| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP025268 | = 3743324 | 0 (0.000) | 143 (0.480) | 55/272 | 1.9 | 100% | intergenic (‑100/‑82) | yiaJ/galK | IclR family transcriptional regulator YiaJ/galactokinase |
| ? | NZ_CP025268 | 3744556 = | 0 (0.000) | intergenic (+2/‑99) | galK/yiaK | galactokinase/3‑dehydro‑L‑gulonate 2‑dehydrogenase | |||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
GCTGTATCGTCGCGCTGATCCCGGAAGAGCTGGTGCCTGCCGTACAGCAAGCTGTCGCTGAACAATATGAAGCAAAAACAGGTATTAAAGAGACTTTTTACGTTTGTAAACCATCACAAGGAGCAGGACAGTGCTGACAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGCCTTTAAT > NZ_CP025268/3744418‑3744693 | tctcgttctctttttttcccatcacttctttccccattttgtggcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaatcgatttttatgtctttggaaattcatcaatcAg > 2:3495727‑M2/139‑140 (MQ=255) ttctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGc > 2:375154‑M2/134‑140 (MQ=255) tctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgacattcatcaatcAGATTGcc < 2:306434‑M2/8‑1 (MQ=255) tctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGcc < 1:3886608‑M2/8‑1 (MQ=255) tctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGcc < 1:273409‑M2/8‑1 (MQ=255) tctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGcc < 1:2569460‑M2/8‑1 (MQ=255) tctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGcc < 2:420743‑M2/8‑1 (MQ=255) tctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGcc < 1:1688417‑M2/8‑1 (MQ=255) tctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGcc < 1:3732944‑M2/8‑1 (MQ=255) tctctttgtttcccctcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgttgttcacgatctcgacagataatttataaccttttgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGcc < 2:1204587‑M2/8‑1 (MQ=255) tttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGt > 2:1315024‑M2/129‑140 (MQ=255) tttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTaaa < 2:1016475‑M2/16‑1 (MQ=255) atcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGa > 1:3832048‑M2/119‑140 (MQ=255) tcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt < 2:4046337‑M2/23‑1 (MQ=255) tcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt < 1:2112725‑M2/23‑1 (MQ=255) tcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt < 1:2830690‑M2/23‑1 (MQ=255) tcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt < 2:2820630‑M2/23‑1 (MQ=255) attttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgctttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGCTCGATATATTTGaaa > 2:3312452‑M2/104‑140 (MQ=255) attttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGaaa > 1:649955‑M2/104‑140 (MQ=255) attttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatgtttatgtcttttgaaattcatcaataAGATTCCCTTGTTAAAAATTGATCGATATATTTGaaa > 1:4041084‑M2/104‑140 (MQ=255) tttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAatg > 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1:4215665‑M2/82‑140 (MQ=255) gcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAAtt > 1:3192332‑M2/82‑140 (MQ=255) gcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAAtt > 2:3083021‑M2/82‑140 (MQ=255) gcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAAtt > 1:1642672‑M2/82‑140 (MQ=255) cgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGcc < 2:2365037‑M2/8‑1 (MQ=255) cgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGcc > 1:2365037‑M2/81‑88 (MQ=255) cgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAAttt > 1:1457406‑M2/81‑140 (MQ=255) cgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAAttt > 1:858152‑M2/81‑140 (MQ=255) ccaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGCTGTATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTa < 1:4537782‑M2/62‑1 (MQ=255) tgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCa > 2:431082‑M2/74‑140 (MQ=255) tgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCaaa > 1:1003319‑M2/72‑140 (MQ=255) tgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCaaa > 1:1003321‑M2/72‑140 (MQ=255) tgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGAATATTGAAATTTTAAGCCaaa > 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ttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGAt > 2:4599313‑M2/64‑140 (MQ=255) ttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGAt > 2:1215783‑M2/64‑140 (MQ=255) tcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATc < 2:2546050‑M2/78‑1 (MQ=255) cacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCa > 2:1161162‑M2/62‑140 (MQ=255) cacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttatgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCGAAAAAGCGATCa > 1:4438899‑M2/62‑140 (MQ=255) acgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAACAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCaa < 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2:731257‑M2/128‑1 (MQ=255) aattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAagc < 1:2847436‑M2/128‑1 (MQ=255) attcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATCTTGAAATTTTCAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAagca < 2:1439342‑M2/129‑1 (MQ=255) catcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGcc > 2:2413668‑M2/9‑140 (MQ=255) atcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGCCt > 1:4478953‑M2/8‑140 (MQ=255) tcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACACGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGCCtt > 2:474002‑M2/7‑140 (MQ=255) tcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGCCtt > 1:1741323‑M2/7‑140 (MQ=255) atcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGCCTTTaa > 1:820134‑M2/4‑140 (MQ=255) tcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGCCTTTAAt < 2:4617791‑M2/138‑1 (MQ=255) tcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGCCTTTAAt > 2:4167468‑M2/3‑140 (MQ=255) tcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGCCTTTAAt < 1:275199‑M2/138‑1 (MQ=255) tcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGCCTTTAAt < 2:2645392‑M2/138‑1 (MQ=255) | GCTGTATCGTCGCGCTGATCCCGGAAGAGCTGGTGCCTGCCGTACAGCAAGCTGTCGCTGAACAATATGAAGCAAAAACAGGTATTAAAGAGACTTTTTACGTTTGTAAACCATCACAAGGAGCAGGACAGTGCTGACAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGCCTTTAAT > NZ_CP025268/3744418‑3744693 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |