New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1287084 | 351 (0.830) | 57 (0.170) | 5/152 | 13.4 | 16.5% | noncoding (153/171 nt) | rttR | small RNA RttR |
? | NC_000913 | 1287557 = | 299 (0.900) | noncoding (66/85 nt) | tyrT | tRNA‑Tyr | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
TCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1286969‑1287084 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCC > NC_000913/1287557‑1287652 gGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGAT < 1:13710419/96‑1 CGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGAT < 1:6222956/97‑1 CGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGAT < 1:12130191/97‑1 CGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGGGAT > 1:1257252/1‑97 GAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATG < 1:20092859/97‑1 GAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATG > 1:2185605/1‑97 GAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATG > 1:19703015/1‑97 CGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGG > 1:20447066/1‑97 CGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGG < 1:15245254/97‑1 GAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGT > 1:10012415/1‑97 GAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGT > 1:14207822/1‑97 GAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGT < 1:17557215/97‑1 AACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTG > 1:20588411/1‑97 AACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTG < 1:5544699/97‑1 AACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTG < 1:3953468/97‑1 ACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGG < 1:7681504/97‑1 ACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGG > 1:1931810/1‑97 ACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGG > 1:11029829/1‑97 CCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGG < 1:16556976/97‑1 CCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGG > 1:20992894/1‑97 CTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGG > 1:16025984/1‑97 TTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGG < 1:1386482/97‑1 TAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGA < 1:4363887/97‑1 AGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTTAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGga > 1:13584684/1‑95 AGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAA > 1:5585328/1‑97 AGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAA > 1:10573474/1‑97 TCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGGAAGTGATGGTGGTGGGGGGAGG > 1:17008884/1‑97 TCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGG < 1:19363813/97‑1 CGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGA < 1:10644002/97‑1 atctCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAT < 1:18497532/93‑1 GAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGGAGGAT > 1:11200270/1‑97 GAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAT < 1:6584935/97‑1 GAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAT > 1:15997151/1‑97 AAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATT < 1:18392899/97‑1 AAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATT < 1:8489006/97‑1 AAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATT > 1:7753505/1‑97 AAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATT < 1:4248925/97‑1 TGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACG < 1:16285041/97‑1 ATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTT < 1:9092048/97‑1 ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGGTTTAC > 1:4486507/1‑97 AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTTGCCGCT‑Cc > 1:12859980/1‑96 AGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CG < 1:565142/97‑1 GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑Ccg > 1:8904730/1‑95 GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGG < 1:6835829/97‑1 GTTCAGGGACTTTCGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGG < 1:2745092/97‑1 TTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTTGCCGCT‑CGGG > 1:3700991/1‑97 TTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTTGCCGCT‑CCGG > 1:3456016/1‑97 AGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTTGCCGCT‑CCGGAAa > 1:5332889/1‑96 AGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCTCCGGGAA > 1:1889638/1‑97 AGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAAC < 1:19982181/97‑1 GGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTTGCCGCT‑CGGGAAac > 1:10138355/1‑95 ACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCA < 1:20251313/97‑1 ACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCA < 1:4701494/97‑1 TTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCCTTTGGCGCCC‑CGGGAACCCCcc > 1:2336894/1‑95 TTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACC < 1:12920280/97‑1 TTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACC < 1:9604378/97‑1 TTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGGACCCCACCc > 1:8723933/1‑96 TTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCA < 1:9542770/97‑1 GAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTTGCCGCC‑CCGGAACCCCACCcggg > 1:3286259/1‑93 ATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTTGCCGCTCCGGGAACCCC‑CCACCGGGGAATG > 1:19118385/1‑97 ATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATG < 1:17249724/97‑1 TGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGC < 1:18022651/97‑1 GTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTAGAGTCTGCT‑CCCTTTTGCCGCC‑CCGGGAACCCACCCCCGGGGAATGCTT > 1:2661142/1‑97 GTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTT < 1:4223854/97‑1 GTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTT < 1:8272424/97‑1 GTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTT < 1:11970685/97‑1 GTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTT < 1:15083599/97‑1 GTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTT < 1:2169633/97‑1 GTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTGCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTT < 1:10518043/97‑1 GGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTT < 1:9382887/97‑1 GGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTT < 1:20010226/97‑1 GTGGGGGAAGGTTTCGATCTTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTT < 1:12260973/97‑1 TGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTA < 1:7839090/97‑1 TGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGCCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGGAACCCACCACGGGGGAATTCCTTTTA > 1:16833971/1‑97 GGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGGT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCACACCACGGGGTAATGCTTTTTAC > 1:5944497/1‑97 GGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGGAATGCTTTTTAC > 1:1658904/1‑97 GGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGGAATGCCTTTTAC > 1:8162564/1‑97 GGGGAAGGATTCGACCCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACT < 1:2569654/97‑1 GGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACT < 1:9208113/97‑1 GGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACT > 1:20180214/1‑97 GGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCC‑CCCTTTGGCCGCC‑CGGGAAGCCCACCACGGGGTAAGGCTTTTTACT > 1:3090238/1‑97 GGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTG < 1:408665/97‑1 GGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTG < 1:7132053/97‑1 GGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCCCGGGGGAACGCTTTTTACTGG > 1:21079113/1‑97 GGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCCTTGGCCGCT‑CGGGAAGCCCACCACGGGGGAAAGCTTTTTACTtg > 1:19500429/1‑95 GAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCCCGGGGGAATGCTTTTTACTGGC > 1:14322902/1‑97 AAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCC < 1:7443826/97‑1 AAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCC > 1:9037419/1‑97 GGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTG < 1:18071909/97‑1 GGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGGAATGCTTTTTACTGGCCTG > 1:7214685/1‑97 GGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGGAATGCCTTTTCCTTGCCTG > 1:8070666/1‑97 GATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑TCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGGAATTGGTTTTACTCGCCCGC > 1:13418476/1‑97 GATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTtc > 1:6770666/1‑95 ATTCGAGCCTTCGAAGTCGATGACTGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCT < 1:17715980/97‑1 ATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCT > 1:14377441/1‑97 ATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCT < 1:14435536/97‑1 ATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCT < 1:5050588/97‑1 ATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGGAATGCTTTTTACTGGGCTGCT > 1:13740582/1‑97 TTCGACCCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTC < 1:19850016/97‑1 TCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCC < 1:11818446/97‑1 TCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1286969‑1287084 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCT‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCC > NC_000913/1287557‑1287652 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |