| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP025268 | 780418 = | 440 (0.650) | 141 (0.210) +GG |
36/270 | 8.5 | 23.9% | noncoding (1/76 nt) | CXP41_RS04110 | tRNA‑Lys |
| ? | NZ_CP025268 | = 2525041 | 469 (0.690) | noncoding (76/76 nt) | CXP41_RS13255 | tRNA‑Val | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
CTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP025268/780555‑780418‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑T‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGGAGAGTTCAAAATGAGTCAACGCATTTTCTAAAGAAAT < NZ_CP025268/2525041‑2524903 ||||| CTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑Ga < 2:4960389/140‑2 GGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGT < 2:5101168/140‑1 GTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑GA‑GT‑GGTGGGT < 1:2440610/140‑1 GTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTG > 1:4909867/1‑140 CTAACGCAACGTTATCCTTCACGGTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACAGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGAGGA > 2:8703411/1‑140 TTACCCTCCCCGTTCTCTACCAGGAACCACCTTAAAACTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAAC < 2:5695581/140‑1 TTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑G < 2:8654185/110‑1 CACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACC > 2:10233601/1‑140 CACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATAGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑TT‑CGTGGGTGATGACGGGATCGAAACGACGACC > 2:3457820/1‑140 cTTCTCTACAATTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑GA‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCC < 2:5796122/139‑1 TTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCT < 1:10233602/140‑1 tcaCTACCTTTAACCACCTTTAAATGGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTC < 1:8318914/137‑1 TCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑GA‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCT < 2:10095867/140‑1 CTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑GA‑GG‑GGGGGGTGATGTCGGGATCGAACCGCCGACCCCCTC > 2:5376760/1‑140 TCTACCAGTAACCACCTTTCAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGAGTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACGGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GG‑GGTGGGTGATGACGGGCTCGTACCGCCGACCCCCTCCT > 2:7421079/1‑140 TCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑GA‑GG‑GGTGGGTCAGGACGGGATCGAACCGCCGACCCCATCa > 1:10464632/1‑139 TACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTTAAGACGGGATAGAACCCCCGGCCCCCACCcat > 1:2270619/1‑137 tacCCACATTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGG < 1:1261855/137‑1 TAACCACCTTTAAACTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGG > 1:3415214/1‑140 ACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCCTA‑‑GA‑GGTGGGTGAAGACTGGATAGAAACGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGA > 2:7744062/1‑140 ACCACCTTTAAACTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAG > 2:5588151/1‑140 CACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑ATAGGTGGGTGAAGACGGGATCTAACCGCCGACCCCCTCATTGAAAGtgctg > 2:2756447/1‑135 CACCTTTAAATTGGAGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCACCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGT > 2:3646447/1‑140 CCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCCAA‑‑GA‑GGTGGGTGATGGCGGGATCTAACCGCCGACCCACTCATTGTAAGGGATGTG > 1:7189857/1‑140 gggGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCT < 1:1201172/137‑1 GGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCT > 2:10227840/1‑140 GGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCT > 2:7366752/1‑140 GTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTG > 1:1531603/1‑140 GTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTG < 1:5656117/140‑1 GTGGGACGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTG > 2:5497141/1‑140 TGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGA > 1:9747551/1‑140 GGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAG < 2:10076222/140‑1 GGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAG < 1:8566474/140‑1 GGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAA < 2:4519093/96‑1 GTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGCGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCT < 2:1891615/140‑1 TCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTA > 2:10816400/1‑140 TCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTA > 1:481168/1‑140 CGTGCCGCATTCCAACCTGCGACCAATTCATTAATAGTCAACTGCTCGACCAACTGAGATAACGA‑CCC‑G‑‑GG‑GGTGGGTGAAGTAGTGATCGAACCGCCGAACCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAA < 1:197123/140‑1 CGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAA < 1:6075511/140‑1 CGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAA < 1:4050657/140‑1 CGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAA < 2:4831617/140‑1 CGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAA < 1:3692202/140‑1 CGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAA < 2:5803477/140‑1 CGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAA < 2:6866023/140‑1 CGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAA < 1:8569005/140‑1 CGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAA < 1:10877087/140‑1 CGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACGGCTCTACCACCTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAA < 1:6103954/140‑1 GTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAA < 2:8047994/140‑1 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCACTTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCGCACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGGGATGAAGGGATCGAACCGCCGACCGCCTCCGCGTCAGGCAGGGGCTCTCCCAGCTGAGCTAAgc > 2:2334141/1‑138 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCCACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTGGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 2:3957202/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTAGCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 1:8424610/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTTGGTTATGAAGGGATCGAACCTCCGACCCCCTCCTGGTAAGGGAGTTGCTCTCACAGCTGAGATAATC > 1:2684938/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGTTGAGGGGATAGTAACGCCGACCCCCTCCTTGGCAGGGTGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTcagc > 2:7447798/1‑136 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGTAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 1:2983021/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 1:8332737/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 1:7701088/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 1:3938486/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 1:6496081/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 1:8367326/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 2:1107293/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCT > 1:2850733/1‑124 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCT < 2:2850733/124‑1 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCACAACCAGATGAGCTAATC > 1:5517178/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTGGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 2:10587401/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACC > 1:374199/1‑100 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGAAGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTAGTAAGGGAGGTGATCTCCCAGCAGAGCTAATC > 2:6129845/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACGGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 1:6039775/1‑140 GCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCA < 1:8718270/140‑1 CAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCAC > 1:1964172/1‑140 CAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCC > 2:3057008/1‑100 CAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCC < 1:3057009/100‑1 CAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACC < 1:4665621/98‑1 tGGATTCGAACTTTCGACCAATTGATTAAATTTAAACTGCTATCCCAACTGAGCTAACGA‑CCG‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 2:7225793/139‑1 cGGATTGGACCCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCACCTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 1:7538550/139‑1 agtATTCTAACCTGCGACCATTTGATTAAAAGTCAACTGCTATACCAAATGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 1:1111457/137‑1 agcATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 2:7799987/137‑1 AGGATTCTAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 2:9538139/140‑1 AGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 1:9500699/140‑1 AGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 2:9373472/140‑1 AGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 2:11035411/140‑1 AGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 1:11517251/140‑1 AGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 2:384563/140‑1 AGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 1:4961099/140‑1 AGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 1:992660/140‑1 AGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 1:8686868/140‑1 AGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 1:10098258/140‑1 AGGATTCGAACCTGCGAACAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCAGACCCCCTCCTTGTAAGGGATGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 2:2558403/140‑1 TTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAA < 1:7396895/131‑1 CGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑GAAGT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGG < 2:8095686/140‑1 ACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑GAAGT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAG > 2:6687805/1‑140 cTTGATTAAAAGTCAACTGCTCCACCCCCTGAGCTAACGA‑CCC‑GATGT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGC < 2:4400555/139‑1 ATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑GAAGT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGC < 2:6190366/140‑1 ATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAAC < 2:605090/69‑1 CAACTGCTCGACCTACTGAGCTACCGA‑CCC‑GACGT‑GGTGGGTGATGACGGGCTCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGGAGAG < 1:8856387/140‑1 TACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑GAAGT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGAGGAGTCGCTTTATAGGGAGAGTTCAAAATG > 1:9043760/1‑140 TGAGCTAACGA‑CCC‑GAAGT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGGAGAGTTCAAAATGAGTC < 2:5844373/137‑1 TGAGCTAACGA‑CCC‑GAAGT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGGAGAGTTCAAAATGAGTC > 1:5844374/1‑137 GCTAACGA‑CCC‑GAAGT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGGAGAGTTCAAAATGAGTCAACGCA > 1:3188798/1‑140 GCTAACGA‑CCC‑GAAGT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCAGGGTGGAGTCGCATTATAGGGAGAGTTCAAAATGAGTCAACGCA > 1:3056476/1‑140 gtaG‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGCCCCCCTGCTGGTAAGGGAGGTGCTCTCCCTGCTGTGCTACTCACCCCCGGTGTGTGGAGTCGCTTTATAGGGAGAGTTCAAGATGAGTCAACGCATGTTCTAAAG > 2:2648481/4‑140 ||||| CTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP025268/780555‑780418‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑T‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACCCCCGCTGTGTGGAGTCGCATTATAGGGAGAGTTCAAAATGAGTCAACGCATTTTCTAAAGAAAT < NZ_CP025268/2525041‑2524903 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |