New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NZ_CP025268 | = 3743324 | 0 (0.000) | 284 (0.510) | 79/274 | 2.2 | 100% | intergenic (‑100/‑82) | yiaJ/galK | IclR family transcriptional regulator YiaJ/galactokinase |
? | NZ_CP025268 | 3744556 = | 0 (0.000) | intergenic (+2/‑99) | galK/yiaK | galactokinase/3‑dehydro‑L‑gulonate 2‑dehydrogenase |
Only 100 of 287 total aligned reads displayed.
CATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AA‑C‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCCTGTTGACAATTAATCATCGGCATAGTATATCGGCATAGTATAATACGACAAGGTGAGGAACTAAACCCAGGAGGCAGATCATGAGTCTGAAAGAAAAAACACAATCTCTGTTTGCCAACGCATTTGGCTACCCTGCC > NZ_CP025268/3743186‑3743462 | cATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTCGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATC > 2:1782136‑M1/1‑140 (MQ=255) ctcGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCaga < 2:4576857‑M1/140‑4 (MQ=255) acgTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagat < 1:6273374‑M1/139‑5 (MQ=255) ttCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgc > 1:5718446‑M1/1‑133 (MQ=255) ttCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgc > 2:2012332‑M1/1‑133 (MQ=255) tctcTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcc < 2:4105585‑M1/140‑9 (MQ=255) tctcTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcc < 1:5497003‑M1/140‑9 (MQ=255) tctcTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcc < 2:735253‑M1/140‑9 (MQ=255) tctcTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCAATTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcc < 2:5065297‑M1/140‑9 (MQ=255) tctcTTTTTTTCCCATCACGTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGGTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcc < 2:168407‑M1/140‑9 (MQ=255) tctcTATTGCTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCAGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATCTAT‑AACC‑AATTGAATTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcc < 1:7126263‑M1/140‑9 (MQ=255) ctcaTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGGAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcct < 1:2996200‑M1/140‑10 (MQ=255) tctTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcctt < 2:1435548‑M1/140‑11 (MQ=255) tttttttCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGAGTTTTATGTCGTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgg > 2:7820765‑M1/1‑128 (MQ=255) tttCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaa < 1:8125827‑M1/140‑17 (MQ=255) tttCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATATAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaa < 2:4342986‑M1/140‑17 (MQ=255) tCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaa < 1:6765226‑M1/140‑19 (MQ=255) tCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaa < 2:8884778‑M1/140‑19 (MQ=255) ccctcacTTCTTTCCCCATTTGGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCACAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATATAT‑AACC‑AATGGATTTTTATGTCTATTGAAATTCATCAATCcgattgccttgttaaaaagt < 2:7674337‑M1/137‑21 (MQ=255) ccATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagt < 2:6189541‑M1/140‑21 (MQ=255) aTCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGCTGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtga > 2:2205956‑M1/1‑118 (MQ=255) aTCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtga > 1:8706038‑M1/1‑118 (MQ=255) aTCACTTATTTCCACATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGAGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTGTTATGTCTTTTGATATTCATCAATCagattgccttgttaagtagtga > 2:6592003‑M1/1‑118 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 1:4734193‑M1/140‑24 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 1:8999500‑M1/140‑24 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 2:2698330‑M1/140‑24 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 1:8863725‑M1/140‑24 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 2:4019028‑M1/140‑24 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 2:5130827‑M1/140‑24 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 1:4243561‑M1/140‑24 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 1:3617737‑M1/140‑24 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTATGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 1:6465180‑M1/140‑24 (MQ=255) ttcttTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgat > 2:9080675‑M1/1‑113 (MQ=255) tCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgtgatagt > 1:1010137‑M1/1‑108 (MQ=255) ccATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgagcgatatatttga > 1:7635184‑M1/1‑105 (MQ=255) cATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaa > 1:9488978‑M1/1‑104 (MQ=255) aTTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaa > 2:3164435‑M1/1‑103 (MQ=255) aTTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaa > 1:7741319‑M1/1‑103 (MQ=255) tttGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCACAGAGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATGTATCAC‑C‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAAACagattgccttgtgacaaagtgtgcgatatatttgacatg > 2:8568435‑M1/1‑101 (MQ=255) tttGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatc < 1:2678048‑M1/140‑40 (MQ=255) tttGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatc < 2:2586646‑M1/140‑40 (MQ=255) tttGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatc < 1:3269807‑M1/140‑40 (MQ=255) tttGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatc < 1:8371823‑M1/140‑40 (MQ=255) cgcgTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtt > 2:1014697‑M1/1‑96 (MQ=255) tCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgc > 1:2638654‑M1/1‑92 (MQ=255) tCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgc > 1:5958208‑M1/1‑92 (MQ=255) tCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAAGTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgc > 2:6930849‑M1/1‑92 (MQ=255) aGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaat > 1:9125921‑M1/1‑82 (MQ=255) aGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATGTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaat > 1:1937130‑M1/1‑82 (MQ=255) gcgcAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATACTTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaatt > 1:6395324‑M1/1‑81 (MQ=255) gcgcAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaatt > 2:7251553‑M1/1‑81 (MQ=255) cgcAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcatgtttcgcatattgaaattt > 1:798371‑M1/1‑80 (MQ=255) cgcAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattt > 2:1290766‑M1/1‑80 (MQ=255) cgcAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattt > 2:7302824‑M1/1‑80 (MQ=255) gcAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaatttt > 2:6014496‑M1/1‑79 (MQ=255) tgtgCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagcca > 1:8657973‑M1/1‑73 (MQ=255) tgCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaa > 1:5235083‑M1/1‑71 (MQ=255) ccGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaa > 2:2949488‑M1/1‑69 (MQ=255) aGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcg < 2:4172288‑M1/140‑76 (MQ=255) aGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcg < 1:3362665‑M1/140‑76 (MQ=255) ttCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgat > 1:214319‑M1/1‑63 (MQ=255) ttCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgat > 2:153478‑M1/1‑63 (MQ=255) ttCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgat > 1:5369685‑M1/1‑63 (MQ=255) cACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatca > 2:13102‑M1/1‑61 (MQ=255) cACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatca > 2:5726519‑M1/1‑61 (MQ=255) aCGATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTATATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaa < 1:4400925‑M1/140‑81 (MQ=255) gATCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑CATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaa > 1:1567503‑M1/1‑58 (MQ=255) aTCTCGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaa < 2:3825973‑M1/140‑84 (MQ=255) tctcGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaa > 2:3694578‑M1/1‑56 (MQ=255) tctcGACAGATAATTTAT‑AA‑CAAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcctttttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaa < 2:2375737‑M1/140‑85 (MQ=255) cGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaataca > 1:959246‑M1/1‑53 (MQ=255) cGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaaca > 1:1641200‑M1/1‑53 (MQ=255) cGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaaca > 2:5140815‑M1/1‑53 (MQ=255) cGACAGATAATTTAT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaaca > 2:5556794‑M1/1‑53 (MQ=255) tatTTCT‑AACC‑AATTGATTTTTATGTCTATTGAAATACATCAATCagattgccatgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcc < 2:8089213‑M1/139‑96 (MQ=255) ataacc‑aattgATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgttcaaaaaaacaagtaagcctggga > 2:8711148‑M1/6‑40 (MQ=255) acc‑aaTTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatga > 2:3579613‑M1/3‑37 (MQ=255) acc‑aaTTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatga > 2:3042481‑M1/3‑37 (MQ=255) acc‑aaTTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatga > 1:7150051‑M1/3‑37 (MQ=255) aTTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagcccaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagt > 1:3933430‑M1/1‑33 (MQ=255) aTTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaatt > 2:3236863‑M1/1‑33 (MQ=255) aTTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagt > 2:6974530‑M1/1‑33 (MQ=255) aTTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagt < 2:7984139‑M1/140‑108 (MQ=255) aTTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagt > 1:2731795‑M1/1‑33 (MQ=255) aTTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgaacgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagt > 1:4601449‑M1/1‑33 (MQ=255) ttGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtg > 1:784171‑M1/1‑32 (MQ=255) ttATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttg < 2:4456616‑M1/140‑116 (MQ=255) tATGTCTTTAGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaaatttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaagtaagccagtgatgaaagtgacatatga > 2:8489890‑M1/1‑24 (MQ=255) aTGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgag < 1:3479448‑M1/140‑118 (MQ=255) aTGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgataaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgag < 2:2401432‑M1/140‑118 (MQ=255) aTGTCTTTTGAAATTCATCAATCagagtgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgag < 2:6430183‑M1/140‑118 (MQ=255) gTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgagca > 1:7440129‑M1/1‑21 (MQ=255) atattCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttctcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgacagtgacatttgagcagttaaaag < 2:4531684‑M1/138‑128 (MQ=255) aaaTTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgagcagttaaaag < 1:5009325‑M1/140‑128 (MQ=255) aaaTTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtagcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgagcagttaaaag < 1:1291843‑M1/140‑128 (MQ=255) aaaGTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgagcagttaaaag < 2:8167821‑M1/140‑128 (MQ=255) aaTTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgagcagttaaaagc < 1:9300421‑M1/140‑129 (MQ=255) aaTTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgagcagttaaaagc < 2:9481548‑M1/140‑129 (MQ=255) catcaATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgagcagataaaagcagcc > 1:6933712‑M1/1‑8 (MQ=255) tcagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgagcagttaaaagcagcctttaat < 1:9169068‑M1/140‑139 (MQ=255) | CATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTAT‑AA‑C‑AATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCCTGTTGACAATTAATCATCGGCATAGTATATCGGCATAGTATAATACGACAAGGTGAGGAACTAAACCCAGGAGGCAGATCATGAGTCTGAAAGAAAAAACACAATCTCTGTTTGCCAACGCATTTGGCTACCCTGCC > NZ_CP025268/3743186‑3743462 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |