| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AM406671 | 778852 = | 1170 (0.970) | 30 (0.030) | 26/270 | 21.8 | 2.9% | intergenic (+11/+180) | rbsB/ps301 | ribose ABC transporter substrate binding protein RbsB/putative integrase |
| ? | AM406671 | = 820924 | 940 (0.850) | intergenic (+251/‑254) | ps358/llmg_0854 | conserved hypothetical protein/hypothetical protein predicted by Glimmer/Critica | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 265 total aligned reads displayed.
GGGGCAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AM406671/779012‑778852‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cctagcgacagagGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCAC < AM406671/820924‑820777 ggtGCAGAAAAAGCAGCAGAAATTTTACAATATTTAATTATCTTTTATAACTTTTACAAACACCATAACTACTAAACACGTTTATTTATCTAGCTGTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTTCC < 2:7590253/146‑1GGGGCAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACC > 2:3358547/1‑149 gtGCAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCC < 1:602376/147‑1 GGGCAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGTTAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTCGACAACTTTTAATAACAAAAGCTATTGTCTGATAATCTATATTAAACTACCC < 2:5707408/149‑1 GGGCAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCC < 2:9736052/149‑1 GGGCAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCC > 1:8455173/1‑149 GGGCAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCC > 1:8558110/1‑149 GGGCAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCC > 2:5158656/1‑149 GGGCAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCC > 1:3105554/1‑149 GGCAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCT > 1:6969914/1‑149 GGCAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCT > 2:8185644/1‑149 GGCAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCT > 1:125339/1‑149 GCAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTA > 2:4107597/1‑149 CAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAG < 2:1055177/149‑1 CAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAG > 2:2549626/1‑149 AGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGC > 1:8955082/1‑149 AGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGC > 1:3749245/1‑149 aAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCG < 2:9072311/148‑1 GAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCG < 2:6005435/149‑1 cAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTGAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTACTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACACAGGCTATTCTATGATAATCTGTGTTAAACTACCCTAGCGA > 2:3728488/2‑149 AAAAAGGGGCAGAAATTTGACACTATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTAACTAGCTTTTGATAACTATTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGA > 2:1686500/1‑149 AAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGA > 2:7453146/1‑149 AAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGA > 2:7353717/1‑149 AAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGA < 2:5391132/149‑1 AAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGA > 1:2700535/1‑149 AAAAGGTGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTTATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAGTTTATATTAAACTTCCCTAGCGcc < 2:4607660/149‑3 AAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGAC > 2:1010123/1‑149 AAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGAC < 1:5231617/149‑1 AAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGAC < 1:5932130/149‑1 AAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACA < 1:10220898/149‑1 AAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACA > 1:9240516/1‑149 AAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACA > 2:3197519/1‑149 AAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACA > 2:5579458/1‑149 AAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACA < 1:2546590/149‑1 AAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAG < 2:6160637/149‑1 AAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAG > 1:2253484/1‑149 AGGGGCCGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCCTTTGATAACTTTTAATAACAGAAGCTATTCTATGATAATCTATATGAAACTACCCTAGCGACAGA > 2:5101774/1‑149 GGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAG > 1:8765065/1‑149 GGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAG < 2:9522337/149‑1 TAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACAT > 2:6729234/1‑149 ATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTT > 1:8161022/1‑149 TTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTA > 1:916851/1‑149 ACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTT < 1:7804325/149‑1 CTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTT < 2:2973383/149‑1 AAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGAC > 2:8336566/1‑102 AAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGAC < 1:8336566/102‑1 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CTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACA < 1:9904002/149‑1 CTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACA < 2:5368216/149‑1 CTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACA < 1:3981406/149‑1 CTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACA < 1:7877707/149‑1 CTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACAAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACA > 1:7651196/1‑149 TAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAA > 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1:3558385/1‑149 GCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATC < 1:6108252/149‑1 GCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATC < 1:5015319/149‑1 CGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAGCATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAAGGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCT < 1:6723208/149‑1 CGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCT > 2:4039451/1‑149 CGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCT > 2:5044288/1‑149 GACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTG < 2:7696164/149‑1 GACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTG < 2:2815500/149‑1 ACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGC > 2:4345425/1‑149 CAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCA > 1:3211178/1‑149 CAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCA < 2:791700/149‑1 CAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCA > 1:4264504/1‑149 CAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCA < 1:4672819/149‑1 AGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAG > 1:3344918/1‑149 AGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAG > 2:6891025/1‑149 AGAGGTAAATACTTTAAAACTAACACTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAGCGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAG > 2:5739954/1‑149 GAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGC < 2:9566672/149‑1 GAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGC > 1:1108411/1‑149 AGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCA > 1:2824804/1‑149 AGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCA > 1:8884551/1‑149 AGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCA > 1:9884895/1‑149 AGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCA > 2:10220753/1‑149 AGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCA > 1:1691358/1‑149 AGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCA > 2:7170492/1‑149 AGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATAGTTCTTGCTAGACTAGAACCAGCGACCGAAAGGTTAGCTACCAAATGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCA > 2:647042/1‑149 GGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCAC < 1:4180345/149‑1 GGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCAC < 1:6412991/149‑1 GGGGCAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AM406671/779012‑778852‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cctagcgacagagGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCAC < AM406671/820924‑820777 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |