| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,174,495 | IS1 (+) +9 bp | coding (64‑72/285 nt) | gatB ← | galactitol‑specific PTS enzyme IIB component |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1978503 = | NA (NA) | 954 (1.090) | 191/198 | 0.0 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 2174495 = | 0 (0.000) | coding (72/285 nt) | gatB | galactitol‑specific PTS enzyme IIB component | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | 979 (1.100) | 188/200 | 0.0 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 2174503 | 0 (0.000) | coding (64/285 nt) | gatB | galactitol‑specific PTS enzyme IIB component | |||||
Only 100 of 1941 total aligned reads displayed.
CAGTGGTGCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGA > NC_000913/2174395‑2174595 | cAGTGGTGCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAActct > 2:20432992/1‑101 (MQ=255) ggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccttt < 2:10909741‑M2/3‑1 (MQ=255) ggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccttt < 2:12114157‑M2/3‑1 (MQ=255) ggtgCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTaa < 2:1647402/101‑1 (MQ=255) ggtgCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTaa < 1:19366648/101‑1 (MQ=255) tgCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAAtt > 2:2204125/1‑101 (MQ=255) tgCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAAtt < 2:1331608/101‑1 (MQ=255) gCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAAttt < 1:10645423/101‑1 (MQ=255) tatCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCgg < 1:18185796‑M2/101‑3 (MQ=255) tatCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCgg > 1:17654148‑M2/1‑99 (MQ=255) gtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTcc < 2:18825528‑M2/13‑1 (MQ=255) aaaTGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgat > 2:13705613‑M2/1‑95 (MQ=255) gttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTccgcc < 1:4115960‑M2/16‑1 (MQ=255) gttctcaaaataggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTccgcc > 2:2984907‑M2/86‑101 (MQ=255) aaTGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatg < 1:842781‑M2/101‑8 (MQ=255) gCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctg > 2:12434809‑M2/1‑91 (MQ=255) cacCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgcca < 1:19765087‑M2/101‑14 (MQ=255) aaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCg > 2:6846621‑M2/79‑101 (MQ=255) atcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTa < 2:8743402‑M2/25‑1 (MQ=255) tcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTag < 1:13576917‑M2/26‑1 (MQ=255) tcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTag > 2:11815880‑M2/76‑101 (MQ=255) atccatATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaactt < 1:17349344‑M2/101‑18 (MQ=255) ggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTagag > 2:3719065‑M2/74‑101 (MQ=255) gtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAgg < 2:12992084‑M2/29‑1 (MQ=255) catATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttact < 1:11394883‑M2/101‑21 (MQ=255) ggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTc < 1:20218996‑M2/31‑1 (MQ=255) ggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTc < 2:15175191‑M2/31‑1 (MQ=255) ggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTc > 2:3329341‑M2/71‑101 (MQ=255) gagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCg < 2:4764812‑M2/32‑1 (MQ=255) taGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatt < 1:7514393‑M2/101‑25 (MQ=255) aGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgattt < 2:15578680‑M2/101‑26 (MQ=255) ggTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgattta < 2:16847487‑M2/101‑27 (MQ=255) ggTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgattta < 2:10302332‑M2/101‑27 (MQ=255) ctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCaa < 2:10557870‑M2/35‑1 (MQ=255) tttCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagt > 1:20383869‑M2/1‑73 (MQ=255) tCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgt < 2:11311184‑M2/101‑31 (MQ=255) atgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACcgc > 1:1105914‑M2/63‑101 (MQ=255) ttCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgat < 2:10064600‑M2/101‑36 (MQ=255) aaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTc < 2:963537‑M2/44‑1 (MQ=255) aaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTc < 2:17516701‑M2/44‑1 (MQ=255) tCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatg < 1:4924461‑M2/101‑37 (MQ=255) aagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTcc < 2:18077688‑M2/45‑1 (MQ=255) cATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatgg > 1:9103492‑M2/1‑64 (MQ=255) agtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCg > 1:10015375‑M2/56‑101 (MQ=255) tAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgt < 1:13971705‑M2/101‑41 (MQ=255) ggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGAc > 2:19998558‑M2/48‑101 (MQ=255) ggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGAc < 1:777040‑M2/54‑1 (MQ=255) acacTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgag > 2:14402403‑M2/1‑54 (MQ=255) acacTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgag < 2:8338727‑M2/101‑48 (MQ=255) cacTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgagg < 1:9741315‑M2/101‑49 (MQ=255) cacTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgagg > 1:12927810‑M2/1‑53 (MQ=255) attatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACaat > 1:14355127‑M2/45‑101 (MQ=255) attatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACaat > 2:5988838‑M2/45‑101 (MQ=255) ttatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACaata > 2:4518446‑M2/44‑101 (MQ=255) atctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACaataat < 2:6368752‑M2/60‑1 (MQ=255) 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aaTTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagt < 1:12591820‑M2/101‑58 (MQ=255) taaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGttt > 1:13331145‑M2/33‑101 (MQ=255) tCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggc < 1:17012702‑M2/101‑61 (MQ=255) aaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTc > 2:8023447‑M2/32‑101 (MQ=255) naacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCa > 1:12003457‑M2/31‑101 (MQ=255) aaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCa < 1:5645066‑M2/71‑1 (MQ=255) ggAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgt < 2:19498687‑M2/101‑67 (MQ=255) 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tCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgt > 1:12372391‑M2/1‑22 (MQ=255) ggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTAtt < 2:7294235‑M2/89‑1 (MQ=255) gagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTg < 1:10303665‑M2/90‑1 (MQ=255) tcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTa < 2:19117199‑M2/93‑1 (MQ=255) cacaACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctc < 1:7143199‑M2/101‑85 (MQ=255) caACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcct < 1:14811497‑M2/101‑87 (MQ=255) caACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcct < 1:19024142‑M2/101‑87 (MQ=255) caACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcct < 2:14129493‑M2/101‑87 (MQ=255) aaCTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctg < 2:16044723‑M2/101‑88 (MQ=255) aaCTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctg > 1:2470237‑M2/1‑14 (MQ=255) aaCTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctg < 1:5343584‑M2/101‑88 (MQ=255) aCTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgt < 1:3215642‑M2/101‑89 (MQ=255) accTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACagag > 1:15221135‑M2/4‑101 (MQ=255) accTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACagag > 1:8844234‑M2/4‑101 (MQ=255) tctTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttc > 2:18381164‑M2/1‑11 (MQ=255) ccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAgg > 1:6512420‑M2/3‑101 (MQ=255) ccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAgg > 1:8112097‑M2/3‑101 (MQ=255) | CAGTGGTGCATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGA > NC_000913/2174395‑2174595 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |