New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NZ_CP025268 | = 1553632 | 190 (0.630) | 10 (0.050) +ACGAAGAGGATAGTGTAGATCTCGGTGGTCGCCGTATCATTAAAAAA |
7/180 | 8.7 | 7.3% | coding (1413/3048 nt) | fdnG | formate dehydrogenase‑N subunit alpha |
? | NZ_CP025268 | 1553680 = | 198 (0.660) | coding (1461/3048 nt) | fdnG | formate dehydrogenase‑N subunit alpha | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
TGGCGATGATCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCTGATGAAATCTTTCTATGGCGATGCCGCGC > NZ_CP025268/1553493‑1553771 | tGGCGATGATCCAGTTGCTGCTCGGTATCATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGTGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCg > 2:3802542/1‑140 (MQ=255) tGGCGATGATCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCg > 1:4842198/1‑140 (MQ=255) tGGCGATGATCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCg > 2:500977/1‑140 (MQ=255) tGGCGATGATCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCg > 2:2577316/1‑140 (MQ=255) atgatCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCgacgga > 2:1510222/1‑135 (MQ=255) atgatCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCCGa > 2:5075897/1‑140 (MQ=255) atgatCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGa > 2:4454837/1‑140 (MQ=255) atgatCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGa > 1:3975836/1‑140 (MQ=255) atCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCTGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGaaaa > 2:2858899/1‑140 (MQ=255) atCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTCCCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGaaaa > 2:2341430/1‑140 (MQ=255) gctCGGTAACATGGGTATGGCCGGCGGCGGCGTGAACGCCTTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGCCTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTCAtt > 2:3619569/1‑140 (MQ=255) ctCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGCTGAttt > 2:331619/1‑140 (MQ=255) tCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTg < 1:2199999/140‑1 (MQ=255) tCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTg < 1:4500682/140‑1 (MQ=255) ggTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCa < 1:1975244/140‑1 (MQ=255) gTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAg < 1:1282463/140‑1 (MQ=255) gTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAg < 1:1042421/140‑1 (MQ=255) aaCATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTc < 2:2644959/140‑1 (MQ=255) aaCATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTc < 1:3333780/140‑1 (MQ=255) aaCATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTc < 1:1769395/140‑1 (MQ=255) aaCATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACAAGCCTGCCAGGGTATATGACGCGGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTc < 1:2636413/140‑1 (MQ=255) tGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTAt > 2:4925876/1‑140 (MQ=255) gggTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATc < 2:4693682/140‑1 (MQ=255) gggTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATc < 1:2259819/140‑1 (MQ=255) gggTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATc < 1:1157973/140‑1 (MQ=255) gTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTg > 2:3519804/1‑140 (MQ=255) aTGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTGTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGa > 2:4797911/1‑140 (MQ=255) aTGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGa > 2:1699033/1‑140 (MQ=255) tGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGaa < 1:893520/140‑1 (MQ=255) ccGGTGGCGGCGTGAACGCATTGAGTGGTCAATACACCATTCAGGGCTTGACTGACTTCGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCg < 1:5004807/140‑1 (MQ=255) ggTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGaa < 1:4888643/140‑1 (MQ=255) ggTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGaa < 1:4888676/140‑1 (MQ=255) gTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAac > 1:1089020/1‑140 (MQ=255) gTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAac > 2:5016542/1‑140 (MQ=255) gTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGAAGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGTAGTCGTATCTGGAAGCGAac > 2:1055592/1‑140 (MQ=255) tGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAGACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGaaga > 2:1300403/1‑138 (MQ=255) cgTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGa > 2:4047688/1‑140 (MQ=255) cgTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTGTATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGa > 2:3261960/1‑140 (MQ=255) gCATTGCGTGGCCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATATGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGAc < 2:2712236/140‑1 (MQ=255) ttGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACgct < 2:1007322/140‑1 (MQ=255) cGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACgctggc < 2:858628/140‑1 (MQ=255) tGGTCACTCCAACCTTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACgctggctg < 2:3796058/140‑1 (MQ=255) gTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCGGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTACCTGGAAGCGAACAAGCCGAAAGCGACGCTGGCTGAt > 2:1627197/1‑140 (MQ=255) gTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCGGTGGTAGCTGGAAGCGAACAGGCCGAAAGCGACGCTGGCTGAt > 2:4170146/1‑140 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ggCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAg < 1:751899/140‑1 (MQ=255) ttGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCaa > 2:2029511/1‑140 (MQ=255) tgactgacTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAAc > 2:4114255/1‑140 (MQ=255) gactgactTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAGAAGCAGGTTGATTTGCCGTCGTATGTGGAAGCGAACAAACCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACt > 2:2373857/1‑140 (MQ=255) actTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGACGAAAAAACAGGTGTATATGCCGGCGTAGCCGGAAGCGAACACAAAGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCg > 2:89022/1‑140 (MQ=255) ctTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGa < 1:118108/140‑1 (MQ=255) gCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAg > 2:897624/1‑120 (MQ=255) gCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCg > 2:731949/1‑140 (MQ=255) gCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCg < 1:3288910/140‑1 (MQ=255) gCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGACAAAAAAGCAGGTGGAGATGCAGGCGTACCTCGTAGCGAAAAAACCGAAAGCGACGCTGGCGGATCAGGTGACCTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCg > 2:4839611/1‑140 (MQ=255) ctctctACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAACCAGGTTGATTTCCCGTCGTACCCCGAAGCGAACACGCCCAAAGCGACGCTGGCTGCTCAGGCGAACTACTGGAGCAACTATCCGAACTTCTTCGt > 2:1005918/1‑140 (MQ=255) ctctctACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGt > 2:5210110/1‑140 (MQ=255) ctctctACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGACGGAGAGGCAGGTGGAGATGCAGTTGGTCGCGGAATCGAAAAAGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATAAGAAGTTcgtcgt > 2:4299674/1‑140 (MQ=255) tctctACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAgg < 1:5067054/105‑1 (MQ=255) tctctACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAgg > 2:5067054/1‑105 (MQ=255) tctctACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGtt > 2:297509/1‑140 (MQ=255) tACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGGTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAACGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGcc > 2:4664358/1‑140 (MQ=255) tACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCGAAAAAAATAGTGTATATCCAGGCGTACGCCGTAGCAAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAATGACTGGAGCAACTATCCGAAGTTGTTCGTTAGcc > 2:1949912/1‑140 (MQ=255) tACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCCGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGcc > 2:4249991/1‑140 (MQ=255) cAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCtga < 1:3540007/140‑1 (MQ=255) gCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAGACAGGTTGATTTGCAGTCGAATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGATGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCtgatg > 2:3101337/1‑140 (MQ=255) gCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCtgatg > 2:2129870/1‑140 (MQ=255) gCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTCCAGGCGTACCCCGAAGCGAAGACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCtgatg > 2:4991865/1‑140 (MQ=255) gCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGAGTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCtgatg > 2:3040978/1‑140 (MQ=255) gCCTGCCAGGGTATCTGACGCTGCCGTCAGAAACACAGGTTGAGTTGCAGTTGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCGGGCTGATCAGGTGAGCTAATGGACCAACTATCCTAACTTTTTCGTCAGCCtgatg > 2:226512/1‑140 (MQ=255) tGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAg > 2:1629598/1‑47 (MQ=255) tGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAg < 1:1629598/47‑1 (MQ=255) tGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGt > 2:1180006/1‑127 (MQ=255) tGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCTGATGaaa < 1:2489700/140‑1 (MQ=255) tGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCTGATGaaa < 2:2617512/140‑1 (MQ=255) tGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCTGATGaaa < 1:4569995/140‑1 (MQ=255) tGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGACGGAGAGGCAAGTTGAGATGTAGTTGTATGTGGTAGCGATAACGACGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCTGATGaaa > 2:1254252/1‑140 (MQ=255) ggCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGAGTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCTGATGaaa < 2:1397685/139‑1 (MQ=255) ccAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCTGATGAAATc > 2:2703366/1‑140 (MQ=255) ccAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGGCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGGGGGCTGGTCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCTGATGAAATc > 2:2455765/1‑140 (MQ=255) ccAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAAGTGGATTTGCAGTCGTATCTCGAAGCTAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACAGGAGCAACTATCCGAAATTCTTCGTTAGCCTGATGCAATc > 2:590783/1‑140 (MQ=255) gTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCTGATGAAATCTTTc < 1:3909361/140‑1 (MQ=255) tATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCTGATGAAATCTTTCTa < 1:3039032/140‑1 (MQ=255) cTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCTGATGAAATCTTTCTATgg < 2:3119546/140‑1 (MQ=255) cTGCCGTCAGAACAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCTGATGAAATCTTTCTATGGCGATGc < 1:1627207/140‑1 (MQ=255) gCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCTGATGAAATCTTTCTATGGCGATGCcg < 1:3343373/140‑1 (MQ=255) ccGTCAGAGAAACAGGTGGATTTGCAGTCGGATCTCGAAGCAAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCTGATGAAATCTTTCTATGGCGATGCcgc > 2:3547378/1‑140 (MQ=255) ccGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCTGATGAAATCTTTCTATGGCGATGCcgc > 2:682394/1‑140 (MQ=255) cGTCAGCAAAACAGGTTGATTTCCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTCGCTGATCAGGTGAACTACTAGAGCAACTATCCGAACTTCCTCGTTAGCCTGATGAAATCTTTCTATGGCGATGCcgcg < 2:554143/140‑1 (MQ=255) gTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCTGATGAAATCTTTCTATGGCGATGCCgcgc < 1:1331622/140‑1 (MQ=255) | TGGCGATGATCCAGTTGCTGCTCGGTAACATGGGTATGGCCGGTGGCGGCGTGAACGCATTGCGTGGTCACTCCAACATTCAGGGCTTGACTGACTTAGGCCTGCTCTCTACCAGCCTGCCAGGTTATCTGACGCTGCCGTCAGAAAAACAGGTTGATTTGCAGTCGTATCTGGAAGCGAACACGCCGAAAGCGACGCTGGCTGATCAGGTGAACTACTGGAGCAACTATCCGAAGTTCTTCGTTAGCCTGATGAAATCTTTCTATGGCGATGCCGCGC > NZ_CP025268/1553493‑1553771 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |