcc > 1:6195700/1‑93 (MQ=255) | CAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCACCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATCC > NC_000913/3156168‑3156352 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |