New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AP012306 | = 3753641 | 186 (0.720) | 5 (0.020) | 5/512 | 21.2 | 2.6% | coding (627/789 nt) | phnC | phosphonate/organophosphate ester transporter subunit |
? | AP012306 | = 3753759 | 198 (0.800) | coding (509/789 nt) | phnC | phosphonate/organophosphate ester transporter subunit | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 205 total aligned reads displayed.
ATGTCAGGCAGCTTTCGCGTTCTCTTCGACGCGGTTAATGCTGCGGTAGAGATGGTCAAAACGTTCGTTATCAAACTGTTGGCTGCTGCCGTCGTAGAAGACGTGCCCCTGGCGCAGGGCGACGATGCGTTCGCAGTAGCGCAGGGCGTAATCCACCTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACGGGCAATCGCCACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGAGAGGGTGGAAACGCGCTGATGGGCAAAATGCACCATGCCAACGCGGGTCAGCGCCTGTAACGCGCGCTGTTTCTGCTCGCCGGTGAACCAGCTAAAACAGGTGCGCCAGAACGGCGTGCTGCCGAGCGCGCCAATCAGCACGTTCTCCAGTACGCTCAGGCGGTTCACCAGGTTGAATTGTTGGAATATGTAGCCGGTATGGGCGCGGCTTTTGCGGATATCGCGGGCCAGGCGGCCT > AP012306/3753476‑3754046 | tCAGGCAGCTTTCGCGTTCTCTTCGACGCGGTTAATGCTGCGGTAGAGATGGTCAAAACGTTCGTTATCAAACTGTTGGCTGCTGCCGTCGTAGAAGACGTGCCCCTGGCGCAGGGCGACGATGCGTTCGCAGTAGCGCAGGGCGTAATCCACCTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCAt < 1:1182994/288‑1 (MQ=255) tCGCGTGCTCTTCGACGCGGTGAATGCGGCGGTAGAGATGGTCAAAACGTTCGTTATCAAACTGTTGGCTGCTGCCGTCGTAGAAGACGTGCCCCTGGCGCAGGGCGACGATGCGTTCGCAGTAGCGCAGGGCGTAATCCACCTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACGGGc < 2:838386/289‑1 (MQ=255) ttCGACGCGGTTAATGCTGCGGTAGAGATGGTCAAAACGTTCGTTATCAAACTGTTGGCTGCTGCCGTCGTAGAAGACGTGCCCCTGGCGCAGGGCGACGATGCGTTCGCAGTAGCGCAGGGCGTAATCCACCTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACGGGCAATCGCcac > 2:1102951/1‑288 (MQ=255) ggTTAATGCTGCGGTAGAGATGGTCAAAACGTTCGTTATCAAACTGTTGGCTGCTGCCGTCGTAGAAGACGTGCCCCTGGCGCAGGGCGACGATGCGTTCGCAGTAGCGCAGGGCGTAATCCACCTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACGGGCAATCGCCACACGTtgct > 1:354657/1‑288 (MQ=255) ggTTAATGCTGCGGTAGAGATGGTCAAAACGTTCGTTATCAAACTGTTGGCTGCTGCCGTCGTAGAAGACGTGCCCCTGGCGCAGGGCGACGATGCGTTCGCAGTAGCGCAGGGCGTAATCCACCTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACGGGCAATCGCCACACGTtgct > 1:1109952/1‑288 (MQ=255) ttAATGCTGGGGTAGAGATGGTAAAAACGTTCGTTATCAACCTGTTGGCTGCTGCCGTCGTAGAAGACGTGCCCCTGGCGAAGGGCGACGATGCGTTCGCAGTAGCGCAGGGCGTAATCCACCTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACGGGCAATCGCCACACGTTgctgct < 2:1927389/289‑1 (MQ=255) gttaTGCTGGGGTAGAGATGGGCAAAACGTTCGTTATCAAACTGTTGGCTGCTGCCGTCGTAGGAGACGTGCCCCTGGCGCAGGGCGACGATGCGTTCGCAGTAGCGCAGGGCGTAATCCACCTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACGGGCAATCGCCACACGTTgctgct < 2:1853033/286‑1 (MQ=255) aaTGCTGCGGTAGAGATGGTCAAAACGTTCGTTATCAAACTGTTGGCTGCTGCCGTCGTAGAAGACGTGCCCCTGGCGCAGGGCGACGATGCGTTCGCAGTAGCGCAGGGCGTAATCCACCTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACGGGCAATCGCCACACGTTGCTGCTgg < 2:1389705/289‑1 (MQ=255) aaTGCTGCGGTAGAGATGGTCAAAACGTTCGTTATCAAACTGTTGGCTGCTGCCGTCGTAGAAGACGTGCCCCTGGCGCAGGGCGACGATGCGTTCGCAGTAGCGCAGGGCGTAATCCACCTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACGGGCAATCGCCACACGTTGCTGCTgg < 2:243809/289‑1 (MQ=255) cGGTAGAGATGGTCAAAACGTTCGTTATCAAACTGTTGGCTGCTGCCGTCGTAGAAGACGTGCCCCTGGCGCAGGGCGACGATGCGTTCGCAGTAGCGCAGGGCGTAATCCACCTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACGGGCAATCGCCACACGt < 1:515338/273‑1 (MQ=255) cGGTAGAGATGGTCAAAACGTTCGTTATCAAACTGTTGGCTGCTGCCGTCGTAGAAGACGTGCCCCTGGCGCAGGGCGACGATGCGTTCGCAGTAGCGCAGGGCGTAATCCACCTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACGGGCAATCGCCACACGt > 2:515338/1‑273 (MQ=255) agagATGGTCAAAACGTTCGTTATCAAACTGTTGGCTGCTGCCGTCGTAGAAGACGTGCCCCTGGCGCAGGGCGACGATGCGTTCGCAGTAGCGCAGGGCGTAATCCACCTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACGGGCAATCGCCACACGTTGCTGCTGGCCGCCGgaga < 1:1042470/288‑1 (MQ=255) gagaTGGTCAAAACGTTCGTTATCAAACTGTTGGCTGCTGCCGTCGTAGAAGACGTGCCCCTGGCGCAGGGCGACGATGCGTTCGCAGTAGCGCAGGGCGTAATCCACCTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACGGGCAATCGCCACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGAGAgg > 1:975039/1‑289 (MQ=255) ggTCAAAACGTTCGTTATCAAACTGTTGGCTGCTGCCGTCGTAGAAGACGTGCCCCTGGCGCAGGGCGACGATGCGTTCGCAGTAGCGCAGGGCGTAATCCACCTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACGGGCAATCGCCACCCGGTGCTTCTGGCCGCCGGAGGGTGTGGa > 2:824949/1‑289 (MQ=255) gTCAAAACGTTCGTTATCAAACTGTTGGCTGCTGCCGTCGTAGAAGACGTGCCCCTGGCGCAGGGCGACGATGCGTTCGCAGTAGCGCAGGGCGTAATCCACCTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACGGGCAATCGCCACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGAGAGGGTGGaa > 1:1693939/1‑289 (MQ=255) gTCAAAACGTTCGTTATCAAACTGTTGGCTGCTGCCGTCGTAGAAGACGTGCCCCTGGCGCAGGGCGACGATGCGTTCGCAGTAGCGCAGGGCGTAATCCACCTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACGGGCAATCGCCACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGAGAGGGTGGaa > 2:1562433/1‑289 (MQ=255) gTCAAAACGTTCGTTATCAAACTGTTGGCTGCTGCCGTCGTAGAAGACGTGCCCCTGGCGCAGGGCGACGATGCGTTCGCAGTAGCGCAGGGCGTAATCCACCTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACGGGCAATCGCCACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGAGAGGGTGGaa > 1:812566/1‑289 (MQ=255) tCAAAACGTTCGTTATCAAACTGTTGGCTGCTGCCGTCGTAGAAGACGTGCCCCTGGCGCAGGGCGACGATGCGTTCGCAGTAGCGCAGGGCGTAATCCACCTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACGGGCAATCGCCACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGAGAGGGTGGaa > 1:537969/1‑288 (MQ=255) acgcggtgctgatGCGGTCGTGGAAGACGGGCCCCGTGTGAAGGGCGACGTTGCGTTCGCAGTAGAGCAGGGCGTAGTCCACCTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCGGGTTGATGTGGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGGGGCGATTGGGTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACGGGCAATCGCCACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGAGAGGGTGGAAACGCGCTGATGGGCAAAATg < 2:1656543/282‑1 (MQ=255) ttGGCTGCTGCCGTCGTAGAAGACGTGCCCCTGGCGCAGGGCGACGATGCGTTCGCAGTAGCGCAGGGCGTAATCCACCTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACGGGCAATCGCCACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGAGAGGGTGGAAACGCGCTGATGGGCAAAATGCAcc > 1:74805/1‑289 (MQ=255) ttGGCTGCTGCCGTCGTAGAAGACGTGCCCCTGGCGCAGGGCGACGATGCGTTCGCAGTAGCGCAGGGCGTAATCCACCTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACGGGCAATCGCCACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGAGAGGGTGGAAACGCGCTGATGGGCAAAATGCAcc > 1:64612/1‑289 (MQ=255) tgcggcCGTCGTAGAAGACGTGCCCCTGGCGCAGGGCGACGATGCGTTCGCAGTAGCGCAGGGCGTAATCCACCTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACGGGCAATCGCCACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGAGAGGGTGGAAACGCGCTGATGGGCAAAATGCACCATGc < 1:1173466/288‑1 (MQ=255) tgcCGTCGTAGAAGACGTGCCCCTGGCGCAGGGCGACGATGCGTTCGCAGTAGCGCAGGGCGTAATCCACCTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTTCATCAGCGCACGGGCAATCGCCACACGTTCCTGCGGGCCGCCGGAGAGGGTGGAAACGCGCCTGTTGGCAAAATGCCCCATGCCaa > 2:812922/1‑288 (MQ=255) tgaaagggcaggCCCCTGGCGCCAGGCGGCGATGCGTTCGCAGTAGCGCATGGCTTACGCCACCTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCGGGTTGATGTCGGGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATTGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACGGGCAATCGCCACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGAGAGGGTGGAAACGCGCTGATGGGCAAAATGCACCATGCCAACGCGGGTc < 2:1901197/278‑1 (MQ=255) cGTGCCCCTGGCGCAGGGCGACGATGCGTTCGCAGTAGCGCAGGGCGTAATCCACCTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACTGGCAATCGCCACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGAGAGGGTGGAAACGCGCTGATGGGCAAAATGCACCATGCCAACGCGGGTCAGCGCCTg > 1:493974/1‑289 (MQ=255) tGGCGCAGGGCGACGATGCGTTCGCAGTAGCGCAGGGCGTAATCCACCTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACGGGCAATCGCCACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGAGAGGGTGGAAACGCGCTGATGGGCAAAATGCACCATGCCAACGCGGGTCAGCGCCTGTAAcgcgc < 1:1562433/289‑1 (MQ=255) ggcgacgggCGGCGATGCTGTGGCAGTGGCGCGGGGCGTAATCCTCCTGATGCGGCGTGATGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGGAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGGTTCTGGGTCCAGCGCGGCGATGGGTTCATCGGACAGAAGCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACGGGCAATCGCCACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGAGAGGGTGGACACGCGCTGATGGGCAGAATGCACCATGCCAACGCGGGTCAGCGCCTGTAAcgcgcg < 2:787946/283‑1 (MQ=255) ggCGCAGGGCGACGATGCGTTCGCAGTAGCGCAGGGCGTAATCCACCTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACGGGCAATCGCCACACGTTGCTGCTTGCCCCCGGAGAGGGTGGAAACGCGCTGACGGGCAAAATGCACCCTGCCACCGCGGGTCGCCCCCCGTACcgcgc > 2:1043166/1‑288 (MQ=255) 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cTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACGGGCAATCGCCACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGAGAGGGTGGAAACGCGCTGATGGGCAAAATGCACCATGCCAACGCGGGTCAGCGCCTGTAACGCGCGCTGTTTCTGCTCGCCGGTGAACCAGCTAAAACAGGTTCGCCAGaa > 2:878589/1‑288 (MQ=255) cTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACGGGCAATCGCCACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGAGAGGGTGGAAACGCGCTGATGGGCAAAATGCACCATGCCAACGCGGGTCAGCGCCTGTAACGCGCGCTGTTTCTGCTCGCCGGTGAACCAGCTAAAACAGGTGCGCCAGAAc > 1:440736/1‑289 (MQ=255) cTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACGGGCAATCGCCACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGAGAGGGTGGAAACGCGCTGATGGGCAAAATGCACCATGCCAACGCGGGTCAGCGCCTGTAACGCGCGCTGTTTCTGCTCGCCGGTGAACCAGCCAAAACAGGTGCGCCAGAAc > 1:1898194/1‑289 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |