| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP012306 | 1082924 = | 334 (1.160) | 4 (0.010) | 4/508 | 24.8 | 1.4% | coding (123/1797 nt) | narX | sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with NarL |
| ? | AP012306 | 1083708 = | 262 (0.940) | coding (324/1392 nt) | narK | nitrate/nitrite transporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 274 total aligned reads displayed.
CTGTCATTACAGATTGGCGACCGGAAGATCCTGCGTTCTGGCAACAACGCGGTCAACGTATTGCCAGCCGCAACCTGTGGATTTCCGTTCCCTGTCTGCTGCTGGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGCTTCTTCTTTCCGAAACAGAAGCAGGGTGGCGCGCTGGGTCTGAATGGTGGTCTGGGAAACATGGGCGTCAGCGTCATGCAGTTGGTTGCTCCGCTGGTGGTATCACTGTCGATTTTCGCAGTATTTGGTAGCCAGGGCG > AP012306/1083422‑1083988 | cTGTCATTACAGATTGGCGACCGGAAGATCCTGCGTTCTGGCAACAACGCGGTCAACGTATTGCCAGCCGCAACCTGTGGATTTCCGTTCCCTGTCTGCTGCTGGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCa > 1:1803481/1‑288 (MQ=255) gTCATTACAGATTGGCGACCGGAAGATCCTGCGTTCTGGCAACAACGCGGTCAACGTATTGCCAGCCGCAACCTGTGGATTTCCGTTCCCTGTCTGCTGCTGGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCg < 1:55374/289‑1 (MQ=255) ttACAGATTGGCGACCGGAAGTTCCTGCGTTTTGGCCACAACGCGGTCAACGTATTGCCAGCCGCAACCTGTGGATTTCCGTTCCCTGTCTGCTGCTGGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTAt < 2:1184894/289‑1 (MQ=255) ttACAGATTGGCGACCGGAAGATCCTGCGTTCTGGCTACAACGCGGTCAACGTATTGCCAGCCGCAACCTGTGGATTTCCGTTCCCTGTCTGCTGCTGGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTAt < 2:158981/289‑1 (MQ=255) ttGGCGACCGGAAGATCCTGCGTTCTGGCAACAACGCGGTCAACGTATTGCCAGCCGCAACCTGTGGATTTCCGTTCCCTGTCTGCTGCTGGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGatt > 1:1951004/1‑289 (MQ=255) ggAAGATCCTGCGTTCTGGCAACAACGCGGTCAACGTATTGCCAGCCGCAACCTGTGGATTTCCGTTCCCTGTCTGCTGCTGGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGc > 1:1295447/1‑289 (MQ=255) tGCGTTCTGGCAACAACGCGGTCAACGTATTGCCAGCCGCAACCTGTGGATTTCCGTTCCCTGTCTGCTGCTGGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTctggctg > 1:1672946/1‑289 (MQ=255) gTTCTGGCAACAACGCGGTCAACGTATTGCCAGCCGCAACCTGTGGATTTCCGTTCCCTGTCTGCTGCTGGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGt > 1:2177023/1‑289 (MQ=255) tGGCAACAACGCGGTCAACGTATTGCCAGCCGCAACCTGTGGATTTCCGTTCCCTGTCTGCTGCTGGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGTTGGTCGTCGCTGGCCGGCGTTACTCCCCGGTATTCTCATTTTTCCTTGCGTCTGCCTGGGtttt > 2:36185/1‑288 (MQ=255) tGGCAACAACGCGGTCAACGTATTGCCAGCCGCAACCTGTGGATTTCCGTTCCCTGTCTGCTGCTGGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTg > 1:1590652/1‑289 (MQ=255) tGGCAACAACGCGGTCAACGTATTGCCAGCCGCAACCTGTGGATTTCCGTTCCCTGTCTGCTGCTGGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTg < 2:731529/289‑1 (MQ=255) tGGCAACAACGCGGTCAACGTATTGCCAGCCGCAACCTGTGGATTTCCGTTCCCTGTCTGCTGCTGGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGCCGCTGTACGGCGTTCATCACCGGTCTTCTGATTATTCTGTGCGCTCGTCTGGGtttt > 2:1697918/1‑288 (MQ=255) tGGCAACAACGCGGTCAACGTATTGCCAGCCGCAACCTGTGGATTTCCGTTCCCTGTCTGCTGCTGGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGCCGTCGCTGGACGGCGGTCAGCACCGGTATTCTGATTATTTCTTGCGTTGGGTTGGGTTTTg > 2:1962976/1‑289 (MQ=255) aacaacGCGGTCAACGTATTGCCAGCCGCAACCTGTGGATTTCCGTTCCCTGTCTGCTACTGGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCg < 1:1395844/288‑1 (MQ=255) acaacGCGGTCAACGTATTGCCAGCCGCAACCTGTGGATTTCCGTTCCCTGTCTGCTGCTGGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTg < 1:895139/289‑1 (MQ=255) cAACGTATTGCCAGCCGCAACCTGTGGATTTCCGTTCCCTGTCTGCTGCTTGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCt < 1:355316/289‑1 (MQ=255) aCGTATTGCCAGCCGCAACCTGTGGATTTCCGTTCCCTGTCTGCTGCTGGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTcc < 1:1848153/289‑1 (MQ=255) cGTATTGCCAGCCGCAACCTGTGGATTTCCGTTCCCTGTCTGCTGCTGGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCa < 1:833731/289‑1 (MQ=255) gcggCAGCCTGTGGATTGCCGTTCCCGGTGTGCTGCTGGCGTTTTGCGTGTGGAGGTGGTTCAGGGCTGTTGCGGTGAGCCTACCGAAAGTCGGCTTGAATTTTACGGCCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTtata < 2:883446/285‑1 (MQ=255) gCCGCAACCTTTGGTTTGCCGTTCCCGGTTGGTTGCTGGCGTTTTGCTTATTGATGTTGTTCAGAGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAg < 2:2177023/289‑1 (MQ=255) cGCAACCTGTGGATTTCCGTTCCCTGTCTGCTGCTGGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTg < 2:1413853/259‑1 (MQ=255) cGCAACCTGTGGATTTCCGTTCCCTGTCTGCTGCTGGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTtata < 1:293459/286‑1 (MQ=255) tgGATTTCCGTTCCCTGTCTGCTGCT‑GCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTg < 2:2041991/249‑1 (MQ=255) ggATTTCCGTTCCCTGTCTGCTGCTGGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTtcatcat < 2:1951004/289‑1 (MQ=255) ggATTTCCGTTCCCTGTCTGCTGCTGGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTtcatcat < 2:923368/289‑1 (MQ=255) tttCCGTTCCCTGTCTGCTGCTGGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTtcatcatca < 1:1336572/288‑1 (MQ=255) gttCCGTTCCCTGTCTGCTGCTGGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTGAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTtcatcatca < 2:812696/287‑1 (MQ=255) tCCGTTCCCTGTCTGCTGCTGGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCAtct < 2:200957/289‑1 (MQ=255) tCCGTTCCCTGTCTGCTGCTGGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGGTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGGGGTCGTCGCTGGAGGTCGTACAGCACCGGTATTTGGATTACTCTTTGCGTCTGGTGGGTTTTTGCCGTGCAGGATTCCTCCAGTCCTTATAGTTCCGTCatcatcatc > 2:940272/1‑288 (MQ=255) ccGTTCCCTGTCTGCTGCTGGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCAc < 1:874306/205‑1 (MQ=255) ttCCCTGTCTGCTGCTGGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATCCTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTACTTGCGTCTGGCTGGGCTTTGCCGTGGAGGATAACTCCACGCCTTCGAGCTTCTTCATCACCAtccctc > 2:2130998/1‑288 (MQ=255) cTGTCTGCTGCTGGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTtcatcatca < 1:1208651/278‑1 (MQ=255) ctgctgctgGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCg > 1:448085/1‑289 (MQ=255) gctgctgGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTta > 2:773369/1‑255 (MQ=255) gctgctgGCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTta < 1:773369/255‑1 (MQ=255) gCGTTTTGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACTGGTATTCTGATTATTCCTTTCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCCGGATACCGCCACGCCTTATAGCGTCTTCATTATAATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCtt > 2:1899922/1‑288 (MQ=255) tGCGTATGGATGTTGTTCAGCGCTGTTGCGGTGAGCCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGa < 2:312636/289‑1 (MQ=255) gttCAGCGCTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGt < 1:753691/289‑1 (MQ=255) cgcTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTa < 1:1906540/284‑1 (MQ=255) cgcTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGACGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTAGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTCTCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGTGCTCAGCACCGGTATTATGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCCCGCCTTATAGCGTCTTCCTCATCATCTCTCTGCCATTCGGCTTTTCTGGCTCGAACTTCTCCTCCAGttttgc > 2:1321047/1‑283 (MQ=255) cTGTTGCGGTGAACCTACCGAAAGTCAGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGTCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCaa > 1:2012407/1‑288 (MQ=255) ttGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACa > 1:1408323/1‑288 (MQ=255) ttGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACa > 1:1600506/1‑288 (MQ=255) ttGCGGTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCT‑ATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTtcatcat > 2:125140/1‑231 (MQ=255) gTGAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTa > 2:1483763/1‑274 (MQ=255) gAACCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGTCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGctta > 1:850300/1‑288 (MQ=255) aaCCTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGcttct > 1:1006138/1‑289 (MQ=255) ccTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCa > 1:2043186/1‑262 (MQ=255) ccTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCCTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCATTATGGCACCCATCCGcttct > 2:1816302/1‑287 (MQ=255) ccTACCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCCCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGcttct > 1:2001764/1‑287 (MQ=255) aCCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCTGGGTTTTGCCGTGCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCATCATCATCTCTCTGCTATGCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCAAACATCAGcttcttctt > 1:1970463/1‑288 (MQ=255) aCCGAAAGTCGGCTTTAATTTTACGACCGATCAGCTATTTATGTTGACTGCGCTGCCTTCGGTTTCTGGCGCGTTATTACGTGTTCCATACTCCTTTATGGTTCCTATCTTCGGTGGTCGTCGCTGGACGGCGTTCAGCACCGGTATTCTGATTATTCCTTGCGTCTGGCGGGGTTTTGCCGTCCAGGATACCTCCACGCCTTATAGCGTCTTCCTCATCATCTCTCTGCTATTCGGCTTTGCTGGCGCGAACTTCGCATCCAGTATGGCACACCTCCGcttcttctt > 2:1660936/1‑288 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |