| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP025268 | = 780271 | 543 (0.800) | 39 (0.070) | 23/238 | 10.5 | 9.4% | noncoding (76/76 nt) | CXP41_RS04105 | tRNA‑Lys |
| ? | NZ_CP025268 | 780858 = | 280 (0.480) | intergenic (+1/‑276) | CXP41_RS04120/nadA | RtT sRNA/quinolinate synthase NadA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 310 total aligned reads displayed.
TCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NZ_CP025268/780115‑780271‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atcctgcacgacccaccaATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTG > NZ_CP025268/780858‑780996 TCGGGTGATTCGCTCAGCTGGGTGAGCACCTCCCTTACCAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGCTCCCGTCATCACCCACCCCTCGGGTCGTTTGCTCAGATGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAA < 2:8767797/140‑1TCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAA < 2:9654161/140‑1TCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAA < 2:7997884/140‑1TCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAA < 1:6435691/140‑1 GGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCC > 1:4700863/1‑140 GGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCC > 1:3316798/1‑140 TGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGAGCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTG < 2:8843441/140‑1 ATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACACGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGTTAGAGCTGTTTACTTTAAATCTATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA < 1:762483/140‑1 ATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA < 1:6133590/140‑1 TTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCAC > 2:10701960/1‑140 TTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCAC > 1:7718341/1‑140 TTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCAC > 1:7343476/1‑140 TTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCAC > 1:11405565/1‑140 AGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGA < 2:8458244/140‑1 AGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGA > 1:5195657/1‑140 CAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCAACACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCA < 1:6929859/140‑1 AGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCAC < 1:7802213/140‑1 AGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCAC > 2:6740500/1‑140 GCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACC < 2:9034508/140‑1 GCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACC < 2:1917917/140‑1 CTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCA > 2:9426055/1‑140 CTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCA > 2:7422651/1‑140 CACATCCCTTACAATGAGTGGGTCGGCGGTTAGATCCCGCCATCACCCACCTCTTGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAgg < 1:7189857/140‑3 ACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTGTAAAAAA > 2:429476/1‑140 ACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTGTAAAAAA > 1:11418827/1‑140 CCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAG < 2:3087540/140‑1 ccGAGGGGTTCGGCTCTTAGATACCGTCATAACCCACCAAACGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGG < 2:1345896/138‑1 AGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGTGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCATTTTAAAAAACCGCCCTATAGGCGC > 1:1325565/1‑140 AGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCTACCAAAAGGCGC > 2:11595408/1‑140 GGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCTGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGTATCCTGCACGACCCACCATTGAAAATAAGCGACCTACAGGCGCTg > 2:11183402/1‑139 GGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAAAAGAGCCCTAAAGGCGCTT > 2:6383541/1‑140 GGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA < 2:5223547/103‑1 CCACCCCACGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACGTTTACTCAATTGGTCGCAGGTACGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCA < 1:8904553/140‑1 TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAA < 1:3652544/61‑1 GGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA < 2:2390259/65‑1 GGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA < 1:8471688/65‑1 GTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCAC > 1:1545950/1‑72 GTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAA > 1:1669393/1‑57 CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCA < 2:5681793/72‑1 CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCA < 2:10501460/72‑1 CGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCA > 1:10501461/1‑72 TTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA > 1:2256427/1‑60 TTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA < 2:2256427/60‑1 AGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCAC < 2:4782812/66‑1 CAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAAAATCGCCCTAAAAGAGCTATTTTGCTATTCAGGCAACATAAAATTCACAATGTAAACCAGAAGACATC > 2:1497500/1‑140 CAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGA > 1:5782754/1‑57 CAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGA < 2:5782753/57‑1 CAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAA < 1:8731721/47‑1 AGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCAC > 2:4687777/1‑61 TTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA > 1:5569835/1‑51 TGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCAC > 2:11411414/1‑58 TGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCA > 2:6222596/1‑57 GAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA < 2:2901316/45‑1 ggAGTTGACTTTTAATCTCGTGTTCGAAGGTTCTAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGCTTA < 1:1497500/138‑1 GCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCTCCCTAAAGGAGCTTTTTTGCTATACAGTAATCCTCAATAACACATTGTAAACCTGATGACATCGTCACAGCatc > 2:607938/1‑137 GCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCAC < 2:3516862/51‑1 GCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA < 1:2922915/43‑1 GCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA > 1:9843233/1‑43 GCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCT > 1:4181473/1‑40 CAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA < 2:7270128/42‑1 AGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCAC < 2:9039983/49‑1 AGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCAC > 2:175488/1‑49 TTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCAC < 1:1811276/47‑1 GACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCAC > 2:9197857/1‑45 GACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCAC < 1:9197987/45‑1 GACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCA > 2:1645190/1‑37 TTTTATTCAAGTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGCAAG < 2:5962303/140‑1 ATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACC > 1:9186410/1‑38 GTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTG > 1:11336656/1‑63 GTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTG < 2:11336655/63‑1 CACGCCCCACCAATGTAATAAAGCGCCCGAACGGCGCTTTGTTGCTATTCCGGCATCCGCAATTTCACTGTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGAAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAAT > 2:4176295/1‑140 CACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAATCCTGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAAT > 1:440343/1‑140 CACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAAT > 2:3362630/1‑140 CACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAAT > 1:9378251/1‑140 ACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATG > 1:5011729/1‑140 GACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTCACGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGAC < 1:9687621/140‑1 GACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGAC < 1:5255089/140‑1 GACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGAC < 1:10887676/140‑1 GACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGAC < 2:24566/140‑1 CCCACCAATGTAACAAAGCGCCCTAACGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGC < 1:8295536/140‑1 CCCACCAATGTAAAAATGCGCCCTCATGGCGATTTTTTGCTATTCAGGCATCCTAAATTTCACTTTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGATTACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTCGGAGTAAAATGACGC > 2:551881/1‑140 CCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGGTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAATCCTGATGACATCGTCAGAGCTTTCTGTGCAAGCAAATCTATGTCGGTGGAATTTTGCGTAAAATGtctc > 2:10167120/1‑136 CCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGC > 2:5373063/1‑140 CCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGC > 1:2859801/1‑140 CCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGC > 1:10600284/1‑140 CCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGC > 2:8284243/1‑140 CCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGC > 1:4584882/1‑140 CCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAAT < 2:11122147/123‑1 CCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAAT > 1:11122148/1‑123 CCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAAACATGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAATTGACGC > 2:3886264/1‑140 CCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCGAAAGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGC > 2:2975806/1‑140 CACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCAT < 2:10562948/140‑1 CACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCAT > 2:2221787/1‑140 ACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATC > 1:10740697/1‑140 ACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATC > 1:3839638/1‑140 ACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATC > 1:10123419/1‑140 CCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCC < 2:8523694/140‑1 CAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCT > 2:8650331/1‑140 CAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCT > 2:3959987/1‑140 AATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTG < 1:9947870/140‑1 TCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NZ_CP025268/780115‑780271‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atcctgcacgacccaccaATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATTCAGGCATCCTCAATTTCACTTTGTAAACCTGATGACATCGTCAGAGCTTACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTG > NZ_CP025268/780858‑780996 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |