| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP025268 | 695911 = | 0 (0.000) | 203 (0.740) +GAAGAAACAATC |
40/250 | 2.9 | 62.4% | intergenic (‑33/+2) | CXP41_RS03680/CXP41_RS03685 | tRNA‑Gln/tRNA‑Gln |
| ? | NZ_CP025268 | = 696182 | 268 (0.890) | intergenic (‑1/+379) | CXP41_RS03695/asnB | tRNA‑Met/asparagine synthase B | |||||
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
ATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGG > NZ_CP025268/695820‑696049 | ctcgtggctacgacgggattcgaacctgtgcccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactcagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAc > 2:2449372‑M1/92‑140 (MQ=255) tggtggctccgccgggattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAcc > 2:3817329‑M1/91‑140 (MQ=255) tggtggctacgacgggattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTTGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGGATCAAAAAcc < 1:2319627‑M1/50‑1 (MQ=255) tggtggctacgacgggattcgaacctgtgacaccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGACTTGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGTATGCCGGGATCAATAAcc < 2:1337915‑M1/50‑1 (MQ=255) ggtggctacgacgggattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCg > 1:2681546‑M1/90‑140 (MQ=255) ggtggctacgacgggattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCg > 1:2425957‑M1/90‑140 (MQ=255) tggctacgacgggattcgaacctgtgaccccatccttatgagtgatgtgctctaacgcactgagctacgtagacagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGt > 2:1375138‑M1/88‑140 (MQ=255) tggcgatgacgggattcgatagtgtgagcgcatcattatgagtgatgggctctaaccaactgagctacgtagccagagtgtttcgtcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGGATGCGGGTATCAAAAACcggc > 2:3231482‑M1/88‑139 (MQ=255) ggattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCt > 1:3351827‑M1/77‑140 (MQ=255) ggattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCt > 1:518502‑M1/77‑140 (MQ=255) ggattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCt > 1:2967521‑M1/77‑140 (MQ=255) ggattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCt > 1:3872543‑M1/77‑140 (MQ=255) ggattcgaacctgcgaccccataactatgagtggtgtgctctaaccaactgcgctacgccgcccgattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCt > 2:1545136‑M1/77‑140 (MQ=255) tcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGc > 1:2853224‑M1/73‑140 (MQ=255) cgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCg > 1:5041677‑M1/72‑140 (MQ=255) gaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGa < 1:2044699‑M1/70‑1 (MQ=255) cctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATAc > 1:1700111‑M1/68‑140 (MQ=255) cctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATAc > 1:4499842‑M1/68‑140 (MQ=255) cctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATAc > 1:4819764‑M1/68‑140 (MQ=255) cctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATAc > 1:3035674‑M1/68‑140 (MQ=255) cctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATAc > 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tcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctaagtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACa > 2:1776101‑M1/56‑140 (MQ=255) attatgagtgatgtgcactaaccaactgagctaggtggcaagagtgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCACGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAAc > 2:1454019‑M1/54‑140 (MQ=255) tatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGc < 1:673010‑M1/89‑1 (MQ=255) atgtgtgatctgccctaatcatctgcgctaggcagactgattgtttcttcGATGGCTGGGTTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCt > 2:3712223‑M1/51‑140 (MQ=255) tgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCtt < 1:3423057‑M1/91‑1 (MQ=255) tgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCtt < 1:3422996‑M1/91‑1 (MQ=255) gagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCttt > 1:3496190‑M1/49‑140 (MQ=255) gagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagaccgatcgtttattcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCttt > 2:4377834‑M1/49‑140 (MQ=255) gtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTCCCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCt < 1:1714524‑M1/94‑1 (MQ=255) gtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCt < 2:424847‑M1/94‑1 (MQ=255) tgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCgg < 1:703344‑M1/52‑1 (MQ=255) tgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCgg > 2:703344‑M1/46‑97 (MQ=255) tgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTg < 1:4286969‑M1/95‑1 (MQ=255) tgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTg < 1:491961‑M1/95‑1 (MQ=255) tgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTg < 1:820960‑M1/95‑1 (MQ=255) ggatgtgctctaaccaactgacctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCCGGATTCGAACCAGGGCATGCCGGTATCAAAAACCGGTGACTTACCGATTGCCGATACCCCATCCGTACAACACTTTCTg < 2:4311648‑M1/95‑1 (MQ=255) atgtgctctaaccaactgagctacgtagctagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGt > 2:3643462‑M1/44‑140 (MQ=255) atgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGt < 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1:2247239‑M1/20‑140 (MQ=255) gtagccagatggtttcttcGATGGCTGGGGTACCGGGATTCGAACCAGGGAATGACGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTg > 1:2180096‑M1/20‑140 (MQ=255) gtagcaaggttgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAACCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTg > 2:296110‑M1/20‑140 (MQ=255) ggccagattgtttcttaGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGaa > 2:3025789‑M1/18‑140 (MQ=255) agccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGaa < 1:3850175‑M1/123‑1 (MQ=255) agccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGaa > 1:4990915‑M1/18‑140 (MQ=255) ccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACt < 1:2781673‑M1/125‑1 (MQ=255) ccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACt < 1:1590768‑M1/125‑1 (MQ=255) agattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCg > 1:4664127‑M1/14‑140 (MQ=255) ttgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGGATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGcac < 2:3531094‑M1/130‑1 (MQ=255) cGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCgg < 2:3460643‑M1/139‑1 (MQ=255) | ATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGG > NZ_CP025268/695820‑696049 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |