| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1287084 | 351 (0.830) | 57 (0.170) | 5/152 | 13.4 | 16.5% | noncoding (153/171 nt) | rttR | small RNA RttR |
| ? | NC_000913 | 1287557 = | 299 (0.900) | noncoding (66/85 nt) | tyrT | tRNA‑Tyr | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 402 total aligned reads displayed.
CGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCC > NC_000913/1287461‑1287653 | cGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTc > 1:17333915/1‑97 (MQ=255) gAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCg < 1:7369855/97‑1 (MQ=255) gAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCg > 1:7470413/1‑97 (MQ=255) aaGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGa > 1:4523984/1‑97 (MQ=255) aGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGaa < 1:11831370/97‑1 (MQ=255) ggTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAAc > 1:295878/1‑97 (MQ=255) gTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGGAGGATTCGAAcc > 1:19222406/1‑97 (MQ=255) ttCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCt < 1:20411240/97‑1 (MQ=255) ttCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCt < 1:13559505/97‑1 (MQ=255) ttCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCt > 1:2306884/1‑97 (MQ=255) tctcACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGGAGGATTCGAACCtt > 1:10971969/1‑97 (MQ=255) tctcACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCtt < 1:2860577/97‑1 (MQ=255) ctcACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTc < 1:4248792/97‑1 (MQ=255) ctcACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTc < 1:17427807/97‑1 (MQ=255) ctcACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTc < 1:3084399/97‑1 (MQ=255) tcACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCg < 1:15709968/97‑1 (MQ=255) tcACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCg < 1:18025865/97‑1 (MQ=255) cACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGa > 1:5919604/1‑97 (MQ=255) aCCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGaa < 1:8673661/97‑1 (MQ=255) aCCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGaa < 1:18249729/97‑1 (MQ=255) ccTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGt < 1:606965/97‑1 (MQ=255) cTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTc < 1:15148521/97‑1 (MQ=255) cTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTc < 1:16175628/97‑1 (MQ=255) ttCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCg < 1:4352352/97‑1 (MQ=255) cccGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATg > 1:8464361/1‑97 (MQ=255) ccGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGa < 1:16685261/97‑1 (MQ=255) gATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACg > 1:11255265/1‑97 (MQ=255) aTGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACgg > 1:15363289/1‑97 (MQ=255) aTGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACgg > 1:4004704/1‑97 (MQ=255) tGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGc < 1:508349/97‑1 (MQ=255) gTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGa < 1:1258616/97‑1 (MQ=255) gCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGGtt > 1:17775310/1‑97 (MQ=255) gCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGAtt < 1:14289411/97‑1 (MQ=255) aaCTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTAc < 1:1417305/97‑1 (MQ=255) aaCTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTAc < 1:14553407/97‑1 (MQ=255) aCTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACa < 1:11538814/97‑1 (MQ=255) cTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAg < 1:10040552/97‑1 (MQ=255) tttCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGGTTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGt > 1:8968965/1‑97 (MQ=255) tttCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGt < 1:15937615/97‑1 (MQ=255) ttCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTc > 1:3424879/1‑97 (MQ=255) aTCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGG‑T‑cc > 1:17151542/1‑97 (MQ=255) tctcACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑ccc > 1:20131692/1‑97 (MQ=255) tcACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCtt < 1:547272/97‑1 (MQ=255) tcACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCtt < 1:14085415/97‑1 (MQ=255) cACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCttt < 1:10870709/97‑1 (MQ=255) aCCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTg < 1:20256174/97‑1 (MQ=255) aCCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTg < 1:4940268/97‑1 (MQ=255) cGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGc < 1:9582202/97‑1 (MQ=255) gAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGG‑TCCCCTTTGGc > 1:7605914/1‑97 (MQ=255) gAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGcc < 1:13268554/97‑1 (MQ=255) gAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGAATTACAGTCTGC‑G‑CCCTTTGGcc > 1:13150069/1‑97 (MQ=255) aaGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGGTTTACACGCTGG‑G‑CCCTTTTGccc > 1:1897243/1‑96 (MQ=18) aaGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCg < 1:526826/97‑1 (MQ=255) aaGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCg < 1:4182711/97‑1 (MQ=255) tACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTGGCTGAGGGCCGGTTTACAGTCGGC‑C‑CCCTTTGGCCGccgg > 1:14418682/1‑94 (MQ=18) tACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGGCGCT‑Cg > 1:3539130/1‑97 (MQ=255) ccACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑Cggg < 1:13951750/97‑1 (MQ=255) cacaTCGCTGTGGTGAATTATGGTGGGGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGGTTTACAGGCTGCTT‑CCCTTTGG‑CGCT‑CGGGa > 1:14808698/1‑97 (MQ=17) caTCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAAc < 1:18665544/97‑1 (MQ=255) aTCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAAcc < 1:11089450/97‑1 (MQ=255) tCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAAccc < 1:19677314/97‑1 (MQ=255) cGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGGCTGG‑C‑CCCCTTGGCCGCT‑CGGGGAaccc > 1:5314529/1‑97 (MQ=14) cGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATGCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAAcccc < 1:11363678/97‑1 (MQ=255) tggtgAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCcaccac < 1:6627671/97‑1 (MQ=255) tggtgAATTATGGTGGGGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGGTTTACAGTCTGC‑T‑CCCCTTTGGCGCT‑CCGGGAACCcaccac > 1:6857395/1‑97 (MQ=14) ggtgAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACg > 1:5042959/1‑97 (MQ=255) ggtgAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGCCTGG‑T‑CCCTTTTGGCGCT‑CGGGGAACccaccccc > 1:40873/1‑94 (MQ=14) gtgAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACgg < 1:18476391/97‑1 (MQ=255) tgAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACggg < 1:8272500/97‑1 (MQ=40) aaTTATGTTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGt < 1:2112138/97‑1 (MQ=255) aaTTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGt < 1:7898905/97‑1 (MQ=40) agtATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTa < 1:310874/95‑1 (MQ=38) ttATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTTTGC‑T‑CCCTTTTGCCGCT‑CGGGGACCCCACCACCGGGGaa > 1:1030705/1‑97 (MQ=11) tATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAAt < 1:13644876/97‑1 (MQ=38) tATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAAt < 1:16402892/97‑1 (MQ=38) aTGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTTGCCGCTCCGGGAACCCC‑CCACCGGGGAATg > 1:19118385/1‑97 (MQ=11) aTGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATg < 1:19338578/97‑1 (MQ=38) aTGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATg < 1:7784127/97‑1 (MQ=38) ggtggtggGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGGAATGCt > 1:14343607/1‑97 (MQ=255) ttgggggggATGGATTCGAGCCTTCTAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCttt < 1:21016180/93‑1 (MQ=14) gtggGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGGAATGCttttt > 1:14987420/1‑97 (MQ=255) tggGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTa < 1:12132530/97‑1 (MQ=255) tggGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGGAATGCTTTTTa > 1:9415189/1‑97 (MQ=255) tggGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGCCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGGAACCCACCACGGGGGAATTCCTTTTa > 1:16833971/1‑97 (MQ=11) gggggAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTAc < 1:12070040/97‑1 (MQ=255) gggggAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGGAATGCTTTTTAc > 1:1658904/1‑97 (MQ=255) gggggAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGGAATGCCTTTTAc > 1:8162564/1‑97 (MQ=255) ggggAAGGATTCGACCCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACt < 1:2569654/97‑1 (MQ=255) ggggAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTTGCCGCT‑CGGGAAAACCAACACGGGGGAAAGCGTTTTaat > 1:5564487/1‑95 (MQ=11) ggggAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACt < 1:9208113/97‑1 (MQ=255) gggAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTg < 1:7132053/97‑1 (MQ=255) ggAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGGAATGCTTTTTAcctg > 1:17593137/1‑94 (MQ=255) gAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCCCCACGGGGGAATGCTTTTTACTGGc > 1:1951978/1‑97 (MQ=255) gAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGc < 1:9107859/97‑1 (MQ=255) gATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑TCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGGAATTGGTTTTACTCGCCCGc > 1:13418476/1‑97 (MQ=11) gATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGGAATGCTTTTTACTGGCCTGc > 1:2177468/1‑97 (MQ=255) aTTCGAGCCTTCGAAGTCGATGACTGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCt < 1:17715980/97‑1 (MQ=255) aTTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGGACCCCACCACGGGGGAATGCTTTTTACTGGCCTGCt > 1:1055690/1‑97 (MQ=255) cGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTccc < 1:6187376/97‑1 (MQ=255) cGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTccc > 1:19944513/1‑97 (MQ=255) | CGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGC‑T‑CCCTTTGGCCGCT‑CGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCC > NC_000913/1287461‑1287653 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |