| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP012306 | 1082924 = | 334 (1.160) | 4 (0.010) | 4/508 | 24.8 | 1.4% | coding (123/1797 nt) | narX | sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with NarL |
| ? | AP012306 | 1083708 = | 262 (0.940) | coding (324/1392 nt) | narK | nitrate/nitrite transporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 334 total aligned reads displayed.
GTTGATCAAGCCCGGCAACAAACTGGCTGACATCCGCTGACACCGTTTCTCGGTTTTGTGCACGCATCAGCGCAGGGATCAGTTCATTACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGCCAGTCCAATAGCAGTAGAAAGCAACACAATAAGCGCAACCTGATTAACCAGGGTGAGCGGAGAGAGACAACGTTTAAGCATGTAAACCTCTTCCTTCAGGCTTTAAATGAGCAATAACCTTAATGAATGTGACGATACATTCTGGAATGGCAGTATTCTCGGCTATTGGCTGAAGTATACCCATACCCGGAAAGAGTTACTCCTTATTTGCCGTGTGGTTAGTCGCTTTACATCGGTAAGGGTAGG > AP012306/1082638‑1083211 | gTTGATCAAGCCCGGCAACAAACTGGCTGACATCCGCTGACACCGTTTCTCGGTTTTGTGCACGCATCAGCGCAGGGATCAGTTCATTACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTg > 1:1345297/1‑289 (MQ=255) ttGATCAAGCCCGGCAACAAACTGGCTGACATCCGCTGACACCGTTTCTCGGTTTTGTGCACGCATCAGCGCAGGGATCAGTTCATTACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGa > 2:15813/1‑289 (MQ=255) tGATCACGCCCGGAAAAAAACTGGCTGCCATCCGCTGACACCGTTTCTCGGGTTTGTGCACGCATCAGCGCAGGGATCAGTTCATTACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGa < 2:2162468/288‑1 (MQ=255) tGATCAAGCCCGGCAACAAACTGGCTGACATCCGCTGTCACCGTTTCTCGGTTTTGTGCACGCATCAGCGCAGGGATCAGTTCATTACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGa < 1:902116/288‑1 (MQ=255) tGATCAAGCCCGGCAACAAACTGGCTGACATCCGCTGACACCGTTTCTCGGTTTTGTGCACGCATCAGCGCAGGGATCAGTTCATTACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGaa < 2:969504/289‑1 (MQ=255) tGATCAAGCCCGGCAACAAACTGGCTGACATCCGCTGACACCGTTTCTCGGTTTTGTGCACGCATCAGCGCAGGGATCAGTTCATTACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGa < 2:628507/288‑1 (MQ=255) tGATCAAGCCCGGCAACAAACTGGCTGACATCCGCTGACACCGTTTCTCGGTTTTGTGCACGCATCAGCGCAGGGATCAGTTCATTACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGa < 1:1226597/288‑1 (MQ=255) cAAGCCCGGCAACAAACTGGCTGACATCCGCTGACACCGTTTCTCGGTTTTGTGCACGCATCAGCGCAGGGATCAGTTCATTACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGcc < 1:2235675/289‑1 (MQ=255) aGCCCGGCAACAAACTGGCTGACATCCGCTGACACCGTTTCTCGGTTTTGTGCACGCATCAGCGCAGGGATCAGTTCATTACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCtt > 1:4724/1‑289 (MQ=255) gCAACAAACTGGCTGACATCCGCTGACACCGTTTCTCGGTTTTGTGCACGCATCAGCGCAGGGATCAGTTCATTACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGACCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTCGCAcc > 2:866413/1‑288 (MQ=255) cATCCGCTGACACCGTTTCTCGGTTTTGTGCACGCATCAGCGCAGGGATCAGTTCATTACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCg < 1:1372999/288‑1 (MQ=255) cTGACACCGTTTCTCGGTTTTGTGCACGCATCAGCGCAGGGATCAGTTCATTACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCCGAAACCGCCATc > 1:190447/1‑287 (MQ=255) cacCGTTTCTCGGTTTTGTGCACGCATCAGCGCAGGGATCAGTTCATTACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGAGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACAAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGcc < 2:1343750/289‑1 (MQ=255) cacCGTTGTGCGGTTTTGTGCACGAAGCAGCGCAGTGATCAGTTCATTACGCCAGTAAGCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGGCCGGCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGcc < 2:1206119/289‑1 (MQ=255) acgcGTTTCTCGGTTTTGTGCACGCATCAGGCCAGGGATCAGTTAATTACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTTTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTAGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCAGCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGc < 2:254841/285‑1 (MQ=255) acccGTTTCTCGGTTTTGTGCACGCATCAGCGCAGGGATCAGTTCATTACGCCAGTAATCTTGTAACCCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGc < 1:2079538/286‑1 (MQ=255) acCGTTTCTCGGTTTTGTGCACGCATCAGCGCAGGGATCAGTTCATTACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGCCa > 2:804948/1‑289 (MQ=255) ttCTCGGTTTTGTGCACGCATCAGCGCAGGGATCAGTTCATTACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGCCAGTcc < 1:804948/288‑1 (MQ=255) cGGTTTTGTGCACGCATCAGCGCAGGGATCAGTTCATTACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGCCAGTCCAATAg < 1:117849/289‑1 (MQ=255) ttGTGCACTAATCATCTCAGGGATCAGTTCATTACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTTCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTTCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGCCAGTCCAATAGCAGTa < 1:49855/289‑1 (MQ=255) tgCACGCATCAGCGCAGGGATCAGTTCATTACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGCCAGTCCAATAg > 2:2185889/1‑281 (MQ=255) gCATCAGCGCAGGGATCAGTTCATTACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGCCAGTCCAATAGCAGTAGAAAGCaa < 1:1598141/289‑1 (MQ=255) ggATCAGTTCATTACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGCCAGTCCAATAGCAGTa < 2:282561/269‑1 (MQ=255) ggATCAGTTCATTACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGCCAGTCCAATAGCAGTAGAAAGCAACACAATAAgcgc > 1:1690938/1‑289 (MQ=255) ggATCAGTTCATTACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGCCAGTCCAATAGCAGTAGAAAGCAACACAATAAgcgc > 1:1791885/1‑289 (MQ=255) tCAGTTCATTAAGCCAGTAATCTTGTACACCCTGTACTTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGCCAGTCCAATAGCAGTAGAAAGCAACACAATAAGCGCAAc < 2:4724/289‑1 (MQ=255) aGTTCATTACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTGATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGCCAGTCCAATAGCAGTAGAAAGCAACACAATAAGCGCaa > 2:1073845/1‑286 (MQ=255) ttCATTACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGCCAGTCCAATAGCAGTAGAAAGCAACACAATAAGCGCAACCTg < 2:501945/288‑1 (MQ=255) tactttagCCAGTACGCTTTTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAGCTCGGCGCTAAATGCCGTTTTTTCAATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGCCAGTCCAATAGCAGTAGAAAGCAACACAATAAGCGCAACCTGAt < 2:1508947/282‑1 (MQ=255) tCATTACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGCCAGTCCAATAGCAGTAGAAAGCAACACAATAAGCGCAACCTGAt < 1:1008928/289‑1 (MQ=255) tCATTACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGCCAGCCCAATAGCAGTAGAAAGCAACACAATAAGCGCAACCTg < 1:1151058/287‑1 (MQ=255) tACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGCCAGTCCAATAGCAGTAGCAAGCAACCAAATAAGCGCAACCGGATTaa > 1:1102854/1‑288 (MQ=255) tACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGCCAGTCCAATAGCAGTAGAAAGCAACACAATAAGCGCAACCTg < 2:1230131/283‑1 (MQ=255) tACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGCCAGTCCAATAGCAGTAGAAAGCAACACAATAAGCGCAACCTGATTAAc < 1:1828772/289‑1 (MQ=255) cAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGCCAGTCCAATAGCAGTAGAAAGCAACACAATAAGCGCAACCTGATTAACCAggg > 1:2175247/1‑289 (MQ=255) cAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGCCAGTCCAATAGCAGTAGAAAGCAACACAATAAGCGCAACCTGATTAACCAggg > 2:320450/1‑289 (MQ=255) ttGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGCCAGTCCAATAGCAGTAGAAAGCAACACAATAAGCGCAACCTGATTAACCAGGGTGAGCGga < 1:1311114/289‑1 (MQ=255) cccTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGCCAGTCCAATAGCAGTAGAAAGCAACACAATAAGCGCAACCTGATTAACCAGGGTGAGCGGAGAGAGAc < 2:302710/289‑1 (MQ=255) cTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGCCAGTCCaa > 1:2214931/1‑227 (MQ=255) tGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGCCAGTCCAATAGCAGTAGAAAGCAACACAATAAGCGCAACCTGATTAACCAGGGTGAGCGGAGAGAGACAAc > 1:1669954/1‑289 (MQ=255) tGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGCCAGTCCAATAGCAGTAGAAAGCAACACAATAAGCGCAACCTGATTAACCAGGGTGAGCGGAGAGAGACAAc > 1:835447/1‑289 (MQ=255) cgcCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGcc < 1:1446779/211‑1 (MQ=255) cgcCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGCCAGTCCAATAGCAGTAGAAAGCAACACAATAAGCGCAACCTGATTAACCAGGGTGAGCGGAGAGAGACAACGTTTAAGc > 2:773333/1‑289 (MQ=255) 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cccTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGCCAGTCCAATAGCAGTAGAAAGCAACACAATAAGCGCAACCTGATTAACCAGGGTGAGCGGAGAGAGACAACGTTTAAGCATGTAAACCTCTTCCTTCAGGCTTTAAATGAGCAATAACCTTAATGAATGTGACGATACATTCTGGAATGGCAGTATTCTCGGCTATTGGCTGAAGTATACCCATACCCGGAAAGAGTTACTCCTTATTTGCCGTGTGGTTAGTCGCTTTACATCGGt > 2:1274206/1‑281 (MQ=255) cccTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGCCAGTCCAATAGCAGTAGAAAGCAACACAATAAGCGCAACCTGATTAACCAGGGTGAGCGGAGAGAGACAACGTTTAAGCATGTAAACCTCTTCCTTCAGGCTTTAAATGAGCAATAACCTTAATGAATGTGACGATACATTCTGGAATGGCAGTATTCTCGGCTATTGGCTGAAGTATACCCATACCCGGAAAGAGTTACTCCTTATTTGCCGTGTGGTTAGTCGCTTTACATCGGTAAGGGTAg > 1:959158/1‑289 (MQ=255) | GTTGATCAAGCCCGGCAACAAACTGGCTGACATCCGCTGACACCGTTTCTCGGTTTTGTGCACGCATCAGCGCAGGGATCAGTTCATTACGCCAGTAATCTTGTAAACCCTGTAATTGCGCCAGTTGTCCGTCTCGTTCTGCTGCTCGAGTCAACTCGGCGCTAAATGCCGTTTGTTCCATCTCTTTAATTAAGGGCTTGTCTTTCTCGCTTAATGGCACTGCCGCCAACAGACGGTAACTTTGCATGCGCAGCGATCCCGCTTTGTTGATCGCATGGGCGCTGCCCTGAACGCCTTGCACCAGCCAGCCAGAAACCGCCATCCCTGCCAGTCCAATAGCAGTAGAAAGCAACACAATAAGCGCAACCTGATTAACCAGGGTGAGCGGAGAGAGACAACGTTTAAGCATGTAAACCTCTTCCTTCAGGCTTTAAATGAGCAATAACCTTAATGAATGTGACGATACATTCTGGAATGGCAGTATTCTCGGCTATTGGCTGAAGTATACCCATACCCGGAAAGAGTTACTCCTTATTTGCCGTGTGGTTAGTCGCTTTACATCGGTAAGGGTAGG > AP012306/1082638‑1083211 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |