| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 365527 = | 1 (0.000) | 390 (1.180) | 147/178 | 0.1 | 71.0% | coding (3/3075 nt) | lacZ | beta‑D‑galactosidase |
| ? | NC_000913 | 4589230 = | 318 (0.960) | coding (4/1656 nt) | tsr | methyl‑accepting chemotaxis protein I | |||||
Only 100 of 747 total aligned reads displayed.
ATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCTTTAATGCC > NC_000913/4589138‑4589322 | ttaggcaccccaggctttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgt < 2:6044342‑M2/1‑1 (MQ=255)aTTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGt < 1:2706653/93‑1 (MQ=255) aggcaccccaggctttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTa < 2:1062765‑M2/3‑1 (MQ=255) caccccaggctttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTaaaa < 2:3788604‑M2/6‑1 (MQ=255) cTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTaaaa > 1:409524/1‑93 (MQ=255) tCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAAc > 2:2523982/1‑93 (MQ=255) cccccaggctttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAAc < 2:3098499‑M2/7‑1 (MQ=255) accccaggctttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAAc < 1:1859665‑M2/7‑1 (MQ=255) ggCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGt < 2:6155010/93‑1 (MQ=255) gCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTa > 1:1006058/1‑93 (MQ=255) ccaggctttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTa > 2:7988379‑M2/84‑93 (MQ=255) ccaggctttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTa > 2:4893585‑M2/84‑93 (MQ=255) ccaggctttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTa > 1:7540671‑M2/84‑93 (MQ=255) caggctttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTAt < 1:3865391‑M2/11‑1 (MQ=255) caggctttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTAt < 1:8607999‑M2/11‑1 (MQ=255) caggctttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTAt > 2:3289611‑M2/83‑93 (MQ=255) caggctttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTAt > 2:6371048‑M2/83‑93 (MQ=255) gTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATc < 2:8732234/93‑1 (MQ=255) aggctttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATc > 2:4462996‑M2/82‑93 (MQ=255) ggctttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCa > 1:3181227‑M2/81‑93 (MQ=255) ggctttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCa > 1:1643614‑M2/81‑93 (MQ=255) gctttacattttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCaa > 1:2132107‑M2/80‑93 (MQ=255) tttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCaaaa < 2:2752014‑M2/16‑1 (MQ=255) tttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCaaaa > 2:6429946‑M2/78‑93 (MQ=255) tcCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAAtt > 1:1194048/1‑93 (MQ=255) tcCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAAtt < 2:677926/93‑1 (MQ=255) ttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGAcc < 2:5146790‑M2/24‑1 (MQ=255) tatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCa < 2:7144806‑M2/25‑1 (MQ=255) tatgcttccggctcggatgttgtgtggaattgggagaggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACCTATCAAAATTGTGACCa > 2:4057568‑M2/69‑93 (MQ=255) atatTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAg < 2:4363205/93‑1 (MQ=255) tgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGc > 1:3334346‑M2/67‑93 (MQ=255) tatTCATAAAGTTTTTCCTTTCCGGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGc > 1:8534993/1‑93 (MQ=255) gcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCt > 1:4513858‑M2/66‑93 (MQ=255) ttCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCtt > 2:5513840/1‑93 (MQ=255) tCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTa < 1:6563815/93‑1 (MQ=255) tccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTAc > 1:6831174‑M2/63‑93 (MQ=255) taTAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTAc < 1:6235228/92‑1 (MQ=255) cATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTACAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTAc > 1:5634910/1‑93 (MQ=255) ccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTAct > 2:1536984‑M2/62‑93 (MQ=255) tAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTActg > 1:894599/1‑93 (MQ=255) cggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGAACAACTTActg > 2:29875‑M2/61‑93 (MQ=255) ggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTActgc < 1:2313487‑M2/34‑1 (MQ=255) ggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTActgc > 1:5826136‑M2/60‑93 (MQ=255) aGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTActgctg > 1:1355243/1‑93 (MQ=255) tcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTgg > 2:6221802‑M2/57‑93 (MQ=255) gTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTgg > 2:4621411/1‑93 (MQ=255) gtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGtt < 2:3557954‑M2/39‑1 (MQ=255) gtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGtt > 2:1791971‑M2/55‑93 (MQ=255) ttcctttccAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGtttt < 2:4232179/93‑1 (MQ=255) atgttgtgtggaattgttagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGtttt < 2:5028835‑M2/41‑1 (MQ=255) gttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTgg < 1:4384201‑M2/43‑1 (MQ=255) tttccAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGcc > 2:5775385/1‑93 (MQ=255) ttccAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCg > 2:7638101/1‑93 (MQ=255) cAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGttt > 2:5675883/1‑93 (MQ=255) aGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGtttt > 1:5504790/1‑93 (MQ=255) ggCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGttttt > 1:3511312/1‑93 (MQ=255) gCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTg > 1:2446749/1‑93 (MQ=255) attgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTgg < 2:1910532‑M2/53‑1 (MQ=255) tgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGcc < 1:8247927‑M2/55‑1 (MQ=255) gAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGcc > 1:5917505/1‑93 (MQ=255) aaaaTCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACTTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCt > 1:4699902/1‑93 (MQ=255) aaaaTCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCt > 1:6975511/1‑93 (MQ=255) aaaTCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCtt < 1:4188588/93‑1 (MQ=255) aTCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCtttt > 1:1445240/1‑93 (MQ=255) cTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTAc > 2:883900/1‑93 (MQ=255) ttGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACa > 2:7404148/1‑93 (MQ=255) gCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAAc < 1:29252/93‑1 (MQ=255) ataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAAc < 2:3401975‑M2/64‑1 (MQ=255) ataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAAc < 1:200430‑M2/64‑1 (MQ=255) ataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAAc > 1:7271630‑M2/30‑93 (MQ=255) taacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAGCGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACt < 1:7845551‑M2/65‑1 (MQ=255) caatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGAc > 1:8463735‑M2/26‑93 (MQ=255) gTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACAt > 1:3689969/1‑93 (MQ=255) atttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACAt > 2:8580120‑M2/24‑93 (MQ=255) ttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCa > 2:3148497‑M2/22‑93 (MQ=255) ccACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCa < 2:1408189/93‑1 (MQ=255) ccACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCa > 1:4906451/1‑93 (MQ=255) tcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAg < 1:4008824‑M2/73‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |