| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,174,495 | IS1 (+) +9 bp | coding (64‑72/285 nt) | gatB ← | galactitol‑specific PTS enzyme IIB component |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1978503 = | NA (NA) | 954 (1.090) | 191/198 | 0.0 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 2174495 = | 0 (0.000) | coding (72/285 nt) | gatB | galactitol‑specific PTS enzyme IIB component | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | 979 (1.100) | 188/200 | 0.0 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 2174503 | 0 (0.000) | coding (64/285 nt) | gatB | galactitol‑specific PTS enzyme IIB component | |||||
Only 100 of 1975 total aligned reads displayed.
CATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCG > NC_000913/2174403‑2174603 | cATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATttc > 2:12514381/1‑101 (MQ=255) gctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATttct > 2:6963917‑M2/92‑101 (MQ=255) gtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTcc > 2:11905981‑M2/89‑101 (MQ=255) gtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTcc > 1:14206835‑M2/89‑101 (MQ=255) cAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtga < 2:6049016‑M2/101‑6 (MQ=255) cAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtga > 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catccatATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaact > 1:10325110‑M2/1‑85 (MQ=255) cggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTaga > 1:16907511‑M2/75‑101 (MQ=255) ggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTagag > 2:17336634‑M2/74‑101 (MQ=255) ccatATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttac > 1:3706173‑M2/1‑82 (MQ=255) gtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAgg > 2:2609773‑M2/73‑101 (MQ=255) catATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttact > 1:5004189‑M2/1‑81 (MQ=255) ggTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgattta < 1:11961094‑M2/101‑27 (MQ=255) gcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCAACGTAGAGGTCGCAAcc < 2:3505219‑M2/37‑1 (MQ=255) ttCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtg < 2:3976198‑M2/101‑30 (MQ=255) tCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgt > 1:151593‑M2/1‑71 (MQ=255) tgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACcgcg < 1:16097310‑M2/40‑1 (MQ=255) tATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtat < 2:12249284‑M2/101‑33 (MQ=255) acaaagtcatctggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGcc < 1:4207966‑M2/42‑1 (MQ=255) tttCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga < 2:2046494‑M2/101‑35 (MQ=255) caaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCt > 1:13849884‑M2/59‑101 (MQ=255) aaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTc > 1:19184382‑M2/58‑101 (MQ=255) aaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTc < 2:14310623‑M2/44‑1 (MQ=255) agtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCg > 1:10015375‑M2/56‑101 (MQ=255) ttAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtg > 2:13952139‑M2/1‑62 (MQ=255) tAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgt > 2:8092956‑M2/1‑61 (MQ=255) catcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCaa < 1:1465595‑M2/49‑1 (MQ=255) atcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAg > 2:11387873‑M2/52‑101 (MQ=255) aaCCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtt > 1:12321064‑M2/1‑60 (MQ=255) aaCCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtt > 1:2210942‑M2/1‑60 (MQ=255) aaCCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtt < 2:20114814‑M2/101‑42 (MQ=255) cccGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttt > 1:4627020‑M2/1‑58 (MQ=255) cccGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttt > 2:19630389‑M2/1‑58 (MQ=255) ggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGAc < 1:17949683‑M2/54‑1 (MQ=255) ggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGAc > 2:1037767‑M2/48‑101 (MQ=255) gACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttga > 1:9389841‑M2/1‑55 (MQ=255) acacTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgag < 2:6507683‑M2/101‑48 (MQ=255) cacTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgagg > 1:7963525‑M2/1‑53 (MQ=255) cacTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgagg > 1:18317761‑M2/1‑53 (MQ=255) attatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACaat > 1:6142141‑M2/45‑101 (MQ=255) ttatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACaata > 2:19172706‑M2/44‑101 (MQ=255) ttatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACaata > 1:252809‑M2/44‑101 (MQ=255) acTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggt > 2:5353525‑M2/1‑52 (MQ=255) tatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACaataa < 2:4258202‑M2/59‑1 (MQ=255) atctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACaataat < 2:7326310‑M2/60‑1 (MQ=255) tctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATc < 1:826341‑M2/61‑1 (MQ=255) ctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCt < 1:13265886‑M2/62‑1 (MQ=255) ttAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctcca < 2:16564296‑M2/101‑56 (MQ=255) aacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGc > 1:20011153‑M2/37‑101 (MQ=255) aacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGc > 1:17602151‑M2/37‑101 (MQ=255) acataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCg < 2:963777‑M2/66‑1 (MQ=255) aaTTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagt < 1:12591820‑M2/101‑58 (MQ=255) aaTTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagt > 2:4629324‑M2/1‑44 (MQ=255) aaTTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagt > 2:13626699‑M2/1‑44 (MQ=255) aaTTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagt < 2:17018340‑M2/101‑58 (MQ=255) 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ttCggtgaggctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactg < 1:7690411‑M2/101‑99 (MQ=255) cttcCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCg > 1:15764388/1‑101 (MQ=255) cttcCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCg > 2:17709438/1‑101 (MQ=255) | CATATCAAATGCACACCATCCATATAGGTTTCTATTTCATTAACCCGACACTGGATTAATTCAACAGGAATATTATGATTCTGACACAACTCTTTAATTTCTTCCGCCGCCATCGTAGAGGTCGCAACCGCGCCTCCGCAAGCGACAATAATCTTGCGTTTCATAAATAGTCCTTTTTATTGTTACAGAGGGATTTATTCG > NC_000913/2174403‑2174603 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |