| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 365527 = | 1 (0.000) | 390 (1.180) | 147/178 | 0.1 | 71.0% | coding (3/3075 nt) | lacZ | beta‑D‑galactosidase |
| ? | NC_000913 | 4589230 = | 318 (0.960) | coding (4/1656 nt) | tsr | methyl‑accepting chemotaxis protein I | |||||
Only 100 of 425 total aligned reads displayed.
GATGTGCTGCAAGGCGATTAAGTTGGGTAACGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGACGTTGTAAAACGACGGCCAGTGAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAAT > NC_000913/365436‑365619 | cattaaagaacagcccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCa > 1:5465826‑M1/92‑93 (MQ=255)cattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCa > 1:5623719‑M1/92‑93 (MQ=255) attaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCAt < 2:3612707‑M1/3‑1 (MQ=255) attaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCAt < 2:3094849‑M1/3‑1 (MQ=255) attaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCAt < 2:1320261‑M1/3‑1 (MQ=255) attaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCAt < 1:6806265‑M1/3‑1 (MQ=255) attaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCAt > 2:8236393‑M1/91‑93 (MQ=255) ttaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATa < 1:4544958‑M1/4‑1 (MQ=255) ataaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATa > 1:4248163‑M1/90‑93 (MQ=255) aaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGc > 2:4953520‑M1/88‑93 (MQ=255) aaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGc > 2:1239240‑M1/88‑93 (MQ=255) aaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGc > 1:6432103‑M1/88‑93 (MQ=255) aagaacagacctcctgatgtcagttggaaaaggccaaaatcggccaaatccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttgtaaCATAGCt < 1:7808672‑M1/7‑1 (MQ=255) aagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCt < 1:4459660‑M1/7‑1 (MQ=255) agaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTg > 2:5024940‑M1/86‑93 (MQ=255) aacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGtt > 1:312731‑M1/84‑93 (MQ=255) aacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGtt > 2:7009810‑M1/84‑93 (MQ=255) aacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGtt > 2:1884229‑M1/84‑93 (MQ=255) acagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGttt > 2:8055831‑M1/83‑93 (MQ=255) cagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTc > 2:5635813‑M1/82‑93 (MQ=255) agaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTcc < 1:5524933‑M1/13‑1 (MQ=255) agaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTcc > 2:6589211‑M1/81‑93 (MQ=255) gaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCt < 1:6076268‑M1/14‑1 (MQ=255) gaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCt < 2:6767820‑M1/14‑1 (MQ=255) gcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCtgtgt > 1:1404431‑M1/76‑93 (MQ=255) gcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCtgtgt < 1:2553087‑M1/18‑1 (MQ=255) ctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGa < 1:4008824‑M1/20‑1 (MQ=255) ctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaatcttgatccgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGa > 2:2261619‑M1/74‑93 (MQ=255) gatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGaaa < 2:3304766‑M1/22‑1 (MQ=255) atgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAAt < 2:2589530‑M1/23‑1 (MQ=255) atgtaagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAAt > 1:2286562‑M1/71‑93 (MQ=255) tgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAAtt > 2:8661649‑M1/70‑93 (MQ=255) tgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAAtt > 2:1486964‑M1/70‑93 (MQ=255) tcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGt < 1:6998560‑M1/26‑1 (MQ=255) cagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatgcgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGtt > 1:7518870‑M1/67‑93 (MQ=255) cagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGtt < 1:1654476‑M1/27‑1 (MQ=255) cagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGtt < 2:6198800‑M1/27‑1 (MQ=255) agttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTa > 2:321124‑M1/66‑93 (MQ=255) agttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTa > 1:3886792‑M1/66‑93 (MQ=255) agttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgtttaaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTa > 2:1682443‑M1/66‑93 (MQ=255) gttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTAt > 1:8526568‑M1/65‑93 (MQ=255) gttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTAt < 1:8376057‑M1/29‑1 (MQ=255) ttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcccaattttgatacgttttcaCATCGCTGTTTCCTGTGTGAATTTGTTATc < 1:4093772‑M1/30‑1 (MQ=255) taaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaTATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGc > 1:8280917‑M1/61‑93 (MQ=255) aaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCt < 1:8203014‑M1/34‑1 (MQ=255) aaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTca > 2:4408993‑M1/58‑93 (MQ=255) aaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTca > 1:6245543‑M1/58‑93 (MQ=255) aggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTcac < 1:1903314‑M1/37‑1 (MQ=255) aggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTcac < 2:312658‑M1/37‑1 (MQ=255) aaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATtca < 1:5133150‑M1/43‑2 (MQ=255) aaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCca > 2:3884665‑M1/50‑93 (MQ=255) aacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCcac < 2:7705214‑M1/45‑1 (MQ=255) ggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCcacaca < 2:5089603‑M1/48‑1 (MQ=255) caaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACacaaca > 1:7319579‑M1/43‑93 (MQ=255) caaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACacaaca > 1:4638201‑M1/43‑93 (MQ=255) caaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACacaaca < 1:3526861‑M1/51‑1 (MQ=255) aaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACAt > 1:7900662‑M1/42‑93 (MQ=255) aaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATa > 2:837163‑M1/41‑93 (MQ=255) aaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATa > 2:5773038‑M1/41‑93 (MQ=255) aaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATa > 1:236447‑M1/41‑93 (MQ=255) accagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACg > 2:5945621‑M1/39‑93 (MQ=255) cagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAg < 1:2039954‑M1/57‑1 (MQ=255) cagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAg > 2:8516650‑M1/37‑93 (MQ=255) cagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAg < 1:3189560‑M1/57‑1 (MQ=255) agcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGc < 1:1791532‑M1/58‑1 (MQ=255) agcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGc < 2:7174813‑M1/58‑1 (MQ=255) agcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGc > 2:7878681‑M1/36‑93 (MQ=255) gcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGcc < 2:573604‑M1/59‑1 (MQ=255) gcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGcc > 1:5826137‑M1/35‑93 (MQ=255) cagtaagttgttcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCg > 2:29875‑M1/34‑93 (MQ=255) aagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAg > 2:918239‑M1/30‑93 (MQ=255) agctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGc > 1:5901725‑M1/29‑93 (MQ=255) agctgggcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGc > 2:7380621‑M1/29‑93 (MQ=255) gctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCa > 2:4248507‑M1/28‑93 (MQ=255) gctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCa > 1:3334346‑M1/28‑93 (MQ=255) gctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCa > 2:2401915‑M1/28‑93 (MQ=255) ctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCAt < 1:7652361‑M1/67‑1 (MQ=255) ggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACTCAACATACGAGCCGGAAGCATaa < 2:346822‑M1/69‑1 (MQ=255) ggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACATAACATACGAGCCGGAAGCATaa > 2:7095803‑M1/25‑93 (MQ=255) acaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAgtg < 1:980336‑M1/73‑1 (MQ=255) attttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTaa < 1:858071‑M1/76‑1 (MQ=255) attttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAACTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTaa < 1:6502969‑M1/76‑1 (MQ=255) atttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTaaa > 2:6429945‑M1/17‑93 (MQ=255) ttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGc < 1:2768972‑M1/79‑1 (MQ=255) ttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGc < 2:4012649‑M1/79‑1 (MQ=255) gatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCt > 2:4462996‑M1/13‑93 (MQ=255) gatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCt > 2:6076268‑M1/13‑93 (MQ=255) atacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTg > 2:6371048‑M1/12‑93 (MQ=255) atacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTg < 1:7178163‑M1/82‑1 (MQ=255) tacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTgg < 2:1943115‑M1/83‑1 (MQ=255) tacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTgg < 2:5225071‑M1/83‑1 (MQ=255) acgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTggg < 1:4836217‑M1/84‑1 (MQ=255) acgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTggg < 2:4788142‑M1/84‑1 (MQ=255) cgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTgggg > 2:5303052‑M1/9‑93 (MQ=255) gttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGt < 2:1119146‑M1/86‑1 (MQ=255) taaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCt > 1:1074971‑M1/4‑93 (MQ=255) aCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTaa > 1:379391‑M1/2‑93 (MQ=255) CATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAAt < 1:5058250‑M1/93‑1 (MQ=255) CATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAAt < 1:1055798‑M1/93‑1 (MQ=255) CATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGCGCCTAAt < 2:6269859‑M1/93‑1 (MQ=255) | GATGTGCTGCAAGGCGATTAAGTTGGGTAACGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGACGTTGTAAAACGACGGCCAGTGAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAAT > NC_000913/365436‑365619 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |